公共文化服务平台

庞小燕: 作品数：45 被引量：262H指数：9; 供职机构：上海交通大学更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划上海市科学技术委员会资助项目更多>>; 相关领域：医药卫生生物学文化科学轻工技术与工程更多>>

合作作者

口腔龈上菌斑5种DNA提取方法的比较被引量：3: 2011年; 目的寻找方便、快捷、经济、获取细菌信息量最多的细菌基因组DNA抽提方法。方法采用洗涤+冻融+BeadBeater+酚氯仿抽提法(X法)、试剂盒法(Y法)、洗涤+冻融+试剂盒法(Z法)、直接煮沸法(U法)和加Chelex-100后煮沸法(V法)5种DNA抽提方法,分别提取3例慢性牙周炎患者龈上菌斑DNA,检测DNA片段大小和浓度;同时运用变性梯度凝胶电泳分析样本微生物多样性和相似度,从多个角度对5种DNA提取方法进行评价。结果 X法DNA片段集中于3 000～20 000bp处;Y法和Z法DNA片段均匀分布于500～20 000 bp处;U法无明显DNA片段出现;V法DNA片段主要分布于500～2 000 bp处。Y法、Z法与V法所提DNA浓度较高,X法与U法所提DNA浓度较低。X法、Y法、Z法和V法反应的龈上菌斑微生物多样性无显著差异。X法、Y法和Z法的相似度较高,而V法与X法、Y法、Z法的相似度较低。结论洗涤+冻融+Bead Beater+酚氯仿抽提法,试剂盒法,洗涤+冻融+试剂盒法,加Chelex-100后煮沸法的DNA提取效果无显著差异;直接煮沸法的DNA提取效果较差。; 刘莹吴明桃陈慧庞小燕赵立平唐子圣; 关键词：DNA提取

如何在高校生物教学中组织社会热点问题的课堂讨论: 在课堂上组织学生们对社会热点问题进行科学讨论,这是培养学生理性思维,掌握更全面知识体系的重要过程。在教学中,我们通过一般性讨论提出问题,引导学生查阅文献进行深入辩论,对社会热点问题得出科学结论,再通过实地参观巩固辩论成果...; 庞小燕石建新乔中东; 关键词：课堂讨论; 文献传递

慢性牙周炎龈下菌斑和唾液微生物群落分析被引量：9: 2011年; 目的:运用DGGE技术检测慢性牙周炎龈下菌斑和唾液微生物群落结构,分析其菌群之间的关系。方法:选取34名慢性牙周炎志愿者,分别采集龈下菌斑和唾液样本,采用PCR扩增细菌16Sr RNA V3区后,运用DGGE技术分析各组样本微生物群落结构。通过数字化软件Im age J将DGGE凝胶图谱转成数字信息,对所得矩阵进行主成分分析(Princ ipal ComponentAnalysis,PCA)、聚类分析(C luster Analysis)和偏最小二乘法(Partial Least Squares,PLS)分析。结果:DGGE图谱显示:龈下菌斑DGGE条带数目为11～28,,平均19;唾液DGGE条带数目为11～24,平均17;PCA结果显示:龈下菌斑与唾液比较有明显的差异;聚类分析显示:龈下菌斑、唾液形成5个明显聚类群,在同一聚类群中相似度高,在不同聚类群中相似度低,表示龈下菌斑与唾液菌群之间有显著差异;PLS结果显示:慢性牙周炎龈下菌斑与唾液菌群有显著差异。结论:DGGE是一种能直观显示微生物群落的指纹技术。通过该技术能检测牙周、唾液微生物群落的结构和组成,本结果显示,慢性牙周炎龈下菌斑与唾液微生物群落结构有明显差异。; 刘莹吴明桃陈慧庞小燕赵立平唐子圣; 关键词：微生物群落龈下菌斑唾液 DGGE 慢性牙周炎

复合低温保护剂对粪菌液中活细菌的保护效果被引量：1: 2021年; 冻存的供体粪菌液样品已在多项粪菌移植临床试验中使用,而添加低温保护剂有助于提高样品菌群的存活率和储存稳定性。为获得效果更好的保护剂配方,本文采用微生物培养结合16S rRNA测序技术,从活菌数、菌群多样性和组成等方面探究10%甘油(G)、5%海藻糖(T)以及10%甘油+5%海藻糖(GT)等3种保护剂组合对粪菌液样品细菌活力的保护能力。结果表明,经过-80℃冻存2个月,添加保护剂后细菌的存活率(11.27%~87.25%)均高于不加保护剂的(5.20%),且GT组的活细菌数最高;其次,添加保护剂后菌群多样性与冻存前无显著差异,且GT组中检测到的扩增序列变体(amplicon sequence variants,ASVs)数目与冻存前最接近;而冻存前后的菌群结构虽有显著差异,但GT组的菌群组成结构与冻存前相似,优势菌属Bifidobacterium、Escherichia/Shigella、Klebsiella的丰度与新鲜组无显著差异,同时GT组还提高了Streptococcus以及短链脂肪酸产生菌Bacteroides、Blautia和Faecalibacterium等的相对丰度,保护的细菌类型相比单一保护剂更广。综上,由甘油和海藻糖组成的复合保护剂能更好地保持粪菌液中细菌的活性,具有应用潜力。; 陈傲蕾胡赢心张雅洁庞小燕; 关键词：低温保护剂甘油海藻糖

应用PCR与温度梯度凝胶电泳分析龈上菌斑微生物群落被引量：3: 2005年; 目的应用PCR与温度梯度凝胶电泳(PCRTGGE)分子技术对成年健康口腔的龈上菌斑中微生物群落组成进行分析。方法8例成年个体包括4男4女,年龄19～29岁,分别采取每例个体上下颌牙周龈上菌斑样品,共18份(个体Subl间隔10天采集2次样品)。提取菌斑DNA,PCR扩增16SrDNAV3可变区,产物经TGGE后进行相似系数分析。结果同一个体的上下颌微生物群落组成相似性系数为81%～95%,而不同个体的龈上菌斑微生物群落组成相似性系数,均在60%以下。结论不同个体具有其独特的牙周微生物群落,而且在一定时期内组成稳定。; 洪纬魏桂芳庞小燕王凌华赵立平; 关键词：菌斑牙周 PCR 成年 TGGE 微生物群落

运用DGGE分析慢性牙周炎患者唾液微生物群落结构被引量：7: 2012年; 目的运用变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)技术,分析慢性牙周炎患者唾液中微生物群落结构。方法采集33名慢性牙周炎志愿者(P组)和15名非慢性牙周炎志愿者(NP组)唾液样本,共计48份。运用DGGE技术分析两组样本微生物群落结构,然后将DGGE凝胶图谱转化成数字信息,进行主成分分析(Principal Component A-nalysis,PCA)、聚类分析(Cluster Analysis)和偏最小二乘法(Partial Least Squares,PLS)分析。结果 PCA显示P组和NP组没有形成两个明显的聚类群;聚类分析显示两组大部分样本没有形成聚类现象,但少数样本形成聚类现象;PLS显示两组大部分样本形成聚类现象,仅少数样本没有形成聚类现象。结论慢性牙周炎组和非慢性牙周炎组的唾液微生物群落结构没有显著差异,但存在产生差异的趋势。; 吴明桃徐晓陈慧庞小燕赵立平唐子圣; 关键词：慢性牙周炎变性梯度凝胶电泳唾液微生物群落

一种快速的酸奶质量跟踪监测检验新方法被引量：1: 2005年; 分析酸奶中的菌种组成是酸奶质量控制的重要指标。本文用PCR-DGGE(denaturinggra-dientgelelectrophoresis,变性梯度凝胶电泳)指纹图谱技术对市售某品牌酸奶在1个月内进行了动态监测,共收集了6个生产批次的18个酸奶样品,通过建立16SrDNAV3区PCR-DGGE分析、DGGE图谱条带割胶回收测序等一套完整的检测评价方法,结合常规分离培养方法,对样品微生物组成及其稳定性进行跟踪监测。结果显示,所有供试样品在整个动态监测期内DGGE指纹图谱都出现2条带,显示其微生物组成比较稳定,割胶回收测序结果表明其微生物组成与厂家标注完全一致,分别为Lacto-bacillusdelbrueckiisubsp.bulgaricus(保加利亚乳杆菌)和Streptococcusthermophilus(嗜热链球菌)。分离计数结果表明前者比后者低3个数量级,二者的DGGE条带亮度也有显著差别。本研究用菌种组成及其稳定性两个指标对酸奶样品质量进行评价,建立了DGGE评价方法,结果表明,该技术可以作为酸奶质量控制和动态监测的快速简便的新方法。; 李武王凌华张晓君庞小燕赵立平赵勇; 关键词：酸奶 LACTOBACILLUS 指纹图谱技术

健康儿童与轮状病毒感染儿童肠道菌群结构的比较研究被引量：10: 2006年; 目的比较分析轮状病毒感染个体与健康个体肠道菌群结构的差异。方法采集11例轮状病毒感染个体及6例健康个体的粪便样品,提取粪便样品中细菌的混合DNA,先通过ER IC-PCR结合分子杂交的技术分析两组个体之间肠道微生物组成的相似性;再扩增粪便样品中菌群的16S rRNA基因,利用PCR-TGGE技术分析肠道菌群的组成情况。结果轮状病毒感染个体与健康个体相比,肠道菌群中GC含量较低的菌明显减少,同时肠道菌群有宿主专一性。结论轮状病毒感染会导致儿童肠道内菌群结构失调。; 张美玲杜惠敏郭美蕻陈俊仪庞小燕赵立平; 关键词：轮状病毒 ERIC-PCR

基于属特异性PCR基础上的TGGE和克隆文库方法分析人粪便中双歧杆菌的组成: 双歧杆菌是一类严格厌氧的革兰氏阳性菌。作为人胃肠道菌群的优势成员,双歧杆菌与人的健康密切相关,在防止腹泻和肠道感染、缓和便秘、提高机体免疫力和促进维生素代谢等方面起着重要的生理作用。因此,研究如何通过口服特定的双歧杆菌(...; 庞小燕赵立平; 关键词：双歧杆菌 TGGE 克隆文库; 文献传递

膳食诱导肥胖大鼠模型的肠道菌群结构及其特异分子标识物被引量：3: 2009年; 目的通过对膳食诱导肥胖(Diet Induced Obesity,DIO)大鼠与健康对照组大鼠的肠道菌群结构的分析比较,寻找造成2组大鼠菌群结构差异的分子标识物,探讨肠道菌群的组成和结构与宿主肥胖之间的关系。方法ERIC-PCR结合Southern-blot得到肠道菌群基因组指纹图谱,利用Southern-blot与多元统计方法(PCA、PLS等)找出差异条带,回收差异条带进行测序,根据序列设计特异性引物,以定量PCR法对结果进行验证。结果ERIC-PCR图谱表明膳食诱导肥胖大鼠在肠道菌群结构上与正常大鼠存在着较大的区别;根据杂交结果找到一段基因组DNA片段为膳食诱导肥胖大鼠组所特有,定量分析表明该DNA片段在2组大鼠间区别明显。结论膳食诱导肥胖大鼠所特有的一段基因组DNA片段可作为肥胖大鼠肠道的特征分子标识物,该标识物有望用于膳食诱导肥胖的机制研究中。; 张翼张晨虹申剑李后开倪艳张晓君赵立平庞小燕; 关键词：肥胖高脂膳食 ERIC-PCR 肠道菌群

庞小燕

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

庞小燕

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈