刘海林
- 作品数：6 被引量：41H指数：4
- 供职机构：暨南大学生命科学技术学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程更多>>
- 黄渤海松江鲈鱼线粒体控制区结构与序列多态性分析被引量：16
- 2010年
- 测定了辽宁丹东、盘锦与河北秦皇岛35尾松江鲈鱼线粒体控制区序列977bp。共检出单倍型30个,多态位点35个,简约信息位点27个,绝大多数变异集中在192-342bp、594-783bp区段,同时识别出了线粒体控制区5’端终止序列区、中央保守区和3’端保守序列区的关键序列。3个群体总的单倍型多样性为0.990,核苷酸多样性为0.00718,丹东群体核苷酸多样性最高(0.00959)。群体间、群体内平均遗传距离低(分别为0.0067和0.0063);在NJ树上不同地理来源的个体混杂分布;Fst分析显示丹东与秦皇岛群体间遗传分化相对较大(0.14222,p<0.05),其余不明显(0.02865-0.05616,p>0.1),表明3个群体有可能隶属同一个种群。核苷酸不配对分布图表明松江鲈鱼可能未经历过大规模的种群扩张。
- 刘海林章群唐优良余帆洋周佳怡
- 关键词：松江鲈鱼
- 中国近海角木叶鲽(Pleuronichthys cornutus)种群遗传多样性研究被引量：6
- 2012年
- 测定了中国沿海角木叶鲽4个群体57个体的线粒体控制区序列,在长度为549 bp的线粒体控制区序列中,检测到3个插入/缺失位点,24个变异位点(包括11个简约信息位点),共出现了37个单倍型,其中9个为共享单倍型。角木叶鲽整体的单倍型多样度(Hd)和核苷酸多态度(P)i结果分别为0.979±0.008和0.00655±0.0037,呈现出高单倍型多样度和低核苷酸多态度分布模式。中性检验结果显示,角木叶鲽种群的Fu's Fs为显著负值,核苷酸不配对分析呈现单峰分布,表明角木叶鲽在历史上经历过种群扩张事件。群体内个体间的平均遗传距离为0.0065,群体间遗传分化指数都为负值(-0.0067^-0.0460)但不显著(P>0.1),AMOVA分析显示遗传变异主要集中在群体内个体间(102.15%),均表明我国近海角木叶鲽种群无明显的分化,可以作为一个渔业管理单位加以保护和利用。
- 朱叶章群李贵生刘海林马奔黄小彧司从利
- 关键词：线粒体控制区
- 赤潮棕囊藻(Phaeocystis globosa)rDNA ITS区序列变异与二级结构分析被引量：5
- 2010年
- 测定了南海球形棕囊藻香港株P1、P2和湛江株ZhJ1的rDNAITS区序列（含5.8srDNA）,结合GenBank的13条同源序列,比对长度为904bp,变异位点271个,简约信息位点221个,平均（A＋T）（34.5%）〈（G＋C）（65.4%）.藻株P1、P2和ZhJ1序列存在变异位点20个,序列间相似性为97.9%～98.5%.ITS序列在种间和种内的解析度高于18srDNA和28srDNA基因;构建的NJ树、MP树、贝叶斯推断系统树的结构是一致的,不同种类的棕囊藻单独聚类,不同地理来源的球形棕囊藻混杂分布但相同地理来源的藻株多聚类在一起.RNA二级结构显示,不同藻种间5.8srDNA区结构基本一致,表现出属的特异性;ITS1、2区结构表现较大的种间差异,表明ITS区RNA二级结构可为棕囊藻分类鉴定提供有用的分子结构信息.
- 刘海林章群江启明马奔
- 关键词：球形棕囊藻中国近海
- 基于线粒体细胞色素b基因全序列的海南长臀鮠南渡江种群遗传变异分析被引量：9
- 2010年
- 测定了海南南渡江15尾海南长臀鮠（Cranoglanis bouderius multiradiatus）的cytb基因全序列1138bp，发现3个可变位点和1个简约信息位点，共检测到4种单倍型。海南长臀鮠Cytb基因具有典型的起始密码子（ATG）和不完全终止密码子（T＊＊），共编码379个氨基酸，密码子第三位点G的含量仅2.9%，而C和A的含量分别为39.1%和38.5%，在第二位点上T的使用频繁高达41.3%，表明cytb基因在密码子碱基的使用具有偏倚性。海南长臀鮠基于Kimura-2-parameter模型的单倍型间遗传距离为0.0009~0.0017，在NJ系统树中没有明显的谱系结构，单倍型多样性（0.600）和核苷酸多样性（0.0006）都较低，表明海南长臀鮠遗传多样性非常贫乏，应及时采取有效措施保护海南南渡江种群。
- 乐小亮赵爽刘海林章群
- 关键词：细胞色素B
- 基于rpoC1基因的微囊藻属分子系统学研究被引量：2
- 2009年
- 测定了广东省9个水库4株铜绿微囊藻Microcystis aeruginosa、5株水华微囊藻M.flos-aquae和4株未定种微囊藻rpoC1基因部分序列,结合GenBank下载的日本5个水体11株铜绿微囊藻、5株绿色微囊藻M.viridis和5株惠氏微囊藻M.wesenbergii同源序列,进行序列分析。结果显示,34株微囊藻存在21种基因型,序列相似性达97.6%～100%。在邻接树上不同形态种和不同地理来源的藻株混杂在一起,没有形成明显的谱系结构和地理结构:同一形态种藻株可能具有不同的基因型,而相同基因型的藻株可能是不同的形态种;从同一水体中分离的微囊藻具有不同的形态种和不同的基因型,而不同水体分离的微囊藻有时又具有相同基因型,表明rpoC1基因序列无法区分形态种和地理株,支持Kondo和Otsuka提出的暂将铜绿微囊藻、水华微囊藻、惠氏微囊藻和绿色微囊藻等归为铜绿微囊藻复合种的分类处理。
- 章群李名立刘海林雷腊梅韩博平
- 关键词：微囊藻系统发育
- 太湖与广东汤溪水库微囊藻gyrB基因序列分析被引量：3
- 2010年
- 测定了江苏太湖和广东汤溪水库7株铜绿微囊藻(M.aeruginosa)和1株水华微囊藻(M.flos-aquae)gyrB基因部分序列(974bp),发现40个变异位点,17个简约信息位点,平均(G+C)%为47.8%,序列间相似性≥97.10%.在NJ分子系统树上,不同种类的微囊藻混杂分布,表明基因型聚类与表型无直接关系;不同地理来源的铜绿微囊藻间遗传变异小,没有明显的地理聚群,反映出地理差异并不影响遗传上的相似性;支持暂将不同藻种归为铜绿微囊藻复合种的分类处理.gyrB基因对微囊藻遗传差异的解析效果优于16S rRNA,与16S-23S ITS和cpcBA-IGS等效果相当,表明gyrB基因可能成为研究微囊藻分类和遗传变异新的良好分子标记.
- 刘海林章群李名立胡韧雷腊梅
- 关键词：微囊藻系统发育太湖
