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曹新: 作品数：95 被引量：328H指数：10; 供职机构：南京医科大学更多>>; 发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金江苏省高等学校大学生实践创新训练计划项目更多>>; 相关领域：医药卫生生物学文化科学轻工技术与工程更多>>

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斑马鱼胚胎早期发育过程中WFS1基因的时空表达特征分析: 哺乳动物细胞中WFS1(Wolfram syndrome 1)基因编码一类膜结构的转运蛋白,其主要功能与膜物质运输、蛋白加工和胰岛β细胞的抗凋亡密切相关。WFS1突变可导致在临床上以1型糖尿病、视神经萎缩、双侧重度耳聋和...; 魏钦俊姚俊鲁雅洁曹新; 关键词：斑马鱼; 文献传递

人催乳素受体胞外区蛋白的原核表达及纯化: 2010年; 目的:建立人催乳素受体的原核表达系统,并在大肠杆菌中获得表达。方法:由RT-PCR获得人催乳素受体(human prolactin receptor,hPRLR)胞外区氨基酸的编码序列,扩增并通过酶切位点修饰后克隆至pMD18-T载体,经测序正确后,切下编码序列连接到重组表达载体pGEX-4T-2中,转化大肠杆菌Rosetta(DE3),用IPTG诱导重组工程菌表达,使用谷胱甘肽偶联的GSTrapFF柱亲和层析纯化重组蛋白。结果:重组菌株可以表达GST-hPRLR融合蛋白,用免疫印迹反应鉴定纯化的融合蛋白,在相对分子质量为37.6×103处有一条带。结论:利用大肠杆菌表达系统获得了较高纯度的GST-hPRLR融合蛋白,为进一步研究催乳素受体的功能和制备特异性的抗体奠定了基础。; 刘雪瑶鲁雅洁屈芫姚俊魏钦俊曹新冯振卿; 关键词：融合蛋白原核表达纯化

应用基因芯片技术检测非综合征型耳聋基因突变被引量：25: 2010年; 目的:应用遗传性耳聋基因芯片对散发性聋患者进行分子病因学检测,评估其在遗传性耳聋快速基因诊断中的可靠性。方法:门诊收集散发性聋患者10例,取外周血,提取基因组DNA,用遗传性耳聋基因芯片检测4个中国人中常见的耳聋相关基因中的9个热点突变,包括GJB2(35delG、176del16bp、235delC及299delAT)、GJB3(C538T)、SLC26A4(IVS7-2A>G、A2168G)和线粒体DNA 12S rRNA(A1555G、C1494T)。同时,PCR扩增GJB2、线粒体12S rRNA基因全序列,DNA测序,以验证基因芯片检测结果的准确性。结果:在10名耳聋患者中,基因芯片方法检出1例携带线粒体DNA 12S rRNA C1494T突变;2例GJB2基因235delC纯合突变;2例235delC杂合突变;SLC26A4基因和GJB3基因未检出突变。基因芯片的结果与测序结果完全一致。结论:遗传性耳聋基因芯片技术对中国人常见耳聋相关基因热点突变的检出率高,结果准确、可靠,具有快速、高通量、高准确性、低成本等特点,能够满足临床耳聋基因检测的要求,同时结合产前诊断技术能有效预防耳聋患儿的出生,因而具有广阔的临床应用前景。; 张艳卞颖华许鹏飞黄辰飞曹新邢光前魏钦俊; 关键词：耳聋 GJB2基因线粒体DNA 基因芯片

一种耳聋模型猪的重构卵及其构建方法，耳聋模型猪、构建方法及其应用: 本发明公开了一种耳聋模型猪的重构卵及其构建方法，并公开了了一种耳聋模型猪、构建方法及其应用。本发明的耳聋模型猪的重构卵及其构建方法和模型猪的构建方法通过敲除猪OSBPL2基因获得了耳聋小型猪的重构卵，结合CRISPR/C...; 曹新姚俊曾华沙杨海元王盈邢光前陈智斌魏钦俊鲁雅洁戴一凡; 文献传递

人GJB2分子进化与耳聋遗传效应的关联性分析被引量：3: 2012年; 间隙连接蛋白β2(GJB2)基因突变与遗传性非综合征性耳聋密切相关,其广泛的突变类型及特异性的热点突变被认为是一种独特的致聋基因。本研究应用生物信息学方法对17个物种的GJB2蛋白进行了系统发育、保守性、跨膜区结构、三维结构和错义突变的分析,并结合已有报道的实验结果进行关联性分析。分析预测获得了166个固定的氨基酸位点、2个非保守区以及2个空间结构保守位点;关联性分析证实发生在保守位点的突变致病性高,非保守区突变的概率致病性小,跨膜区且改变氨基酸性质的突变,可能影响蛋白的空间结构而改变膜通道的通透性。本文为进一步研究GJB2基因突变与聋病的关联性及分子发病机制提供了理论依据,同时,这种研究思路对其它疾病的相关研究具有一定的借鉴价值。; 范燚喻岸竹郁芸韩新焕邢光前曹新; 关键词：GJB2基因非综合征型耳聋分子进化

MicroRNA-449c靶向下调PRLR抑制乳腺癌细胞迁移作用的研究: 鲁雅洁何伟魏钦俊曹新; 关键词：乳腺癌

基于目标基因芯片数据预测lncRNAs调控脑缺血再灌注损伤后的作用效应被引量：2: 2016年; 长链非编码RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)在细胞中有重要调控作用。已有研究报道,脑缺血再灌注损伤可诱导大量lncRNAs表达水平的改变,然而其具体作用机理未知。现从GEO数据库中下载基因芯片数据,分析损伤后脑组织中lncRNAs和mRNAs的表达改变。结果显示27条lncRNAs和408条mRNAs表达上调,9条lncRNAs和31条mRNAs表达下调。同时,基因本体论和通路富集分析显示差异表达的转录本在免疫和炎症反应、细胞凋亡调控等生物过程及相关通路显著富集。此外,基于lncRNAs目标预测程序和lncRNAs-mRNAs共调控网络,对序列数据和表达数据进行综合分析,发现差异表达lncRNAs参与调控细胞凋亡、免疫和炎症反应,并推测出linc RNA(chr1 9:5771 425-5848475_F)、lincRNA(chr1:1 37503023-1 37625604_R)和lincRNA(chr1 4:21 029450-21 049451_F)等lncRNAs潜在的靶基因和调控机制。这些发现提示lncRNAs广泛参与调控脑缺血再灌注损伤,为缺血性脑卒中损伤机制和治疗方案提供新的研究方向。; 冯维熙曹新; 关键词：脑缺血免疫反应生物信息学预测基因芯片数据

催乳素处理的乳腺癌T-47D细胞lncRNA和mRNA表达谱差异分析被引量：2: 2017年; 目的:观察催乳素处理引起乳腺癌T-47D细胞中长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱的变化。方法:利用转录组测序技术检测催乳素处理前后乳腺癌T-47D细胞中lncRNA和mRNA的表达谱;通过数据库KEGG、GO富集对有差异表达且具有统计学意义的mRNA进行通路分析,得到mRNA参与的生物学途径;运用荧光定量PCR(q RT-PCR)技术对部分差异表达的lncRNA(lnc-AK4-2、XLOC_075541、XLOC_093371、XLOC_081110、XLOC_047068、XLOC_006637、XLOC_064063、XLOC_086865、XLOC_099517、XLOC_106798、lnc-ZNF639-1)进行验证,并利用生物信息学方法预测其靶基因,通过数据库KEGG、GO富集对差异lncRNA的靶基因进行通路分析。结果:分析得到3564个差异lncRNA和477个差异mRNA(差异倍数>2,P<0.05),差异表达的mRNA主要富集在134条不同的信号通路,其中包括催乳素/催乳素受体信号通路相关的MAPK信号通路、p53信号通路和JAK-STAT信号通路;选取的11条lncRNA的变化趋势(XLOC_093371、XLOC_006637、XLOC_064063、XLOC_086865、lnc-ZNF639-1表达上调,lncAK4-2、XLOC_075541、XLOC_081110、XLOC_047068、XLOC_099517、XLOC_106798表达下调)经q RT-PCR技术得到验证;lncRNA靶基因富集的信号通路同样包括MAPK信号通路。结论:催乳素处理前后T-47D细胞中lncRNA的表达存在明显差异,为进一步研究与乳腺癌发病机制相关的关键lncRNA分子提供了基础,并为寻找乳腺癌潜在的诊疗方法提供理论支持。; 朱林静姚俊魏钦俊鲁雅洁曹新; 关键词：长链非编码RNA 表达谱乳腺癌催乳素

SHP-1是IL-4诱导的IL-4R在脾脏细胞中表达所必需的: 2005年; 为了探索包含SH-2功能域的蛋白酪氨酸磷酸酶(SH-2-containing protein tyrosine phosphatase1,SHP-1)在IL-4诱导的IL-4受体(IL-4receptor,IL-4R)表达中的作用,用Na3VO4处理野生型(wildtype,WT)实验小鼠的脾脏细胞以及用IL-4刺激可育Motheaten小鼠(viable motheatenmice,mev/mev)的脾脏细胞,并检测IL-4RαmRNA的表达.我们发现IL-4诱导的IL-4RαmRNA表达在经Na3VO4处理后野生型小鼠的脾脏细胞以及用IL-4刺激的mev/mev小鼠的脾脏细胞中降低了.结果表明,IL-4诱导的IL-4RαmRNA表达的降低是由于IL-4R的低水平表达导致的STAT6信号转导缺陷.实验进一步证实,在mev/mev小鼠的脾脏细胞中IL-4Rα蛋白表达的降低是由于细胞组成的改变.在mev/mev小鼠脾脏组织中,表达相对高水平IL-4R的CD4+,CD8+和CD19+的细胞比例显著下降,相反表达低水平IL-4R的Mac-1+和Gr-1+细胞比例明显升高.尽管IL-4R蛋白表达是明显下降的,但在同窝对照小鼠(+/?)和mev/mev小鼠的脾脏细胞中IL-4RαmRNA的表达未发现明显的差异.在B细胞、T细胞和巨噬细胞中也没有显著差异.这提示在巨噬细胞中IL-4R表达细胞类型特异性下调是通过转录后水平的调控来实现的.研究结果提示,在脾脏细胞中SHP-1对于IL-4诱导的IL-4R表达是必需的,并且通过影响血细胞生成而间接地调控相应的功能.; 曹新HUANG Zan FAN Jingyi; 关键词：SHP-1 IL-4 脾脏细胞蛋白酪氨酸磷酸酶巨噬细胞

人乳腺癌催乳素受体相关microRNAs的筛选与分析: 目的探讨人乳腺癌中催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)相关的microRNAs(miRNAs)表达谱情况,并对差异表达的miRNAs和novel miRNA进行生物信息学分析以了解其在人乳腺癌的...; 何伟魏钦俊鲁雅洁姚俊曹新; 关键词：乳腺癌 MICRORNAS 高通量测序

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