冯延芝
- 作品数：19 被引量：101H指数：6
- 供职机构：中国林业科学研究院更多>>
- 发文基金：国家林业公益性行业科研专项国家自然科学基金引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 适于转录组测序的枣不同器官总RNA提取方法筛选被引量：12
- 2015年
- 为获得适用于转录组测序的枣花、结果枝和果实的总RNA提取方法,以中秋酥脆枣为材料,比较分析了Ambiogen和Autolab 2种总RNA提取试剂盒和基于Autolab试剂盒改良的CTAB法的总RNA的提取效果。结果表明:3种方法提取RNA的OD260/OD280差别不大,但用2种试剂盒提取的RNA有降解,其中Ambiogen试剂盒提取的花、结果枝和果实3个器官的RNA质量浓度分别为126、284和222 ng/μL;Autolab试剂盒提取的RNA质量浓度分别为307、402和266 ng/μL;基于Autolab试剂盒改良的CTAB法提取的RNA质量浓度分别为401、417和296 ng/μL。与2种试剂盒相比,基于Autolab试剂盒改良的CTAB法提取出来的RNA完整性好、纯度和浓度高,能够满足转录组测序的要求。
- 魏琦琦冯延芝林青贾宝光张琳
- 关键词：转录组测序RNA提取
- 云南萝芙木pnae基因全长克隆及其序列分析被引量：4
- 2013年
- 根据已知的其他物种PNAE酶cDNA序列设计引物,采用RT-PCR技术从云南萝芙木叶片中扩增获得pnae基因部分cDNA序列即PNAE酶基因中间大片段,再用RACE技术获得其两端序列。序列拼接得到完整的1 004 bp的PNAE酶基因,根据获得的序列,分析得到795 bp的开放阅读框,编码264个氨基酸。序列分析显示,云南萝芙木中PNAE酶氨基酸序列与蛇根木中的该酶氨基酸序列同源性高达90%,但和其他植物物种中的PNAE酶氨基酸序列,以及其他物种间的PNAE酶氨基酸序列同源性都不高,在40%-60%之间,表明不同物种中PNAE酶氨基酸序列不具有全序列的高度同源性。进一步序列分析发现,在各植物的PNAE酶氨基酸序列中都存在两个高度保守的氨基酸区域,表明不同物种中PNAE酶存在共同的高度保守区段。
- 郭川曹福祥刘继科冯延芝李猛
- 关键词：RACE
- 杜仲种仁转录组测序及FAD3基因的鉴定与功能研究
- 杜仲（Eucommia ulmoides Oliv.）为单科单属单种植物，是我国特有的重要经济树种和名贵的药用植物。杜仲适应性强，且广泛分布于我国北纬27°-42°间的27个省市。杜仲种子的含油率为30%左右，其籽油中含...
- 冯延芝
- 关键词：转录组测序亚细胞定位
- 基于RNA-Seq的杜仲转录组微卫星特征分析被引量：2
- 2016年
- 对杜仲(Eucommia ulmoides)国审良种‘华仲6号’和‘华仲10号’花后70和160d的种仁共4个样本进行转录组测序,对测序数据进行组装和功能注释分类,并对转录组获得的单基因簇(unigene)进行微卫星特征分析。利用新一代高通量测序技术Illumina HiSeq^(TM)2000对杜仲样品进行转录组测序,采用软件Trinity进行组装;利用BLAST软件将unigene序列分别与Nr、GO、COG和KEGG等数据库比对分析;利用MISA软件对转录组的96 469条unigenes进行SSR搜索。结果表明:转录组测序分析,共得到72 791 399个高质量的序列读取片段(Clean reads),包含了14 702 548 161个的碱基序列(bp)信息。对reads进行序列组装,共获得96 469个平均长度为690bp的unigene,序列信息量达到了66.56 Mb。同源性分析结果显示,有49 856个与其它物种同源的unigenes得到注释,占All-unigene的51.68%。将杜仲转录组中的unigene与GO数据库进行比对分析,根据其功能可将注释到的38 983条unigene分成3大类(细胞组分、分子功能和生物学过程)56个分支;根据COG功能可将注释的14 796条unigene基因划分成25个类别;KEGG数据库作为参照,可将注释到的11 260条unigene定位到117个代谢途径分支;SSR位点搜索结果显示,96 469条unigenes中共包含9 621个完整型SSR位点,占总SSR位点的84.14%。完整型SSR位点共包含55种重复基元,其中出现频率最高的重复基序类型为单核苷酸重复中的A/T(4 597个),其次是AG/CT(2 597个)、AT/AT(439个)。
- 冯延芝李芳东魏琦琦莫文娟王璐黄地歌傅建敏
- 关键词：转录组转录组测序SSR
- 枣蔗糖合成酶基因SS6的克隆及表达分析被引量：7
- 2017年
- 蔗糖合成酶是蔗糖代谢的关键酶之一,它在调控果实品质和产量方面均有重大意义。为了探究ZjSS6基因在枣蔗糖合成代谢途径中的功能,文中基于枣的转录组测序数据,以中秋酥脆枣为试验材料,利用RACE技术克隆了枣SS6基因的全长cDNA序列,编码区长度为2 553 bp,编码850个氨基酸;该蛋白质的分子量为96.67 kDa,理论等电点为7.57。蛋白结构预测发现,该基因编码的蛋白含有蔗糖合成酶和糖基转移酶两个结构域。多序列比对和系统进化分析结果均表明,枣SS6与桑SS6的亲缘关系最近,其次是梅。实时荧光定量PCR表达分析结果显示,ZjSS6基因在枣各组织器官(果实、枣花、枣吊、叶片和根)中均有表达,其在幼果期枣果中的表达量最高,其次是绿果期枣果和枣吊,而在果实发育过程中其表达量呈整体下降趋势。
- 冯延芝冯延芝何潇何潇赵广赵广
- 关键词：蔗糖合成酶基因克隆
- 南方低山丘陵区泡桐无性系主要性状的综合选择被引量：9
- 2017年
- [目的]为了选育出适宜南方低山丘陵区栽植的白花泡桐优良无性系。[方法]以湖北省赤壁市5年生的18个泡桐无性系为研究对象,对其4个生长性状(胸径、主干高、总材积、接干高)和2个干形性状(主干削度、形数)进行变异分析、遗传参数估算、性状间的相关性分析以及多性状综合评价。[结果]结果表明:各性状在无性系间的差异均达到极显著水平。胸径、主干高、总材积、接干高和形数的重复力较大,均在0.785 8以上,主干削度的重复力较小(0.516 3)。胸径、主干高、总材积和接干高之间均呈极显著的表型和遗传正相关关系;除与主干高、接干高分别呈不显著和显著的表型负相关外,主干削度与其它性状间的表型和遗传负相关关系均达极显著水平;除与主干高呈不显著的表型正相关外,形数与其它性状间的表型和遗传相关关系均达极显著水平;通过多性状选择指数方程选择出的3个优良无性系与CK相比,其胸径、主干高、总材积、接干高、主干削度和形数的遗传增益分别为13.33%、6.59%、28.68%、40.08%、12.99%和8.89%,实际增益分别为13.82%、7.55%、32.04%、43.31%、25.16%和11.31%。[结论]依据建立的多性状指数方程,选择出适宜在南方低山丘陵区栽植的白花泡桐优良无性系3个,分别为01-23、01-22和1-58,入选率17%。
- 冯延芝冯延芝乔杰王保平赵阳周海江段伟
- 关键词：泡桐无性系表型变异
- 亚热带低山丘陵区桐茶复合经营对茶叶品质的影响被引量：1
- 2023年
- 在亚热带低山丘陵区,选择667、500、400和333株/hm^(2)等4种密度的泡桐林分林下间作的茶树为研究对象,单作茶园为对照,研究不同桐茶间作模式对茶叶品质的影响。结果表明:泡桐林分密度不同,对间作茶叶品质产生的影响也不尽相同。与对照相比,桐茶间作可显著提升茶鲜叶含水量,且增幅随林分密度增大而增加;高林分密度的3种间作模式可显著提升茶叶水浸出物、咖啡碱、茶多酚含量以及酚氨比;除最高林分密度间作模式外,其余模式均可显著提升中抗坏血酸含量;各间作模式游离氨基酸含量与对照无显著差异;对各模式茶叶品质综合分析,结果显示500株/hm^(2)林分密度间作茶叶品质最高。正交偏最小二乘法-判别分析同样证实了不同模式间茶叶品质的差异,并筛选出抗坏血酸、水浸出物和茶多酚是标志性差异成分。研究结果可为今后系统开展该区域桐茶复合经营模式优化提供参考。
- 赵阳杨超伟杨超伟乔杰冯延芝周海江
- 关键词：林分密度茶叶品质
- 干旱复水对楸叶泡桐幼苗光合和叶绿素荧光的影响被引量：24
- 2020年
- 【目的】探究在干旱胁迫和复水过程中楸叶泡桐幼苗对光合和叶绿素荧光的生理响应。【方法】本研究以楸叶泡桐幼苗为材料进行盆栽控水试验,以田间持水量的85.00%为对照,测定分析幼苗叶片在干旱胁迫后不同时间和复水后的相对含水量、细胞膜相对透性、光合和叶绿素荧光等的动态变化。【结果】在干旱胁迫后的第4、8、12、16天时,土壤含水量从田间持水量(FC)的85%(对照)分别下降到60.37%、35.96%、23.78%和11.01%;随着干旱胁迫程度的不断增加,叶片的相对含水量(RWC)、蒸腾速率(Tr)、净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、胞间CO2浓度(Ci)、最大光化学效率(Fv/Fm)、实际光化学量子效率(ΦPSⅡ)、电子传递速率(ETR)和光化学猝灭系数(qp)均逐渐降低,除干旱胁迫第4天的Tr、Pn、Ci、ΦPSⅡ和ETR外,其它胁迫时期的参数与对照相比均差异显著(P<0.05);随着干旱胁迫程度的不断增加,细胞膜相对透性(RMP)、水分利用效率(WUE)、气孔限制值(Ls)、最小初始荧光(F0)和非光化学猝灭系数(NPQ)均逐渐升高,除干旱胁迫第4天的WUE、Ls和NPQ外,其它胁迫时期的参数与对照相比均差异显著(P<0.05);复水4 d后各指标均得以恢复,且与胁迫第4天相比差异均不显著。【结论】研究表明当土壤含水量低于田间持水量的11.01%时,楸叶泡桐幼苗的叶片干枯脱落,严重影响其正常生长;短期干旱胁迫条件下Ci降低、Ls升高,说明Pn的降低主要是气孔因素导致的。
- 冯延芝冯延芝王保平赵阳周海江王保平乔杰
- 关键词：楸叶泡桐干旱胁迫复水叶绿素荧光
- 基质金属蛋白酶-7的基因克隆和原核表达
- 2013年
- 研究构建人基质金属蛋白酶7(MMP-7)的原核表达载体,并进行原核表达获得重组蛋白MMP-7。以人肾肿瘤组织总RNA为模板,PCR方法获得MMP-7成熟蛋白的基因序列,构建含10xhis标签的原核表达载体,转化大肠杆菌BL21(DE3),并经异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)诱导表达,获得重组蛋白,并经十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),检测其表达情况。最终得到pET24a(+)-MMP-7-10his重组质粒,诱导表达后重组蛋白占总蛋白的41%左右,获得21.2kD大小蛋白,与目的蛋白大小一致,纯度大于90%,为进一步研究奠定基础。
- 刘继科曹福祥郭川彭继庆冯延芝
- 关键词：基质金属蛋白酶-7基因克隆原核表达
- 菲油果LEAFY基因的表达模式及启动子克隆被引量：4
- 2014年
- LEAFY(简称LFY)是植物花分生组织特征基因,在植物由营养生长向生殖生长转变过程中起着重要作用,是启动开花的枢纽。菲油果是一种新兴的果树资源,为研究菲油果LFY基因(FsLFY)的表达调控规律,本研究通过实时荧光定量PCR技术研究了FsLFY基因的时空表达模式,并通过染色体步移技术克隆了该基因的启动子序列。荧光定量PCR结果表明,FsLFY基因在菲油果花蕾不同发育阶段以及其他组织器官中均有表达。在花蕾中,小蕾期最高,中蕾期最低;组织器官中,营养枝茎段最高,花瓣最低。FsLFY基因启动子序列长度为2436 bp(GenBank登录号:KF766536),运用PLACE、PlantCARE等在线软件对其序列进行顺式作用元件分析,结果显示该序列不仅含有CAAT-box、TATA-box等核心启动子元件,而且还具有响应水分、光、赤霉素(GA)以及其他功能未知的顺式调控元件,表明FsLFY基因的表达受多种外界环境条件的调控。本研究为阐明菲油果的开花机理,以及通过分子育种手段使菲油果早花早果奠定了理论基础。
- 冯延芝张琳袁德义龙洪旭刘敏张日清陈圣林
- 关键词：菲油果实时荧光定量PCR启动子
