余坚 作品数:23 被引量:63 H指数:5 供职机构: 上海市肿瘤研究所 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 江苏省自然科学基金 上海市科学技术委员会资助项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
ABCC8、CHFR、BMP3B、LOX、PRSS21和RASSF1A基因启动子的甲基化状态可能与3种乳腺癌细胞株对5-FU的敏感性相关 被引量:6 2009年 目的:寻找与乳腺癌细胞株间药物敏感性差异相关的基因启动子CpG岛甲基化异常,为DNA甲基化异常作为临床化疗敏感性预测手段提供依据。方法:用MTT法测定3种乳腺癌细胞株(Bcap-37、T47D和ZR-75-30)对9种化疗药物(紫杉醇、紫杉特尔、长春瑞宾、5-氟尿嘧啶(5-FU)、双氟去氧胞苷、表阿霉素、丝裂霉素、依立替康和顺铂)的敏感性;同时用甲基化特异性PCR检测23个基因在3种乳腺癌细胞株中的甲基化状态。结果:受试的3种乳腺癌细胞株仅对5-FU的敏感性有明显差异。其中Bcap-37(IC50:317.386μg/mL)对5-FU相对耐药,而ZR-75-30(IC50:6.676μg/mL)和T47D(IC50:73.076μg/mL)对5-FU相对敏感。23个基因中,有6个基因:ABCC8、CHFR、BMP3B、LOX、PRSS21和RASSF1A在敏感和耐药细胞株中的甲基化状态有差异。其中ABCC8、CHFR和BMP3B在5-FU耐药细胞株中呈相对高甲基化状态,而LOX、PRSS21和RASSF1A则在对5-FU敏感的细胞株中呈相对高甲基化状态。结论:本研究所发现的6个基因的甲基化状态可能与乳腺癌细胞株对5-FU化疗敏感性相关,为下一步进行临床评估和机制探讨提供了依据。 蔡飏 孙晋枫 黄朝晖 余坚 何英华 戴信兰 周小羽 徐慧莉 顾峻 张红宇 胡夕春 朱景德关键词:甲基化特异性聚合酶链反应 尿液诊断膀胱癌患者复发危险性的方法和试剂盒 本发明涉及尿液诊断膀胱癌患者复发危险性的方法和试剂盒。本发明公开了2个甲基化敏感基因,它们是LMX1A、VAX1基因。在检测膀胱癌病人手术前留存尿样,上述基因特定CpG位点在随访确定的复发人群中发生高度甲基化。因此,这2... 余坚 王红阳 顾健人 赵仰星 孙晋枫 张红宇 顾峻 王韦 何英华 郭士成文献传递 MSRE-qPCR技术分析多基因DNA甲基化对肝细胞癌的诊断价值 被引量:18 2011年 背景与目的:DNA甲基化是潜在的肿瘤标志物。本研究运用自行建立的甲基化敏感性限制性内切酶-定量PCR(methylation-sensitive restriction enzymes-based quantitative PCR,MSRE-qPCR)方法检测肝细胞癌(hepatocellutar carcinoma,HCC)组织中多个基因的DNA甲基化状态,筛选可用于HCC诊断的DNA甲基化标志物组合。方法:以47对HCC患者癌组织和癌旁组织、8例正常人肝组织为材料,运用MSRE-qPCR方法检测这102例肝组织中APC、GSTP1、RASSF1A、p16、SFRP1、RUNX3、Hint1、SOCS1和HIC-1基因的启动子甲基化状态。结果:APC、GSTP1、RASSF1A、p16、SFRP1、RUNX3基因在肿瘤组织中的甲基化率分别为70.2%、70.2%、63.8%、29.8%、44.7%和36.2%,均显著高于对应癌旁组织(P均<0.05);而Hint1、SOCS1和HIC-1基因甲基化水平在HCC肿瘤和癌旁组织间无显著差异。联合检测APC、GSTP1、RASSF1A和SFRP1 4个靶点,可检出所有HCC病例。这些基因的甲基化水平与患者肿瘤大小、分化、包膜及HBV感染等临床病理参数均无显著相关性。结论:联合检测APC、GSTP1、RASSF1A和SFRP1的DNA甲基化状态对于HCC风险评估和分子诊断具有重要价值。 邱东民 余坚 黄朝晖关键词:DNA甲基化 限制性内切酶 肝细胞癌 一种具有抑制肿瘤转移活性的多肽分子、制备方法及其应用 本发明涉及一种具有抑制肿瘤转移活性的多肽分子、制备方法及其应用。本发明所述的多肽分子具有DR6死亡受体结合活性,具有抑制肿瘤细胞诱导血管内皮细胞坏死,阻止肿瘤细胞经过血流透过血管壁,实现肿瘤转移的过程。这些多肽分子具有潜... 段友容 廖洪泽 王丽婷 沈庆 王琪 余坚用尿沉淀细胞DNA甲基化状态的分析检测膀胱癌 被引量:3 2007年 目的:确定尿沉淀细胞DNA中的13个肿瘤相关基因启动子的甲基化谱式分析在膀胱癌诊断中的价值。方法:用定性甲基化特异性(methylation specific polymerase chain reaction,MSP)的方法,对92例临床确诊的膀胱癌患者、23例非肿瘤性尿路疾病患者、6例脑外科患者、7例健康志愿者检测了尿沉淀细胞DNA中肿瘤相关基因启动子的甲基化状态。结果:在临床确诊的92例膀胱癌患者中被检测的13个基因的高甲基化状态出现频率显著高于23例非肿瘤性尿路疾病患者,差异有统计学意义(P<0.05)。而6例脑外科患者和7例正常健康人的尿沉淀细胞DNA中,上述基因均为去甲基化状态。若以任一个基因高甲基化为膀胱癌的指征,88.0%(81/92例)的膀胱癌可被检出。结论:MSP法分析尿沉淀细胞DNA中肿瘤相关基因启动子的甲基化状态可有效地检出膀胱癌。 孟军 余坚 朱同玉 张红宇 徐慧莉 王韦 高宝梅 王继纳 朱景德关键词:膀胱肿瘤 尿分析 DNA甲基化 甲基化特异性聚合酶链反应 一种具有抑制肿瘤转移活性的多肽分子、制备方法及其应用 本发明涉及一种具有抑制肿瘤转移活性的多肽分子、制备方法及其应用。本发明所述的多肽分子具有DR6死亡受体结合活性,具有抑制肿瘤细胞诱导血管内皮细胞坏死,阻止肿瘤细胞经过血流透过血管壁,实现肿瘤转移的过程。这些多肽分子具有潜... 段友容 廖洪泽 王丽婷 沈庆 王琪 余坚文献传递 肝癌中Sall3基因甲基化的研究 被引量:1 2010年 目的:检测Sall3基因在肝癌细胞系和肝癌组织中的甲基化状况及其表达水平。方法:对7株肝癌细胞系、142对肝癌组织和6例正常肝组织进行Sall3基因启动子区域甲基化检测。甲基化研究使用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation specific polymerase chain reaction,MSP),基因表达水平研究采用实时定量反转录PCR(real-time RT-PCR)。结果:MSP结果显示,7株肝癌细胞株中有6株Sall3基因的启动子区域为纯合甲基化,1株为纯合去甲基化;在6例正常肝组织中Sall3均为纯合去甲基化;在142对肝癌组织标本中,癌旁组织Sall3基因启动子区域甲基化率为18.31%,在癌组织中为64.79%。real-time RT-PCR结果显示,肝癌肿瘤细胞系Sall3mRNA的表达水平明显低于去甲基化的正常肝组织。结论:Sall3基因启动子甲基化在正常肝组织、肝癌组织(和肝癌细胞系)中有明显差异。 夏卫 倪唯益 费琦 孙晋枫 赵仰星 张宏宇 顾峻 何英华 余坚关键词:肝癌 甲基化特异性聚合酶链反应 TGF-β1基因rs2241715位点T/T基因型人群患HBV感染相关性疾患的风险更高 2008年 目的:确立3个在亚洲人群中高频杂合的TGF-β1单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)新位点与HBV感染相关性疾病易感性的关系。方法:采用基因型特异性PCR方法,对129例HBV感染相关性疾病患者(慢性乙型肝炎74例、肝硬化41例、肝癌14例)和41例健康人对照的外周血细胞基因组DNA的TGF-β1基因中,3个在亚洲人群中呈高频率杂合的SNP位点(rs2241715、rs2241716、rs4803455)进行基因分型。结果:正常人的rs2241715基因型及等位基因频率与慢性乙型肝炎、肝硬化和肝癌相比差异有统计学意义(P〈0.05)。rs2241715 T/T基因型的个体患慢性乙肝和肝硬化的相对风险度分别为其他型者的2.974倍(95%CI=1.209—7.314,P=0.018)和3.228倍(95%CI=1.201—8.675,P=0.020)。rs2241716和rs4803455位点的谱式则无上述的相关性。结论:TGF-β1基因的rs2241715 SNP位点T/T基因型可能是慢性乙肝病毒感染相关疾患的易感因素。 龚邦东 余坚 黄朝晖 杜德林 李仲平 李宇舟 费琦 孙晋枫 唐志红 朱景德关键词:乙型 转化生长因子Β 单核苷酸 3株肺癌细胞中9个肿瘤相关基因的启动子甲基化状态和部分基因表达的相关性 被引量:7 2004年 目的 对 3株肺癌细胞中 9个肿瘤相关基因的启动子甲基化状态和部分基因表达的相关性进行评估。方法 通过甲基化特异性多聚酶链反应法 (MSP)结合DNA测序来确定 3株肺腺癌细胞株 (A5 4 9,SH77和SPE A 1)中 9个基因的启动子CpG岛的甲基化状态 :APC ,CDH13,DAPK1,MGMT ,MYOD1,p16 INK4a,p73,RAR β和WT1基因。同时采用半定量RT PCR的方法来量度下列 5个基因的表达 :CDH13,MGMT ,MYOD1,RAR β和WT1基因。结果 在 9个受检基因之中 ,下列 4个基因在三株细胞中均呈同样的甲基化谱式 :仅有去甲基化 :APC和DAPK1,以及兼有甲基化和去甲基化 :p73和p16 INK4a。而其余 5个基因则表现为不同的甲基化模式。尽管 ,这 5个基因的表达谱式大体上符合其启动子CpG岛甲基化的表达静息的原则 ,个别的例外亦是有的。这提示着与DNA甲基化状态无关的机制可能也会参与该基因的表达调控。 杨振华 商祖斌 余坚 蔡映云 张红宇 顾峻 徐慧莉 朱景德关键词:肿瘤相关基因 启动子甲基化 肺癌 甲基化敏感限制酶结合定量PCR检测DNA甲基化方法的建立与应用 被引量:4 2011年 启动子CpG岛高甲基化是抑癌基因失活的重要机制之一,对于肿瘤的早期诊断、分子分型、预后判断等均具有较大的价值。目前较常用的DNA甲基化检测技术是基于亚硫酸氢盐处理的甲基化特异PCR方法(MSP),但该技术需使用强碱对DNA进行处理,导致绝大多数DNA分子发生断链。限制性内切酶广泛应用于DNA甲基化分析,其中甲基化敏感性限制内切酶(MSRE)只能切割非甲基化的靶位点; 黄朝晖 吴玉玉 华东 胡瑜 王丰 程之红 余坚 杜祥关键词:DNA甲基化 定量PCR检测 限制酶 限制性内切酶