金志华 作品数:129 被引量:473 H指数:13 供职机构: 浙江大学宁波理工学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 浙江省自然科学基金 浙江省科技攻关计划 更多>> 相关领域: 化学工程 生物学 轻工技术与工程 医药卫生 更多>>
工科专业的生物信息学课程教学改革研究 被引量:1 2017年 针对生物信息学的学科特点和教学现状,结合浙江大学宁波理工学院工科专业该课程的教学实践,初步对课程教学内容、教学方法和考核方法进行了积极探索,重点讨论了教学过程中如何强化理论与实践相结合,提高工科大学生的实践能力,旨在为该课程的有效教学提供参考。 金庆超 吴志革 金志华 杨郁关键词:生物信息学 教学 教学改革 利福霉素B产生菌的推理选育 被引量:6 2002年 利福霉素 B由地中海拟分枝酸菌产生,本文对工业生产菌株A.mediterranei XC1-02进行进一步筛选。采用推理选育的方法使产生菌减轻由芳香族氨基酸[色氨酸(trp)、苯丙氨酸、酪氨酸]和对羟基苯甲酸(PHBA,Phb)引起的对利福霉素B生物合成的反馈抑制作用,并提高对前体丙酸(prp)的耐受量。通过UV诱变提高诱变株的耐受性,获得了高产菌株A. mediterranei XC 9-25(trpt,phbt prpt),其生产能力达到 1000u/ml,较原始出发菌株A.mediterranei XC 1-02提高了 1.385倍。动力学试验结果表明利福霉素B的生物合成与菌体生长不同步,属于非生长偶联型。 金志华 岑沛霖 金一平 赵成建 张定丰关键词:利福霉素B 选育 生物合成 菌株 定点突变提高细胞色素P450 BM-3吲哚羟基化能力 被引量:4 2013年 为进一步提高细胞色素P450BM-3(A74G/F87V/L188Q)对吲哚的羟基化能力,根据酶结构与功能的关系,以突变酶E435T为基础,在168位点引入D168L突变,获得了吲哚羟基化能力得到显著提高的突变酶D168L/E435T。突变酶对吲哚的Km为1.72 mol·L-1(父本2.09 mol·L-1),转化数(kcat)为28.15min-1(父本4.04min-1),表明D168L定点突变可以略微提高酶对底物的亲和力,但主要的效应是促进了底物的转化速率,这两个效应的综合表现是使酶的催化效率(kcatKm-1)比父本酶提高了8.48倍。此外,产物中副产物靛玉红的比例也降低为1.2%(父本7.3%),这说明该突变酶催化吲哚的区域选择性上也更有利于靛蓝的生成。 张彭湃 胡升 黄俊 梅乐和 雷引林 金志华 姚善泾关键词:细胞色素P450 定点突变 羟基化 吲哚 靛蓝 普那霉素高产相关基因的筛选 被引量:3 2008年 普那霉素是由始旋链霉菌(Streptomyces pristinaespiralis)产生的一类临床上应用的链阳性菌素类抗生素.目前,由于对引起普那霉素产量变化的分子机理知之甚少,从而大大限制了利用分子育种技术来大幅度提高该抗生素产量的研究发展.本研究利用限制性内切酶SacⅡ单酶切处理的扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术以普那霉素高产重组菌株为材料进行了抗生素高产相关基因的挖掘研究.以原始菌株ATCC25486为对照,筛选出2个仅在高产菌株中特异扩增的多态性DNA片段.进一步的DNA测序分析和同源性比较表明:1个与抗生素生物合成调控基因afsK具有高度的同源性,GenBank收录号为EU123927;另1个是脱氧核糖核酸外切酶编码基因exoSC的同源片段,GenBank收录号为EU123928.因此,这2个DNA片段是与普那霉素产量变化密切相关的新基因,这2个基因的DNA序列的变异应与普那霉素产量的增加密切相关.本研究从普那霉素高产这一生物表型出发,利用分子标记技术筛选出抗生素高产相关新基因,可进一步从基因变异方面揭示了普那霉素高产的分子机理. 金庆超 金志华 徐波 李宁慧 姚善泾关键词:普那霉素 高效降解嘌呤核苷乳酸菌的筛选及特性研究 被引量:11 2019年 采用乳酸菌对高尿酸血症及其相关病症进行辅助治疗,可以减轻严格饮食限制(传统治疗方法)对患者生活质量的影响。本研究以市售泡菜为材料,用HPLC法测定乳酸菌对肌苷和鸟苷的降解率,筛选出具有高效降解嘌呤核苷能力的乳酸菌。在筛选菌株中,菌株5-1的降解能力最强,对肌苷和鸟苷的降解率分别为89.37%和93.20%。该菌株经生理生化和16S rDNA测序鉴定为弯曲乳杆菌(Lactobacillus curvatus)。在pH 3或胆盐浓度0.3%的条件下处理4 h后,Lb.curvatus 5-1活菌数保持在107cfu/mL以上。另外,该菌株在人工胃肠液中展现出良好的耐受性,在肠液中的核苷降解能力与在缓冲液中的相当。因此,Lb. curvatus 5-1是开发高尿酸血症预防及辅助治疗的微生态菌剂的优良菌株,具有良好的应用前景。 麻菊美 赵伟睿 胡升 王康 黄俊 郑晓冬 金志华 梅乐和关键词:泡菜 乳酸菌 高尿酸血症 替考拉宁产生菌TA_(2-2)组分高含量菌种的推理选育 被引量:12 2000年 以缬氨酸氧肟酸为筛选剂 ,对替考拉宁产生菌替考游动放线菌 (Actinoplanes teichomyceticus)进行了推理选育 ,获得了发酵总效价和 TA2 - 2 组分含量均较出发菌株高的缬氨酸氧肟酸抗性变株 98- 1- 2 2 7。传代试验表明菌株 98- 1- 2 2 7的遗传特性较稳定。对菌株 98- 1- 2 2 7和出发菌株 97- 5 - 74的形态、生代特性进行了比较。 金志华 岑沛霖 王明蓉 胡宇杰 张俊琪关键词:替考拉宁 推理选育 一种利用卷积对话生成模型解决对话生成任务的方法 本发明公开了一种利用卷积对话生成模型解决对话生成任务的方法,包括如下步骤:针对于所要生成的对话的下一个词的上文,得到的单词的含义向量与单词的位置向量,相加,获取单词的综合表达向量;输入到结合了卷积层与门式线性单元结合的编... 赵洲 章璇 孟令涛 梁伟欣 金志华文献传递 一种精氨酸脱亚胺酶突变体及其编码基因和应用 本发明公开了一种精氨酸脱亚胺酶突变体及其编码基因和应用,属于分子生物学技术领域。所述精氨酸脱亚胺酶突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,编码基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明采用易错PCR技术... 吴志革 金志华 金庆超 杨郁 潘霞 李松浩文献传递 一种醛缩酶及其编码基因和应用 本发明公开了一种醛缩酶及其编码基因和应用。醛缩酶的氨基酸序列如SEQ ID No.1所示,其编码基因的碱基序列如SEQ ID No.2所示。所述应用是该醛缩酶在生产他汀类药物中间体中的应用。本发明在嗜热菌野生型醛缩酶的基... 金志华 吴志革 金庆超 杨郁 蔡伟 张鑫红 戎凯文献传递 抗生素发酵的若干微生物及工程问题研究 该文对原始霉素、替考拉宁和利福霉素B三种抗生素的菌种选育、发酵工艺、发酵放大及发酵动力学进行了研究.首先对原始霉素发酵培养基进行了优化.再根据原始霉素、替考拉宁和利福霉素B三种抗生素的生物合成及代谢调控原理分别对原始霉素... 金志华关键词:抗生素发酵 推理选育 动力学模型 替考拉宁 利福霉素B 丝状菌