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慢性牙周炎龈下菌斑和唾液微生物群落分析被引量：9: 2011年; 目的:运用DGGE技术检测慢性牙周炎龈下菌斑和唾液微生物群落结构,分析其菌群之间的关系。方法:选取34名慢性牙周炎志愿者,分别采集龈下菌斑和唾液样本,采用PCR扩增细菌16Sr RNA V3区后,运用DGGE技术分析各组样本微生物群落结构。通过数字化软件Im age J将DGGE凝胶图谱转成数字信息,对所得矩阵进行主成分分析(Princ ipal ComponentAnalysis,PCA)、聚类分析(C luster Analysis)和偏最小二乘法(Partial Least Squares,PLS)分析。结果:DGGE图谱显示:龈下菌斑DGGE条带数目为11～28,,平均19;唾液DGGE条带数目为11～24,平均17;PCA结果显示:龈下菌斑与唾液比较有明显的差异;聚类分析显示:龈下菌斑、唾液形成5个明显聚类群,在同一聚类群中相似度高,在不同聚类群中相似度低,表示龈下菌斑与唾液菌群之间有显著差异;PLS结果显示:慢性牙周炎龈下菌斑与唾液菌群有显著差异。结论:DGGE是一种能直观显示微生物群落的指纹技术。通过该技术能检测牙周、唾液微生物群落的结构和组成,本结果显示,慢性牙周炎龈下菌斑与唾液微生物群落结构有明显差异。; 刘莹吴明桃陈慧庞小燕赵立平唐子圣; 关键词：微生物群落龈下菌斑唾液 DGGE 慢性牙周炎

口腔龈上菌斑5种DNA提取方法的比较被引量：3: 2011年; 目的寻找方便、快捷、经济、获取细菌信息量最多的细菌基因组DNA抽提方法。方法采用洗涤+冻融+BeadBeater+酚氯仿抽提法(X法)、试剂盒法(Y法)、洗涤+冻融+试剂盒法(Z法)、直接煮沸法(U法)和加Chelex-100后煮沸法(V法)5种DNA抽提方法,分别提取3例慢性牙周炎患者龈上菌斑DNA,检测DNA片段大小和浓度;同时运用变性梯度凝胶电泳分析样本微生物多样性和相似度,从多个角度对5种DNA提取方法进行评价。结果 X法DNA片段集中于3 000～20 000bp处;Y法和Z法DNA片段均匀分布于500～20 000 bp处;U法无明显DNA片段出现;V法DNA片段主要分布于500～2 000 bp处。Y法、Z法与V法所提DNA浓度较高,X法与U法所提DNA浓度较低。X法、Y法、Z法和V法反应的龈上菌斑微生物多样性无显著差异。X法、Y法和Z法的相似度较高,而V法与X法、Y法、Z法的相似度较低。结论洗涤+冻融+Bead Beater+酚氯仿抽提法,试剂盒法,洗涤+冻融+试剂盒法,加Chelex-100后煮沸法的DNA提取效果无显著差异;直接煮沸法的DNA提取效果较差。; 刘莹吴明桃陈慧庞小燕赵立平唐子圣; 关键词：DNA提取

实时定量PCR结合DGGE检测慢性牙周炎患者不同生境中的牙龈卟啉单胞菌和齿垢密螺旋体被引量：10: 2018年; 目的:利用实时定量PCR结合变性梯度凝胶电泳技术(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)检测慢性牙周炎患者不同生境中牙龈卟啉单胞菌、齿垢密螺旋体。方法:选取30名慢性牙周炎志愿者,分别采集龈上菌斑、龈下菌斑及唾液样本,运用DGGE技术比较分析各组样本微生物群落结构。通过偏最小二乘法(partial least squares,PLS)分析,得出不同生境相关优势条带,并对其进行克隆、测序分析,确定相应最近邻居。采用实时定量PCR技术对龈下菌斑与龈上菌斑、龈下菌斑与唾液中牙龈卟啉单胞菌及齿垢密螺旋体进行定量检测分析。结果:实时定量PCR定量检测结果显示,龈下菌斑中牙龈卟啉单胞菌及齿垢密螺旋体含量高于龈上菌斑和唾液。结论:实时定量PCR技术结合DGGE技术能更好的诠释微生物群落信息。; 邹岩刘莹刘莹漆正楠唐子圣漆正楠吴明桃; 关键词：实时定量PCR 牙周炎牙龈卟啉单胞菌齿垢密螺旋体

运用DGGE分析慢性牙周炎患者唾液微生物群落结构被引量：7: 2012年; 目的运用变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)技术,分析慢性牙周炎患者唾液中微生物群落结构。方法采集33名慢性牙周炎志愿者(P组)和15名非慢性牙周炎志愿者(NP组)唾液样本,共计48份。运用DGGE技术分析两组样本微生物群落结构,然后将DGGE凝胶图谱转化成数字信息,进行主成分分析(Principal Component A-nalysis,PCA)、聚类分析(Cluster Analysis)和偏最小二乘法(Partial Least Squares,PLS)分析。结果 PCA显示P组和NP组没有形成两个明显的聚类群;聚类分析显示两组大部分样本没有形成聚类现象,但少数样本形成聚类现象;PLS显示两组大部分样本形成聚类现象,仅少数样本没有形成聚类现象。结论慢性牙周炎组和非慢性牙周炎组的唾液微生物群落结构没有显著差异,但存在产生差异的趋势。; 吴明桃徐晓陈慧庞小燕赵立平唐子圣; 关键词：慢性牙周炎变性梯度凝胶电泳唾液微生物群落

变性梯度凝胶电泳技术在口腔微生物研究中的应用被引量：1: 2010年; 变性梯度凝胶电泳(Denatured Gradient GelElectrophoresis,DGGE)技术是一种能将大小相同而序列不同的DNA分子分离的分子生物学技术,无需经过传统培养方法,便能分析环境和人体微生态菌群的组成和结构,具有高通量、省时、经济等优点。该文从该技术在根管感染、龋病、牙周微生物、口腔生物膜等方面的应用进行综述。; 吴明桃徐晓唐子圣; 关键词：变性梯度凝胶电泳龋病根管感染

慢性牙周炎患者龈下菌斑和龈上菌斑微生物群落分析被引量：17: 2015年; 目的:分析慢性牙周炎患者龈下菌斑和龈上菌斑微生物群落结构。方法:30名慢性牙周炎患者,分别采集龈上菌斑和龈下菌斑,运用DGGE技术分析两组样本微生物群落结构,采用聚类分析(CA)、偏最小二乘法(PLS)找出两组间存在明显差异的条带,通过测序确定与区别条带最相近的微生物。结果:CA和PLS结果均显示慢性牙周炎患者龈下菌斑和龈上菌斑微生物群落结构存在显著差异;测序结果显示,福赛斯坦纳菌、牙龈卟啉单胞菌、齿垢密螺旋体、龈沟产线菌、卡氏卟啉单胞菌、普氏菌属、简明弯曲菌是龈下菌斑的相关优势菌,而索氏密螺旋体和有害新月形单胞菌是龈上菌斑的相关优势菌。结论:慢性牙周炎患者龈下菌斑和龈上菌斑微生物群落存在生物多样性及差异。; 吴明桃刘莹漆正楠邹岩尹君庞小燕唐子圣; 关键词：DGGE 龈下菌斑

基因芯片技术分析慢性根尖周炎患牙产黑色素菌被引量：7: 2009年; 目的:利用基因芯片技术分析慢性根尖周炎患牙根管中牙髓卟啉单胞菌(Porphyromonas endodontalis,Pe)、牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)和中间普氏菌(Prevotella intermedia,Pi)三种产黑色素菌(black-pigmented bacteria,BPB)。方法:收集76例慢性根尖周炎患牙根管细菌学样本,经DNA抽提,PCR荧光标记后,与点样有Pe、Pg和Pi三种菌特异寡核苷酸探针的基因芯片进行杂交,用激光共聚焦扫描仪分析杂交结果,最后进行统计分析。结果:慢性根尖周炎患牙中Pe、Pg和Pi三种菌的检出率分别为48.68%,32.89%,42.11%。Pe和Pg两菌同时被检出具有统计学意义(p<0.05)。Pe和Pg与瘘管显著相关(p<0.01),Pe和Pg同时感染与瘘管、脓肿显著相关(p<0.01)。结论:产黑色素菌与慢性根尖周炎关系密切,Pe、Pg和瘘管、脓肿显著相关。用基因芯片技术分析慢性根尖周炎患牙中细菌具有快速、灵敏、高效的特点,而且可以通过增加基因芯片上探针数目扩展被检出菌的种类。; 唐子圣曹慧敏刘正江禾吴明桃赵建龙梁景平; 关键词：基因芯片慢性根尖周炎

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吴明桃

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