李西雷
- 作品数:16 被引量:27H指数:4
- 供职机构:上海海洋大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金上海市地方高校能力建设项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 一种三角帆蚌外套膜目的基因的定位方法
- 本发明公开了一种三角帆蚌外套膜目的基因的定位方法,是将三角帆蚌外套膜组织进行原位杂交,根据外套膜组织原位杂交的结果对目的基因进行基因定位,所述的外套膜组织原位杂交所用的探针为针对目的基因的探针,所述的目的基因的序列如SE...
- 李家乐李西雷白志毅汪桂玲罗红瑞
- 文献传递
- 三角帆蚌3个免疫基因的克隆、分子特征分析及SNP的应用研究
- 三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)是我国最重要的淡水育珠蚌。随着近年来三角帆蚌养殖病害不断爆发,深入开展三角帆蚌功能基因的研究,尤其是免疫相关基因及其机制的研究并在此基础上寻找三角帆蚌疾病防治的有效方法对三...
- 李西雷
- 关键词:三角帆蚌免疫基因克隆分子特征SNP
- 文献传递
- 三角帆蚌GPX基因结构特征及抗性相关SNP的筛选被引量:3
- 2012年
- 根据三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)基因cDNA序列,通过PCR和基因组步移法,从三角帆蚌基因组DNA中扩增出GPX基因全长及其5′调控区。序列分析表明,该基因序列全长6 708 bp,含有2个外显子,1个内含子。5′调控区为992 bp,含有启动子的核心序列TATA盒以及其他一些转录调控元件,如AP1、C/EBP、CdxA。2个外显子长度分别为273 bp和991 bp,内含子长度为4 491 bp。通过直接测序法在三角帆蚌抗性群体和易感群体中筛选GPX基因的SNPs,并研究这些多态性位点与抗逆性状的相关性。共获得了16个SNP位点,其中启动子区的A-99G位点、A-86C位点、A-49C位点,内含子区的A2841T位点、C2847T位点、G3146C位点、A3150G位点以及G4645T位点共8个SNP位点的基因型频率和等位基因频率在抗性和易感群体中均存在显著性差异(P<0.05)。连锁不平衡分析结果显示GPX基因A-86C位点、A-49C位点、C2847T位点、A3150G位点与G4645T位点之间,以及A2841T位点与G3146C位点之间均存在强连锁不平衡。同时单倍型分析发现,在抗性群体中单倍型分别为ACTGT和TG的个体出现的频率显著高于易感群体中出现的频率。这些结果表明,GPX基因的部分SNPs可作为三角帆蚌抗病辅助育种的候选分子标记。
- 李西雷汪桂玲李家乐
- 关键词:三角帆蚌SNP抗性性状
- 干扰罗氏沼虾IAG基因表达的短链核糖核酸以及其应用
- 本申请公开了干扰罗氏沼虾IAG基因表达的短链核糖核酸以及其应用。该短链核糖核酸具有针对罗氏沼虾IAG基因3’‑UTR区的靶向性,能够与IAG基因转录的mRNA特异性结合,抑制IAG基因的表达。该短链核糖核酸可通过导入罗氏...
- 马克异钱红丽刘雪邱高峰李西雷付元帅
- 文献传递
- 干扰罗氏沼虾IAG基因表达的短链核糖核酸以及其应用
- 本申请公开了干扰罗氏沼虾IAG基因表达的短链核糖核酸以及其应用。该短链核糖核酸具有针对罗氏沼虾IAG基因3’‑UTR区的靶向性,能够与IAG基因转录的mRNA特异性结合,抑制IAG基因的表达。该短链核糖核酸可通过导入罗氏...
- 马克异钱红丽刘雪邱高峰李西雷付元帅
- 一种三角帆蚌外套膜组织切片的制备方法
- 本发明公开了一种三角帆蚌外套膜组织切片的制备方法,包括对三角帆蚌的外套膜组织进行固定、上行梯度乙醇脱水、透明、浸蜡、包埋、连续切片、烘烤、脱蜡、下行梯度乙醇复水,对切片组织进行苏木精-伊红染色后用中性树脂封片等步骤。本发...
- 李家乐李西雷白志毅汪桂玲罗红瑞
- 文献传递
- 添加类胡萝卜素对三角帆蚌总类胡萝卜素含量及贝壳珍珠质颜色的影响被引量:7
- 2018年
- 三角帆蚌贝壳珍珠质颜色与体内总类胡萝卜素含量(total carotenoids content,TCC)密切相关。为研究养殖中添加β-胡萝卜素对三角帆蚌总类胡萝卜素含量(TCC)及贝壳珍珠质颜色的影响,选用不同颜色选育系(紫色选育系和白色选育系)的三角帆蚌进行了为期40 d的养殖实验。通过设置4种浓度梯度(5、10、20、40 mg/L)分别进行添加实验。结果显示,随着类胡萝卜素添加量的增加,三角帆蚌肝胰腺和外套膜组织中TCC也相应增加,但不同颜色选育系三角帆蚌对类胡萝卜素的累积效果差异显著(P<0.05),实验40 d后,紫色选育系三角帆蚌贝壳珍珠质的各颜色参数(L*、a*、b*、C*和ΔE)之间均无显著差异,其中不同实验组之间随着类胡萝卜素添加量的增加,紫色选育系三角帆蚌边缘壳珍珠质颜色参数值a*、b*和C*呈现上升趋势,但无显著变化(P>0.05)。白色选育系三角帆蚌各实验组贝壳珍珠质的颜色参数值之间差异均不显著(P>0.05)。综上,紫色选育系三角帆蚌体内能够富集更高含量的类胡萝卜素,而白色选育系三角帆蚌对类胡萝卜素的富集能力较弱。
- 李西雷李西雷朱庭耀白志毅白志毅
- 关键词:三角帆蚌类胡萝卜素壳色
- 三角帆蚌hcSRCR1基因的克隆及在不同壳色选育系中的表达模式被引量:4
- 2018年
- 清道夫受体(SR)是一类对化学修饰的脂蛋白具有很强结合活性的糖蛋白家族。本研究通过RACE方法克隆得到三角帆蚌hcSRCR1基因cDNA序列,该序列全长1 000 bp,其中开放阅读框819 bp,编码272个氨基酸,预测分子量为28.16 ku,理论等电点为5.55;预测含有2个SRCR结构域和6个保守的半胱氨酸残基。qRT-PCR和Western blot结果显示,hcSRCR1 mRNA和蛋白表达模式基本相同,均在三角帆蚌外套膜中表达量最高,在其他组织中的表达量普遍较低,且在紫色选育系外套膜组织中的表达量显著高于白色选育系。外套膜原位杂交结果显示,hcSRCR1基因主要在外套膜外褶的内、外上皮细胞层以及腹膜处的上皮细胞层中表达。研究表明,三角帆蚌hcSRCR1基因与贝壳珍珠质颜色形成具有一定相关性,可为进一步研究该基因在珍珠颜色形成过程中的调控机理提供基础资料。
- 李西雷李西雷任名栋白志毅白志毅
- 关键词:三角帆蚌清道夫受体壳色基因克隆
- 三角帆蚌GPX基因cDNA全序列的克隆及其编码蛋白的结构分析被引量:5
- 2010年
- 根据本实验室构建的三角帆蚌cDNA文库中已标注的EST序列,利用cDNA末端快速扩增法(RACE)克隆了三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)基因cDNA全序列。序列分析表明,该基因cDNA序列全长1286bp,包括5′端非翻译区(Untranslated Region)39bp、3′端非翻译区659bp和开放阅读框(Open reading frame,ORF)588bp,共编码195个氨基酸,分子量约为22.2kDa,理论等电点为8.44,属于含硒类GPX。该氨基酸序列具有GPX所有亚型中均高度保守的3个环状结构,对酶的三级结构起稳定作用。在线分析结果表明:GPX的氨基酸序列不存在明显的疏水区,也不存在信号肽序列。氨基酸相似性对比结果显示,三角帆蚌GPX氨基酸序列与脊椎动物GPX-2及GPX-1的序列相似度较高,为73.1%-80.8%,与其他型GPX相似度较小,相似度低于60%。构建的系统进化树显示三角帆蚌GPX与其他几种鱼类GPX聚为一类,与其他已发表的几种软体动物GPX相距较远,推测本实验克隆的三角帆蚌GPX基因和已发表的软体动物不属于同一种GPX类型。
- 李西雷汪桂玲李家乐袁一鸣
- 关键词:三角帆蚌RACE编码蛋白
- 三角帆蚌IRF-2基因的克隆、分子特征及SNP分析
- 根据本实验室构建的三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)cDNA文库中已标注的EST序列,利用cDNA末端快速扩增法(RACE)克隆了三角帆蚌干扰素调节因子2(interferon regulatory fac...
- 李西雷汪桂玲白志毅李家乐
- 关键词:三角帆蚌RACESNP分子特征
- 文献传递