翁康生
- 作品数:20 被引量:58H指数:5
- 供职机构:上海市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:上海市基础研究重大(重点)项目国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生化学工程生物学更多>>
- 2006年上海监测点婴幼儿腹泻标本中诺如病毒基因分析被引量:4
- 2007年
- [目的]了解2006年上海监测点婴幼儿病毒性腹泻散发病例中诺如病毒基因型别及核酸变异情况。[方法]应用一步法RT-PCR扩增89份病毒性腹泻标本中诺如病毒核酸,测序后应用基因分析软件包对核酸序列进行分析。[结果]12条核酸序列经测序和比对均属于诺如病毒GII基因组,其中3条核酸测序序列与2006年德国公布的序列同源性相近;其余9条核酸测序序列与2004年中国、2004、2005年日本、2006年荷兰公布的序列同源性相近。[结论]2006年上海地区婴幼儿中存在诺如病毒GII基因组散发病例,并以GII4基因型为主。
- 滕峥张曦翁康生邵俊杰赵百慧
- 关键词:诺如病毒基因组基因型
- 上海地区部分婴幼儿腹泻标本中诺如病毒基因分析被引量:3
- 2007年
- 目的了解2006年上海哨点医院婴幼儿疑似病毒性腹泻散发病例中诺如病毒基因型别和基因特征。方法应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增标本中诺如病毒核酸,测序后使用DNAstar基因分析软件与Genbank中的参考株进行核酸序列分析。结果13份测序结果均属于诺如病毒GⅡ遗传组,以GⅡ.4基因型为主。其中2份核酸序列与2006年德国汉堡毒株序列同源性相近,分别为86.2%和88.2%;2份核酸序列与2006年荷兰乌得勒支毒株序列同源性相近,均为83.9%;其余9份核酸序列与2004年中国广西、2004年和2005年日本东京毒株序列同源性相近,为87.3%~97.5%。结论2006年上海哨点医院婴幼儿疑似病毒性腹泻标本中存在诺如病毒GⅡ.4基因型散发病例,不同病毒株之间差异较大。
- 滕峥张曦翁康生邵俊杰赵百慧卢伟
- 关键词:诺如病毒基因型
- 新型冠状病毒RNA核酸的检测方法研究及应用被引量:4
- 2005年
- [目的 ] 研究和建立引起严重的急性呼吸道综合征 (SARS)的新型冠状病毒RNA核酸的检测方法。 [方法 ] 使用一步法巢式逆转录聚合酶链扩增法 (RT -PCR)。 [结果 ] 采自临床留观、疑似和临床诊断病人的 10 46份咽漱液 /咽拭子样品中 ,3份样品SARS冠状病毒RNA核酸为阳性 ;在 482份血清样品中 ,有 5份为阳性。 [结论 ] 一步法巢式RT -PCR能检测患者急性期咽漱液 /咽拭子和血清样品中的新型冠状病毒RNA核酸 ,但样本采集的时间和咽漱液
- 张曦朱兆奎滕峥张胜年翁康生郭常义
- 关键词:新型冠状病毒急性呼吸道综合征
- 幽门螺杆菌ureA、ureB基因克隆、序列分析及在E.coli中表达被引量:2
- 2002年
- 目的 构建含幽门螺杆菌 (Hp) ure A、ure B基因重组质粒 ,测定、分析其核酸序列及推定的氨基酸序列 ,在 E.coli中高效表达两基因 ,为检测试剂和疫苗研究提供基础依据和抗原。方法 PCR法扩增 Hp菌株 HPSH4的 ure A、ure B基因 ,分别与 p GEX- 2 T载体连接并转化大肠杆菌JM10 5 ,测定克隆基因的核酸序列并与 Gen Bank公布的国外 5株 Hp菌株 (2 6 6 95 ,HPK 5 ,J99,CPM6 30 ,M6 0 398)的 ure A、ure B基因作序列比较 ,以 IPTG诱导 ,ure A、ure B基因在 E.coli中高效表达。结果 ure A核酸同源性 96 .3%~ 98.1% ,氨基酸同源性 98.3%~ 10 0 % ;ure B核酸同源性95 .8%~ 98.0 % ,氨基酸同源性 96 .4 %~ 99.6 %。以 IPTG诱导 ,在 E.coli中表达 rure A融合蛋白5 5 6 0 0 D,rure B融合蛋白 85 5 0 0 D。结论 不同地区 Hp菌株的 ure A、ure B存在程度不同的变异 ,克隆并表达 HPSH4的 ure A、ure B与 Gen Bank已公布的多数 Hp菌株有极高同源性 ,在 E.coli以融合蛋白高效表达 rure A和 rure
- 翁康生周名权吕小枫陆晔刘国星
- 关键词:幽门螺杆菌基因克隆E.COLI遗传学
- 重组幽门螺杆菌ureA,ureB低温表达、纯化及抗原鉴定被引量:2
- 2003年
- 目的 :建立经济有效的方法 ,从大肠杆菌表达、纯化重组幽门螺杆菌尿素酶A、B亚单位。方法 :含重组表达质粒pGEX- 2T ureA ,pGEX - 2T ureB大肠杆菌分别在不同浓度IPTG、不同温度条件下作诱导培养 ,以SDS -PAGE分析表达产物 ,采用谷胱甘肽 -Sepharose 4B亲和层析分离纯化表达产物 ,以Western -blotting和ELISA对纯化产物作抗原性分析鉴定。结果 :IPTG诱导浓度为 0 .1mmol L ;诱导温度为 2 8℃ ,含重组质粒大肠杆菌表达可溶性融合蛋白GST -ureA、GST -ureB各约占总表达产物的 78%和87%。经亲和层析 ,得纯度 90 %以上的GST -ureA约为 14mg L ,GST -ureB约为 18mg L ;融合蛋白呈ureA、ureB抗原性反应。结论 :建立了低温诱导及纯化高纯度ureA、ureB基因表达产物的方法 ,所得纯化产物具有ureA、ureB抗原活性 ,为进一步的应用研究打下基础。
- 翁康生廖萍周名权吕小枫陆晔刘国星
- 关键词:幽门螺杆菌UREAUREB纯化抗原尿素酶
- 甲状腺癌患者血DNA甲基化分子标志物被引量:5
- 2012年
- [目的]探讨甲状腺癌患者血液中DNA甲基化情况,筛选出与甲状腺癌相关的甲基化分子标志物。[方法]收集上海地区14例甲状腺癌患者血液样本,10份正常对照血液样本,利用Illumina 27K甲基化芯片检测全血基因组DNA样本,得到甲状腺癌血液DNA甲基化谱,采用Fisher、Pearson和Wilcoxon检验等进行统计学和生物信息学分析。[结果]经病例组和对照组之间位点的甲基化差异分析,统计学筛选阈值选择P≤5×10-4时,29个基因在病例组中显著高表达(高甲基化);11个基因在病例组中低表达(低甲基化)。统计学筛选阈值选择P≤1×10-4时,则筛选出的差异甲基化基因(位点)总计8个,其中7个基因在病例组中显著高表达(高甲基化);1个基因在病例组中显著低表达(低甲基化)。构建甲状腺癌疾病诊断预测模型,在阈值为P≤1×10-4时筛选出来的8个差异甲基化基因对于疾病预测平均准确度达91.67%。[结论]血液中甲基化修饰异常的基因与甲状腺癌的发生发展有关,其有可能成为甲状腺癌血液诊断的分子标志物。
- 廖萍刘茶珍罗全勇王金普朱佩云翁康生顾国浩蒋敏吴凡王文静
- 关键词:表观遗传学甲状腺癌DNA甲基化分子标志物
- 分子生物学技术检测水中病毒被引量:5
- 2002年
- 对饮用水、环境水源乃至各级污水中污染病毒的检测,是预防控制疾病、评估水源卫生质量、环境卫生状况的一项有价值的工作.
- 翁康生陆晔刘国星周名权
- 关键词:分子生物学病毒检测水源卫生分子病毒学
- 临床患者与环境分离铜绿假单胞菌对消毒剂抗力水平及相关耐药基因的检测
- 目的了解临床患者和环境分离的铜绿假单胞菌对常用二氯异氰脲酸与苯扎溴铵消毒剂的抗力水平与携带耐消毒剂基因情况,指导合理使用消毒剂,以降低耐药菌扩散及医院感染的发生。方法调查收集2008年1-6月上海市一所二级医院临床患者标...
- 葛忆琳黄伟翁康生江宁沈伟朱仁义
- 文献传递
- 几种用于发现未知病毒核酸序列的技术及其应用
- 2007年
- 翁康生
- 关键词:病毒核酸序列传染性疾病病原体
- 肺癌患者血清差异表达蛋白及其在高危人群中的筛选研究
- 王文静项翠琴卢伟陆晔张一心廖萍赵学维刘茶珍朱佩云刘国星张胜年陈纪刚陈海泉黄金麟胡衡翁康生
- 该研究采用SELDI-TOF-MS技术通过比较肺癌患者和年龄性别匹配的正常人群的血清蛋白表达谱的差异,成功建立了肺癌患者特征血清蛋白质组图谱,发现了质荷比为4.2KDa和7.7Kda的蛋白分子为肺癌两个特异性标志物;从血...
- 关键词:
- 关键词:肺癌血清差异蛋白蛋白质组