郭旺珍 作品数:223 被引量:1,845 H指数:30 供职机构: 南京农业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 长江学者和创新团队发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 轻工技术与工程 自动化与计算机技术 更多>>
四倍体棉花的基因组结构与优质纤维的遗传解析 张天真 郭旺珍 王凯 蔡彩平 沈新莲 韩志国 该项目属于农业科学技术的农业植物学研究。棉花是世界性重要经济作物。基于基因组结构分析基础上的优质纤维遗传解析,既具有重大的科学意义,又具有重要的生产应用价值。项目组致力于上述研究,取得如下研究结果:阐明了四倍体棉花基因组...关键词:关键词:棉花 四倍体 基因组结构 一种棉花抗旱相关基因GhRCHY1及其应用 本发明公开一种棉花抗旱基因GhRCHY1及其应用,属于生物技术应用领域。本发明涉及的GhRCHY1基因,其编码一个锌指蛋白。本发明提供了GhRCHY1在异源四倍体陆地棉遗传标准系TM‑1中的全长ORF核苷酸序列,基因组序... 郭旺珍 张大勇 钮鑫文献传递 棉花纤维伸长发育期的基因表达分析 被引量:17 2006年 利用cDNA芯片技术分析陆地棉显性单基因突变的李氏超短纤维突变体(Li1li1)和其野生型(li1li1)纤维发育4 DPA(day post anthesis)的基因差异表达情况。RT-PCR验证4DPA芯片结果,得到15个差异表达的EST(expressed sequencetag),其中9个下调表达,即野生型(li1li1)中的表达量低于李氏超短纤维突变体(Li1li1)中的表达量;6个上调表达,即野生型(li1li1)中的表达量高于李氏超短纤维突变体(Li1li1)中的表达量。推测这些基因在棉花纤维伸长发育时期起了比较重要的作用。 朱一超 张天真 贺亚军 郭旺珍关键词:棉花纤维 CDNA芯片 基因表达 海岛棉受体类似蛋白激酶基因及其应用 本发明涉及海岛棉受体类似蛋白激酶基因的克隆,属于生物技术领域。克隆了一个海岛棉受体类似蛋白激酶(GbRLK)基因cDNA的全长序列,以此设计出一对GbRLK的特异性引物利用RT-PCR方法,检测其在接菌黄萎病后的抗性海岛... 张天真 高玉龙 郭旺珍文献传递 陆地棉三体的诱发、鉴定、研究和利用——IV.第19染色体三体的发现及鉴定 1999年 本文首次报道了一个新的陆地棉三体(Ftr-6)的发现,并对其形态,减数分裂中期I的染色体构型进行了研究.同时,通过其与一套易位系杂交F_1花粉母细胞染色体构型的细胞学检测,证明Ftr-6可能是第19染色体的三体. 郭旺珍 易成新 唐灿明 孙敬 潘家驹 张天真关键词:陆地棉 三体 易位系 染色体 能显著提高棉花抗病性的GhLMM基因及其应用 本发明公开一种能显著提高棉花抗病性的GhLMM基因及其应用,属于生物技术应用领域。本发明提供了GhLMM基因在异源四倍体陆地棉遗传标准系TM‑1的基因组A亚组、D亚组中核苷酸序列,ORF序列,氨基酸序列。本发明中的GhL... 郭旺珍 柴启超文献传递 棉花RGAP、DGAP和DDRT标记的定位研究 被引量:4 2009年 根据本实验室已克隆的RGAs和DGAs,设计48条RGAs和4条DGAs特异引物,以"海7124×TM-1"组合的BC1群体为材料把5个RGAP和2个DGAP标记定位到棉花的染色体上;以一个高抗黄萎病陆地棉品系5026为材料,在接种黄萎病菌后不同时期提取根部RNA,用mRNA差异显示(DDRT-PCR)技术,获得164个差异片段,根据这些片段设计34对DDRT引物。用已构建好的"海7124×军棉1号"组合的F2群体,将3个RGAP和5个DDRT定位到了相应的染色体上。用Joinmap3.0软件把两张连锁图谱整合为一张图谱,并将这些标记与抗黄萎病QTLs进行连锁分析。 杨昶 高玉龙 胡重怡 周兆华 郭旺珍 张天真关键词:棉花 雷蒙德氏棉EST-SSRs分布特征及开发与利用 被引量:29 2006年 微卫星或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)存在于表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)中.为了在棉花中开发EST—SSR功能性标记,利用生物信息学方法对NCBI网上公开的63485条雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii Ulbrich)ESTs序列进行EST-SSRs特征分析.剔除冗余序列,得到非冗余序列58906条.在非冗余序列中发现含不同重复基元SSRs的EST序列有2620条,共2818个EST-SSRs,EST-SSRs序列的频率是4.45%,平均相隔14.8kb出现一个SSR.在1~6bp的重复基元中,三核苷酸重复基元的SSRs出现频率最高(38.31%),其次是二核苷酸(24.09%)、单核苷酸(23.35%).对所有的重复基元类型进行统计分析发现,所占比例最大的是A/T(18.67%),其次是AT/TA(14.83%).在复合型(compound)中发现三核苷酸串联三核苷酸的重复基元出现频率最高,为48.65%.利用Prime3软件,设计了1554对EST-SSRs引物,随机选用300对对本室四倍体作图亲本陆地棉TM-1和海岛棉海7124进行多态性检测,其中129对有多态性,多态性频率为43%.这些EST-SSRs将有效用于不同棉种间的分布特征比较及染色体定位等方面研究. 王长彪 郭旺珍 蔡彩平 张天真关键词:EST-SSRS 分子标记 多态性 与棉纤维发育相关基因GhSAMS、GhNLP的克隆、鉴定与定位 被引量:1 2008年 【目的】克隆陆地棉纤维伸长发育相关的基因,并做初步功能验证。【方法】以陆地棉李氏超短纤维突变体Li1li1自交后代野生型li1li1和超短纤维突变体Li1li1开花后4d的胚珠纤维复合体为探针,通过基因芯片筛选优质材料7235棉纤维伸长、次生壁加厚不同发育时期混合cDNA文库,分离出两个在两种材料中差异表达的cDNA序列。【结果】测序结果表明,两个cDNA均为完整的基因序列,分别命名为GhSAMS(GenBank登录号:EF643509),GhNLP(GenBank登录号:EF643508)。RT-PCR分析表明:开花后4d,GhSAMS、GhNLP在陆地棉李氏野生型li1li1纤维中的表达量低于无纤维突变Li1li1。Southern杂交结果表明两个基因在陆地棉基因组中都存在少数拷贝。利用本实验室陆地棉遗传标准系TM-1和海岛棉海7124培育的140个BC1作图群体,将GhSAMS和GhNLP分别定位在染色体14(D2)和19(D5)上。【结论】克隆了两个棉纤维伸长发育相关基因GhSAMS和GhNLP,推测其高表达阻止纤维伸长生长,为进一步分析功能和用于分子育种打下基础。 张燕洁 朱一超 郭旺珍 张天真关键词:陆地棉 基因芯片 S-腺苷甲硫氨酸合成酶 两个棉纤维发育相关基因的克隆与特征分析(英文) 2010年 棉纤维发育突变体是克隆棉纤维发育关键基因和阐明其发育分子机理的优异资源。陆地棉李氏超短纤维突变体(Li1li1)是显性单基因突变体,表现为显性纯合体(Li1Li1)致死,显性杂合时(Li1li1)表型为茎秆扭曲、叶片卷曲和纤维短至6mm,而隐性纯合体(li1li1)则表现为株型和纤维发育都正常。本文对开花后10d的李氏纤维发育正常材料(li1li1)和超短纤维突变体(Li1li1)胚珠纤维混合体进行mRNA差异显示反转录PCR(DDRT-PCR)分析,获得2条在李氏纤维发育正常材料中上调表达的差异片段。测序及DNA序列的生物信息学分析表明该差异片段分别与编码谷氨酸脱羧酶和质子焦磷酸酶的基因有较高同源性。通过电子拼接,5′RACE和全长cDNA序列验证,克隆了棉花的谷氨酸脱羧酶(GhGAD)和质子焦磷酸酶(GhVP1)基因全长cDNA,进一步对其功能和染色体定位进行了初步分析。转录水平分析表明,这两个基因在棉花根、茎、叶和纤维中组成性表达,在棉纤维中优势表达。利用本实验室陆地棉遗传标准系TM-1和海岛棉海7124培育的含140个单株的BC1作图群体,将GhGAD和GhVP1分别定位在第12条染色体和第8条染色体。 王磊 朱一超 蔡彩萍 张天真 郭旺珍关键词:棉花 纤维突变体 DDRT-PCR 谷氨酸脱羧酶