邹丽容
- 作品数:78 被引量:449H指数:12
- 供职机构:广东省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:广东省科技计划工业攻关项目广东省医学科学技术研究基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学农业科学更多>>
- 特异结合人禽流感病毒H5N1的scFv分子生物学活性性能鉴定
- 目的从人源化噬菌体抗体库(Human Single Fold scFv Libraries I+J)中筛选到能高亲和性、特异结合人禽流感病毒H5N1的单链抗体,为建立H5N1快速筛查试剂和人源化治疗单抗奠定基础。方法以H...
- 武婕柯昌文李晖陈秋霞周杰张欣邹丽容
- 关键词:噬菌体文库
- 文献传递
- 贝类海产品中诺如病毒快速检测方法研究被引量:13
- 2006年
- 目的:寻找和建立贝类产品中诺如病毒的敏感特异的快速检测方法。方法:通过对报道的3种贝类中病毒提取方法的提取效率进行比较,确定最终的提取方法。设计特异性和敏感性相对较高的套式PCR方法进行病毒检测,检测结果经核酸序列测定证实。结果:3种方法中用PBS-三氯三氟乙烷-PEG处理回收率较高。设计的套式PCR方法可成功检测到病毒,其敏感性可比单轮PCR高100倍。结论:该研究建立了敏感特异的诺如病毒检测方法。
- 李晖黄吉成方苓严纪文邹丽容陈秋霞黄平
- 关键词:贝类诺如病毒套式PCR
- 用RT-PCR法鉴定人冠状病毒SARS、229E和OC43被引量:1
- 2006年
- 目的:建立两种简单、快速和特异性的RT-PCR法鉴定SARS-HCoV、HCoV-229E和HCoV-OC43。方法:用DNA Star和Prem ier 5.0软件设计SARS-HCoV、HCoV-229E和HCoV-OC43及其它冠状病毒针对保守区Pol1b基因的一对通用引物和分别针对M基因的3对引物,然后通过对扩增片断测序、限制性酶切方法和根据扩增片断的长度进行鉴定。结果:两种方法均能扩增到与预期目标一致的片断,特异性和灵敏度高,能快速区分3种病毒。结论:这些方法将为了解冠状病毒在呼吸道感染中的作用提供一个有利的工具。
- 邹丽容李晖柯昌文黄平
- 关键词:逆转录聚合酶链式反应
- 广东地区人禽流感H_5N_1血凝素基因特征与进化被引量:11
- 2007年
- 目的通过对广东地区人禽流感H5N1毒株(HA)基因序列的变异分析,揭示毒株HA基因变异与进化。方法对广东地区人禽流感H5N1毒株(A/GD/01/06)HA基因测序,同时检索全球各地人禽流感H5N1毒株HA基因,采用SPSS11.0和DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株HA基因核苷酸序列进行聚类、比对和分析;并结合临床资料对变异毒株进行进化速度分析。结果1997~2006年,42毒株HA基因序列聚类分成3类;HA基因89氨基酸位点置换,占15.7%(89/568);2003~2006年H5N1,毒株通过氨基酸第170~172位(NST/S)位点的置换,增加一个糖基化位点。同义变异中,HA基因Ks为1.99×10^-5~2.58×10^-5,生物进化线性回归方程为Y=4.8×10^-9X+1.048×10^-5;同时各毒株Ks均大于Ka,进化检验Ks/Ka值显示HA基因进化压力主要来自自然变异。42株地N1毒株可以分3条进化途径,1997-1998年毒株为1条,2003~2005年东南亚毒株为第2条途径,2005~2006年中国毒株为第3条途径。毒株HK-213-03氨基酸变异显示其变异的进化过度性,而2004年毒株TL—L2004—04氨基酸位点变异值得注意。结论2003--2006年人禽流感H5N1毒株HA基因抗原性与1997年毒株有较大不同,人禽流感H5N1,毒株增加一个糖蛋白位点可能改变毒株致病性;少数毒株氨基酸位点变异较大,值得关注。人禽流感H5N1毒株在自然界变异频繁,但受到鸟禽和人体的免疫压力较小;但随着H5N1,毒株自然进化,H5N1,毒株具有人一人传播能力的概率较大。建议在研制人禽流感H5N1毒株疫苗时,要充分考虑不同毒株HA基因抗原性。
- 黄平柯昌文邹丽容李晖陈秋霞
- 关键词:人禽流感H5N1毒株进化
- 广东省2例城市型人感染高致病性禽流感(H5N1)病例的流行病学调查被引量:13
- 2007年
- 目的通过对2例城市人禽流感病例的流行病学调查、分析,探讨无直接病死禽暴露情况下的可能感染来源,为进一步防控禽流感提供科学依据。方法采用现场流行病学、血清学调查的方法;荧光定量PCR、ELISA、RT-PCR和应急监测等方法进行调查、诊断。结果2例感染高致病性禽流感病毒(H5N1)确诊病例未发现有明确病死禽接触史,但发病前到过甚至多次到过农贸市场;密切接触者中没有发生不明原因肺炎病例,未发现人—人传播证据。结论2例人感染高致病性禽流感病例均属城市型感染个案,非人传人病例,感染来源可能与农贸市场环境有关。
- 吴德李晖康敏邹丽容王玉林胡明霞张顺祥卢秀萍马汉武刘于飞邓爱萍何剑峰。,柯昌文',罗会明·,林锦炎·X何剑峰柯昌文罗会明林锦炎
- 关键词:人禽流感流行病学
- 应用Taq Man荧光定量RT-PCR快速检测肠道病毒的研究被引量:5
- 2008年
- 目的建立一种快速、灵敏、特异的荧光定量RT-PCR检测肠道病毒的方法。方法根据GenBank中肠道病毒5′UTR序列,应用生物软件在保守区设计与筛选特异引物和TaqMan探针,对荧光定量RT-PCR反应体系与条件进行优化,验证方法的特异性、敏感性和重复性。并通过对急性临床样本的检测,评价该方法的实际应用价值。结果该方法对肠道病毒包括脊髓灰质炎病毒Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型及柯萨奇病毒和埃可病毒等的检测有高度特异性,甲肝病毒、乙脑病毒、登革病毒、腺病毒、单纯疱疹病毒、诺如病毒等均呈阴性。该方法的检测下限达10-1TCID50/100μl。12份急性结膜炎病例结膜拭子标本中7份肠道病毒核酸阳性,普通RT-PCR方法5份阳性。结论TaqMan荧光定量RT-PCR方法快速、敏感、特异,适于肠道病毒的快速检测。
- 陈秋霞吴德李晖莫艳玲邹丽容方苓黄平柯昌文
- 关键词:肠道病毒荧光定量RT-PCRTAQMAN探针
- 2004年SARS-CoV毒株S基因分子进化特征被引量:10
- 2006年
- 目的通过对2004年SARS-CoV毒株S基因序列的变异分析,揭示SARS-CoV毒株S基因进化与SARS流行的关系。方法对广东地区2004年2株SARS-CoV毒株S基因进行序列分析,其余15株毒株S基因序列从GenBank检索,采用DNAStar5.0软件,对检索的SARS-CoV的S基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合临床资料对变异毒株进行进化速度分析。结果17株毒株中,S基因7个氨基酸位点全部置换,35个氨基酸位点在不同毒株中置换;所有SARS-CoV均通过氨基酸227位点的置换,增加一个糖基化位点。同义进化中,S基因置换速度为1.46×10-6个核苷酸,进化线性回归方程为Y=1.46×10-6X+0.000736,同时通过Ka计算显示S基因进化明显存在选择性压力。2004年17株SARS-CoV毒株可以分为两条进化途径,其中广东地区的人类的GZ0401毒株与果子狸的PC4-115毒株核苷酸同源性达到99.97%,氨基酸同源性为100%。结论冠状病毒S基因的1个糖蛋白位点增加,可能导致人类SARS-CoV毒株出现并SARS流行;2004年果子狸冠状病毒与人类SARS-CoV毒株分子结构类似,可能存在交叉宿主。S基因同义进化速度较流感HA1基因慢4.2倍,但基因进化明显存在选择性压力。
- 黄平宋怀东邹丽容李晖俞守义
- 关键词:严重急性呼吸综合征S基因进化
- 特异结合人禽流感病毒H5N1的scFv分子性能鉴定
- 2011年
- 目的从人源化噬菌体抗体库(human single fold scFv libraries I+J)中筛选到能高亲和性、特异结合人禽流感病毒H5N1的单链抗体,为建立H5N1快速筛查试剂和人源化治疗单抗奠定基础。方法以H5N1病毒的血凝素(hemagglutitin,HA)蛋白和核蛋白(nucleoprotein,NP)为目的蛋白,对上述单抗噬菌体文库以亲和性为原理进行筛选,经过3轮筛选富集后,随机挑选了96个噬菌体克隆扩增培养,ELISA法挑选能特异性、高亲和性结合目的蛋白的噬菌体克隆,并换用HB2151宿主菌对阳性单链抗体克隆进行可溶性表达,ELISA法鉴定可溶性单链抗体的结合活性,PCR扩增阳性克隆的轻、重链基因片段,并对阳性单链抗体分子测序和序列分析。结果经过3轮筛选,分别从96个噬菌体克隆中挑选到了两株能特异结合NP蛋白、3株能特异结合HA蛋白的单链抗体,PCR扩增都得到了长为300、302和935bp的轻链、重链和轻链-连接片段-重链的基因片段,测序结果分析发现上述5条单链抗体片段在轻链的47、49、50、51、53、54、56、96、97、98和99位的氨基酸组成不同,而特异结合NP蛋白的单链在重链区域氨基酸组成完全相同,而特异结合HA蛋白的单链在重链的44、47、85、86、87、88和89位氨基酸组成不同。结论从噬菌体抗体库中筛选到的特异结合HA和NP蛋白的单链抗体片段,可为进一步研发H5N1快速筛选试剂和人源性治疗抗体奠定基础,也可为鉴定HA和NP蛋白中的抗原决定簇提供结构信息。
- 武婕张宏斌柯昌文陈秋霞李晖周杰黄吉城张欣邹丽容
- 关键词:噬菌体文库
- 新型冠状病毒南非B.1.351变异株的分离与分子特征分析被引量:2
- 2021年
- 2020年12月广州市第八人民医院收治了1例南非输入性COVID-19病例,经检测为SARS-CoV-2核酸阳性的实验室确诊病例。本研究使用Vero-E6细胞,对该病例咽拭子样本进行病毒分离,逐日观察,咽拭子接种的细胞管3d开始出现细胞融合样细胞病变(Cytopathic effect,CPE),5d出现完全CPE后再进行第二代接种,2d出现病变,提取核酸进行鉴定,为SARS-CoV-2阳性。第2代复传的SARS-CoV-2病毒株TCID50测定结果为5.5log TCID50/0.1mL~5.8log TCID50/0.1mL。对分离毒株经采用三代测序成功获得全基因组序列,进化分析结果为与参考毒株Wuhan/Hu-1/2019相比共发生30个碱基的变异、18个氨基酸的突变和18个碱基的缺失,比对结果显示分离到的毒株为SARS-CoV-2南非B.1.351变异株。
- 郑焕英张欢陆靖欧阳方竹邹丽容胡瑶李振翠黎薇李柏生何剑锋柯昌文邓小玲
- 关键词:病毒分离VERO-E6细胞全基因组序列
- 2013-2017年广州市住院儿童呼吸道合胞病毒流行特征及分子生物学分析被引量:20
- 2020年
- 目的分析广州人呼吸道合胞病毒(HRSV)的流行特征及遗传变异特征。方法2013—2017年在广州两家哨点医院(广东省妇幼保健院和中山大学孙逸仙纪念医院)采集0~6岁急性呼吸道感染住院儿童的鼻咽拭子作为标本。采用逆转录PCR和巢式PCR方法进行HRSV的检测和分型,通过MEGA 6.0、NetNGlyc 1.0等软件对HRSV序列进行基因亲缘性分析以及N?糖基化位点的预测。结果共收集鼻咽试子标本1225份,其中男性783份,女性442份;月龄M(P25,P75)为8(3,24)月。共检出HRSV儿童感染者209例(17.06%),其中HRSV?A为117例(55.98%),HRSV?B为92例(44.02%)。2岁以下儿童HRSV检出率为18.83%(196例),占总阳性标本的93.78%。209例检出HRSV儿童中,32例(15.31%)还感染了至少1种其他呼吸道病毒。进化树分析显示,62株HRSV?A属于ON1基因型,2株属于NA1基因型,53株HRSV?B全部属于BA基因型。G蛋白的第二高变区在氨基酸替换,终止密码子的使用以及糖基化位点方面均具有多态性。结论广州2岁以下儿童是感染HRSV的高发人群,ON1为HRSV?A主导基因型,BA为HRSV?B的主导基因型。多样化的氨基酸替换,某些糖基化位点的缺失与插入,体现了G蛋白作为主要保护性抗原的多样性。
- 邹丽容李振翠钟志锋梁丽君宋颖超武婕
- 关键词:流行病学基因型