吕粤
- 作品数:21 被引量:67H指数:4
- 供职机构:云南省动物疫病预防控制中心更多>>
- 发文基金:云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目公益性行业(农业)科研专项云南省科技攻关计划更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生更多>>
- 云南2008~2009年H9N2亚型禽流感病毒血凝素和神经氨酸酶基因序列分析被引量:4
- 2011年
- 禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)是病毒粒子表面抗原,是亚型划分的重要依据。从云南分离的H9N2亚型禽流感病毒感染鸡胚尿囊液中提取总RNA,采用特异性引物经RT-PCR分别扩增云南毒株10个HA和9个NA基因,纯化后克隆至pMD18-T载体,并对其进行测序。序列比对及系统发育分析结果表明:云南H9N2毒株HA基因核苷酸序列同源性为95.0%~99.7%;NA基因核苷酸序列同源性为86.2%~99.6%。在进化分枝中HA基因均属于欧亚分枝的类CBJ194亚分枝,与CBJ194的核苷酸序列同源性为92.0%~99.1%,NA基因属于CK/BJ/1/94和QaHKG1/97两个分枝。云南毒株HA裂解位点结构具有低致病性病毒分子特征;HA受体结合位点143、145、198和234位氨基酸存在变异,尤其234位氨基酸全部变为L,呈现了人流感受体结合特性。NA糖基化位点61~63、86~88部分毒株存在缺失,部分毒株在143~145位出现新的糖基化位点。
- 宋建领叶丛华田建国张文东赵焕云吕粤岳亮邱薇刘加茂冯子良张思东范泉水张应国张富强
- 关键词:禽流感病毒H9N2亚型血凝素神经氨酸酶
- 云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因进化特征分析被引量:4
- 2009年
- 目的:认识2003年~2008年期间云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素(HA)基因的进化特征。方法:2003年~2008年期间在云南边境采集境外禽类样品380份,经H5/N1亚型特异性多重RT-PCR检测,对阳性样品中H5N1病毒HA基因进行RT-PCR扩增,克隆至pMD18-T载体测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及系统发育分析。结果:多重RT-PCR检出18份阳性样品,阳性率4.74%;14份代表性病毒样品HA基因核苷酸和氨基酸序列同源性介于93.1%~99.3%、90.5%~99.1%;HA裂解位点序列存在4种不同排列方式,均具有高致病性禽流感病毒分子结构特征;系统发育分析表明阳性样品可划分为5个不同进化分枝(1、2.4、2.3.2、2.3.4、7)。结论:2003年~2008年期间云南边境境外H5N1亚型病毒间具有遗传差异,进化分枝2.3.4毒株已成为当地流行的优势毒株。
- 叶丛华张文东宋建领李静田建国吕粤岳亮邱薇李刚山冯子良郑颖张思东范泉水张应国王双印张富强
- 关键词:禽流感病毒H5N1亚型血凝素进化特征
- 云南省种公猪精液中乙型脑炎病毒的监测
- 2012年
- 应用RT-PCR技术开展云南省种公猪精液中乙型脑炎病毒(JEV)感染监测,进而对阳性样品病毒基因扩增产物进行克隆、测序、比对及系统发育分析。从云南省16个地州797份猪精液中检出JEV阳性样品7份,阳性率0.88%。阳性精液样品中的JEV与基因Ⅰ型毒株PrM基因核苷酸序列同源性为97.5%~98.8%,与其他基因型毒株的同源性介于76.9%~89.8%之间,与疫苗毒株(基因Ⅲ型毒株,S19980008)的同源性为89.1%~89.8%。云南省种公猪精液中JEV属于基因Ⅰ型毒株,与人、猪、蚊虫基因Ⅰ型分离毒株遗传关系密切。
- 李师师张文东吕粤赵焕云李昀海张武林岳亮张应国范泉水胡述光张富强
- 关键词:种公猪精液乙型脑炎病毒
- 云南地区马流感病毒检测及其HA基因序列分析被引量:7
- 2009年
- 马流感能引起马属动物的高度接触性呼吸道传染病。该病毒已知仅存在H7N7(马流感病毒1型)、H3N8(马流感病毒2型)两个亚型,目前仅H3N8亚型毒株在全球范围内引起马流感流行和暴发。采用A型及H3亚型特异性RT-PCR技术,检测云南疑似马流感病例鼻腔棉拭子样品;HA基因PCR扩增产物经纯化后,克隆至pMD18-T载体进行测序,并与已知代表性毒株对应序列进行比对及系统发育分析。研究发现云南马流感病毒与已知代表毒株血凝素基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别介于91.2%-99.2%和89.5%-98.4%,属于美洲谱系(American lineage)佛罗里达亚谱系(Florida sub-lineage)毒株。
- 田建国叶丛华张文东宋建领吕粤岳亮邱薇冯子良张思东范泉水张应国张富强
- 关键词:马流感病毒血凝素基因测序
- 云南境外禽流感H5N1亚型病毒神经氨酸酶基因进化及分子结构特征分析
- 2010年
- 目的:禽流感病毒神经氨酸酶(NA)是病毒粒子重要表面抗原之一,其抗原性差异决定病毒神经氨酸酶亚型(N1-N9)的划分。NA介导病毒对敏感细胞的侵染及协助子代病毒粒子的成熟和释放,与病毒的宿主嗜性及毒力有关。方法:对2003~2009年期间采集自云南境外家禽的H5N1亚型阳性样品中病毒NA基因进行测序,并与国内外已知代表毒株进行序列比对及系统发育分析。认识云南境外禽流感H5N1亚型病毒神经氨酸酶(NA)基因分子结构特征。结果:21份代表性病毒样品NA基因核苷酸和氨基酸序列同源性介于94.3%~99.3%、93.1%~99.3%。系统发育分析表明可划分为6个不同进化(亚)分支(1、7、9、2.4、2.3.2、2.3.4),其中进化亚分支2.3.4毒株已成为当前云南境外流行的优势毒株;所有云南境外毒株NA蛋白的49-68位氨基酸均存在缺失。结论:糖基化位点存在特有变异;云南境外毒株对Oseltam ivir(达菲)类抗病毒药物可能无耐药性。
- 董波张文东宋建领赵焕云叶丛华田建国吕粤岳亮邱薇冯子良张思东苑述友范泉水张应国张富强
- 关键词:禽流感病毒H5N1亚型神经氨酸酶系统发育分子特征
- 云南高致病性PRRSV Nsp2和ORF5基因变异分析被引量:3
- 2010年
- 为研究云南省高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)变异特征,采用RT-PCR对云南省2007年-2008年采集的56份猪组织样品中PRRSV Nsp2、ORF5基因进行检测,获得阳性样品12份,选择6份代表性样品将其PCR产物纯化后,克隆至pMD18-T载体后测序,并与已知代表毒株进行序列比对及系统发育分析。分离株Nsp2基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为94.9%~97.2%和91.4%~95.7%,其中1份样品(07YNMG)在486位~489位氨基酸发生了缺失。在系统进化树上可将其划分为4个亚组群,分离株分别与广东、贵州、浙江、山东等地分离毒株遗传关系密切。ORF5基因核苷酸与氨基酸序列同源性分别为97.8%~99.5%和97.0%~99.5%。氨基酸序列未发现缺失,仅个别位点发生点突变。系统进化树分析表明,分离株与浙江、贵州、广东、云南株亲缘关系较近,而与国内疫苗株以及PRRSV经典代表毒株CH-1a距离较远。
- 杨利琴庞海洋石凤海张文东赵焕云吕粤岳亮张富强张应国
- 关键词:NSP2基因ORF5基因
- 云南边境O型口蹄疫监测及病毒VP1基因序列分析
- 2008年
- 口蹄疫是由口蹄疫病毒引起的主要侵袭偶蹄动物的一种急性热性高度接触性传染病。口蹄疫病毒为微RNA病毒科口蹄疫病毒属成员,存在7个不同血清型,病毒VP1蛋白抗原性差异是病毒血清型划分依据,而其编码基因(1D)核苷酸序列差异是同型病毒拓扑型(Topotype)或基因型鉴别依据。采用O/A/C/Asia-1多重RT-PCR技术,对2006年自云南边境地区采集的120份动物组织样品,进行口蹄疫病原监测,检出O型口蹄疫病毒阳性样品15份。对阳性样品中病毒VP1基因全序列进行扩增、纯化后,克隆至pMD18-T载体测序,并与已知代表性毒株进行比对及系统发育分析。结果发现:云南边境O型口蹄疫病毒阳性样品VP1基因核苷酸序列同源性介于77.3%~98.7%,可划分为3个不同的拓扑型或基因型:中东-南亚型(ME-SA)或泛亚型(PAN-Asia)、古典中国型(Cathay)、东南亚型(SEA)。部分样品VP1蛋白表位43位、154位关键性氨基酸位点存在变异。
- 胡媛媛张文东宋建领赵焕云吕粤岳亮张应国李作生范泉水张富强
- 关键词:口蹄疫病毒VP1测序
- 云南边境Asia1型口蹄疫监测及病毒vp1基因序列比较被引量:3
- 2008年
- 口蹄疫是由口蹄疫病毒引起的主要侵袭偶蹄动物的一种急性热性高度接触性传染病。口蹄疫病毒存在7个不同血清型,病毒VP1蛋白抗原性差异是病毒血清型划分依据,而其编码基因核苷酸序列差异是同型病毒Topotype型或基因型划分依据。采用RT-PCR及O/A/C/Asia1多重RT-PCR技术,对2006年期间自云南边境地区采集境外流动动物组织样品120份,进行口蹄疫病原监测,检出Asia1型口蹄疫病毒阳性样品7份。对阳性样品中病毒vp1基因全序列进行扩增、纯化后,克隆至pMD18-T载体测序,并与已知代表性毒株进行比对及系统发育分析。结果发现:云南边境Aisa1型口蹄疫病毒阳性样品vp1基因核苷酸序列同源性介于83.4%~99.5%,不同分离毒株以15%序列差异作为分型标准,存在1个新拓朴型或基因型Ⅴ,且与已知的4个拓朴型或基因型不同。系统发育分析确定了1个新的遗传谱系Ⅶ。部分VP1蛋白表位关键性氨基酸位点存在变异。
- 张文东胡媛媛宋建领赵焕云吕粤岳亮张应国李作生范泉水张富强
- 关键词:口蹄疫病毒测序
- 云南省猪圆环病毒2型流行病学调查研究被引量:3
- 2012年
- 本研究利用PCR方法,对云南省16个州市的临床健康猪群进行PCV-2病原学监测。2009~2011年PCV-2阳性率分别为3.97.%(120/3019)、1.95%(57/2923)和2.7%(79/2922)。规模场的PCV-2阳性率分别为1.65%(6/362)、1.24%(4/321)、1.31%(5/379);散养户的PCV-2阳性率分别为4.29%(114/2657)、2.03%(53/2602)、2.9%(74/2543);监测结果显示,我省猪群PCV-2感染范围较广,滇西和滇南片区的阳性率明显高于其他片区,滇中和滇东片区阳性检出率较低;散养户圆环病毒感染率高于规模场;该病在我省无明显的季节性。
- 吕粤杨筱轩岳亮马坤
- 关键词:猪圆环病毒2型流行病学调查PCV-2健康猪群PCR方法阳性检出率
- 云南省鸡败血支原体血清抗体调查和防制被引量:1
- 2012年
- 鸡败血支原体是引起鸡群感染慢性呼吸道传染病,危害养鸡业发展的的主要病原。对云南省12个州市规模场和散养户采集1 245份鸡血清,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)方法进行检测,结果表明:1 245份样品中鸡败血支原体阳性血清为505份,阳性率为40%。针对云南省鸡败血支原体广泛存在的特点,提出综合防控措施。
- 吕粤岳亮吕素珍
- 关键词:鸡败血支原体ELISA