王文静 作品数:141 被引量:531 H指数:11 供职机构: 上海市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 上海市教育委员会创新基金 上海市教育委员会重点学科基金 上海市自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 一般工业技术 理学 更多>>
微量血DNA提取前处理方法改良的探讨 被引量:3 2001年 王文静 项翠琴 汪根盛 秦逸秋关键词:DNA提取 PCR 微量血 上海2~6岁肥胖/超重儿童肠道菌群多样性和物种组成的病例-对照研究 2024年 [背景]多项研究表明肠道微生物菌群组成上的变化与肥胖关系密切,但儿童研究较少,且研究结果受到种族、地理位置等因素的影响。[目的]在上海市2~6岁儿童人群中进行肠道微生物菌群多样性分析,观察肥胖/超重与正常体重儿童之间肠道微生物菌群分布特点及物种差异,探讨肥胖/超重与肠道菌群多样性的关联。[方法]采集上海市74例2~6岁儿童粪便样本,其中肥胖/超重18人,男性6人,女性12人(男女比例为1∶2);正常体重56人,男性18人,女性38人(男女比例约为1∶2)。提取粪便样品中细菌的16S rDNA,进行PCR扩增、文库构建和高通量测序。采用Naive Bayes算法对扩增子序列变异(ASV)的代表序列及丰度信息进行物种分类学分析(门、纲、目、科、属、种)、群落多样性(Sobs指数、Shannon指数、Shannoneven指数、Coverage指数、PD指数、主坐标分析)分析等。运用Wilcoxon秩和检验、P值多重检验校正、相似性分析检验等对两组进行差异分析,获得儿童肠道菌群组成分布特点及物种差异信息。[结果]共计完成74个粪便样本的测序并对测序结果进行质控和过滤,获得优化序列4905306条,得到1860个ASVs。对ASVs进行多样性数据分析,得到8个分类学水平的物种注释结果889个。α多样性分析表明肥胖/超重儿童群落丰富度(Sobs指数)、多样性(Shannon指数)、均匀度(Shannoneven指数)、谱系多样性(PD指数)均比正常体重儿童有所上升,但是两组无统计学差异(P>0.05)。β多样性分析显示两组微生物物种组成组间差异不大,未见明显聚类。从门、目、科、属四种分类学水平上对74例样本进行物种组成分析,结果显示两组肠道菌群都存在一致的核心菌群结构,但是菌群组成有差异。两组间菌群组成差异表现在目、科、属这三个分类学水平上,其中厚壁菌门下的丹毒丝菌目丹毒荚膜菌科的丹毒丝菌属UCG003、链型杆菌属在OB_OW� 廖萍 严沁 张奕 何欣 朱佩云 齐健 刘茶珍 刘桐 施燕 王文静关键词:微生物菌群 儿童 超重肥胖 血清蛋白质质谱辅助孤立性肺结节的诊断 被引量:3 2006年 目的采用表面增强激光解析离子-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术建立肺腺癌患者血清蛋白质质谱,筛选出相对特异标记物,探讨其用于辅助诊断孤立性肺结节的意义。方法肺腺癌患者71例,均经手术病理证实;正常志愿者71名,按照性别、年龄、吸烟史与71例肺腺癌患者配对。用WCX2芯片检测各血清标本,筛选肺腺癌相对特异性蛋白质峰。孤立性肺结节患者53例,其中28例接受手术治疗,根据术后病理诊断验证筛选出的肺腺癌相对特异性蛋白用于辅助诊断孤立性肺结节的意义。结果与正常志愿者比较,肺腺癌患者有5个显著高表达的相对特异性蛋白质,其相对分子质量分别为4047.79、4203.99、4959.81、5329.30和7760.12。28例接受手术治疗的孤立性肺结节患者中,有24例术后病理为肺腺癌,证实筛选出的5种肺腺癌相对特异性蛋白质具有较高的诊断价值。结论SELDI-TOF-MS技术是一种快速、简便易行且高通量的分析方法,能直接筛选出肺腺癌患者血清中相对特异的潜在标记物,将其用于辅助诊断孤立性肺结节可能具有较好的临床应用前景。 罗晓阳 陈海泉 孙艺华 周建华 王文静 廖萍 项翠琴关键词:肺腺癌 生物标记物 SELDI-TOF-MS技术 肺结节 蛋白质组学及其研究技术在肺癌分子生物标志物研究中的应用 被引量:1 2006年 肺癌是全球发病率和死亡率较高的恶性肿瘤。细胞从正常状态转变为肿瘤的过程中,细胞内蛋白质表达谱必然会发生一系列变化,肿瘤分子标记物就是细胞在非正常状态下产生的分子。以高通量结合生物信息学为特点的蛋白质组学分析技术可以从细胞整体水平上检测到这种变化。近年来,为了降低肺癌的死亡率并提高其治疗效果,研究人员利用这一新的手段如利用激光捕获显微切割技术和双相凝胶电泳结合基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALD I-TOF MS)和表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELD I-TOF MS)寻找有效的肺癌标记物。本文对蛋白质组学技术在肺癌生物标志物研究中的应用作了综述。 乔滨 王文静关键词:蛋白质组学 肺癌 肿瘤生物标志物 移动电话微波辐射强度及屏蔽效果评价 被引量:5 1998年 移动电话因其使用方便、迅捷,倍受欢迎。据波兰《选举报》1997年底报道,一些国家和地区每100人拥有手机数:芬兰42、挪威38。以色列37、瑞典35、澳大利亚31、丹麦30、新加坡26、日本23、美国21。我国已越来越多的人使用移动电话。据报道,北京... 龙云芳 程崇泉 李昌吉 王文静 张应龙关键词:移动电话 屏蔽效果 应用SELDI—TOF—MS技术联合CT鉴别肾脏良恶性占位 被引量:5 2008年 目的探讨表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-Ms)技术在肾脏占位的良恶性鉴别诊断中的应用以及联合CT进行鉴别诊断的价值。方法96例血清标本取自62例肾癌和34例肾脏良性占位患者,患者术前均接受过CT检查。应用SELDI-TOF-MS技术获得所有患者的金属亲和-铜离子(IMAC-Cu^2+)蛋白芯片的表达图谱,随机采用42例肾癌和22例肾脏良性占位患者的血清蛋白质谱建立决策树诊断模型,并用其余患者进行双盲验证。结果利用质荷比分别为4657.56、2955.95和3278.00的3个蛋白峰建立了1个决策树诊断模型,其敏感性为85.7%(36/42).特异性为90.9%(20/22),双盲法验证后的敏感性为75.0%(15/20),特异性为83.3%(10/12)。而联合CT的诊断结果,建模组和验证组的诊断特异性和阳性预测值均可达100%。结论利用质荷比分别为4657.56、2955.95和3278.00的3个蛋白峰所建立的诊断决策模型有助于鉴别肾脏占位的良恶性,联合临床CT诊断可明显提高诊断的效率。 徐罡 项翠琴 陆晔 康晓楠 王文静 廖萍 丁强 张元芳关键词:血清学试验 慢性肾衰竭患者尿液相关蛋白标志物研究 被引量:6 2011年 目的采用表面增强激光解吸离子化-飞行时间-质谱(surface enhanced laser desorption and ionizationtime of flight mass spectrometry,SELDI-TOF—MS)技术研究慢性肾衰竭(CRF)患者的尿液相关蛋白标志物。方法采集150例CRF患者和50例健康人的尿液,采用H4蛋白芯片技术进行尿液蛋白质组学研究;用蛋白芯片阅读器PBSII对芯片进行扫描、分析。结果CRF组与健康对照组尿液样本的蛋白质图谱在质荷比(M/Z)1000—20000范围内检测到141个差异有统计学意义的蛋白峰(均P〈0.01)。经生物信息学分析建立CRF尿液蛋白预测模型,得到M/Z4649.81和M/Z9536.92两个差异蛋白峰组成的生物标记物可以将CRF组和健康对照组样本较好地分类,其正确率为96.0%,敏感性为100.0%,特异性为94.7%。CRF组与健康对照组尿液中差异蛋白峰经SwissProt数据库鉴定,可能为17种蛋白质。结论筛选出CRF的尿液候选蛋白标志物并建立了CRF尿液蛋白预测模型,通过数据库对尿液候选蛋白标志物进行了鉴定,为CRF的早期临床诊断提供了依据。 郝一鸣 洪名超 王文静 乔滨 金亚明 王忆勤关键词:尿液 绿茶及绿茶多酚抗羟自由基诱导的大鼠肝脂质过氧化作用 被引量:3 1996年 本研究采用Fe2+,H2O2反应生成OH·诱导大鼠离体肝脏脂质过氧化反应体系,用GT和GTP作为抗氧化剂观察对肝脂质过氧化的阻抑作用。随GT和GTP浓度的升高对MDA的抑制率分别为0.774~0.892,0.814~0.976,浓度与MDA之间存在剂量效应关系。 罗素琼 杨青 吴玲 王文静关键词:绿茶 绿茶多酚 脂质过氧化 2型糖尿病及糖耐量减低者外周血白细胞端粒长度及影响因素 2018年 [目的]探讨糖尿病发展过程中外周血白细胞端粒长度的变化及其影响因素。[方法]以2012—2014年上海市杨浦区市东医院招募的387例志愿者为研究对象,其中2型糖尿病(T2DM)患者65例、糖耐量减低(IGT)者112例、正常对照210例,进行问卷调查、体格检查和血液生化指标检测,提取外周血白细胞基因组DNA,采用实时荧光定量PCR法检测端粒长度。采用多元线性回归分析影响端粒长度变化的因素。[结果]T2DM组和IGT组的体质量指数、空腹血糖、餐后2h血糖、糖化血红蛋白均高于对照组,但其端粒相对长度分别为0.70±0.09和0.88±0.10,均低于对照组(1.06±0.22)(均P<0.05)。多元线性回归分析显示:T2DM组的年龄、体质量指数、空腹血糖和餐后2h血糖与端粒相对长度呈负相关(b=-0.042、-0.006、-0.037、-0.034,均P<0.05);IGT组的年龄和餐后2h血糖与端粒相对长度呈负相关(b=-0.041、-0.042,均P<0.05)。[结论]端粒长度缩短可能是T2DM发生的一个危险因素。端粒长度缩短不仅受到年龄和体质量指数的影响,而且受到血糖水平的影响。 刘茶珍 阮晔 朱佩云 葛军 孟健 王文静关键词:2型糖尿病 糖耐量减低 端粒长度 年龄 体质量指数 PMA-qPCR定量检测畜禽肉类中沙门菌活菌的研究 被引量:10 2015年 目的将叠氮溴化丙锭(PMA)与实时荧光定量聚合酶链反应(q PCR)相结合定量检测畜禽肉类中活的沙门菌。方法通过优化光反应时间、PMA浓度等PMA作用条件,建立PMA-q PCR方法,构建重组质粒建立标准曲线,考察该方法的灵敏性、特异性,并将该方法用于定量检测未经增菌培养的畜禽肉类样品中的沙门菌。结果在PMA浓度为15μg/m L、曝光5 min的条件下可完全抑制样品中死菌DNA的扩增。建立的定量标准曲线循环阈值(Ct值)与质粒标准品模板的拷贝数呈良好线性关系(r2=0.997 9),最低可检出10拷贝/反应体系。所建立的PMAq PCR方法最低可检出21拷贝/μL沙门菌。采用PMA-q PCR检测人工染菌鸡肉样品,最低可检出103CFU/m L沙门菌。结论用PMA-q PCR方法可实现定量检测畜禽肉类样品中活的沙门菌,从而达到快速检测的目的。 於颖 王文静 陆晔关键词:沙门菌 活菌 荧光定量聚合酶链反应