姚小军
- 作品数:54 被引量:164H指数:8
- 供职机构:兰州大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金海南省自然科学基金教育部“春晖计划”更多>>
- 相关领域:理学医药卫生自动化与计算机技术化学工程更多>>
- 基于定量结构-性质关系方法预测氨基酸的比旋光度被引量:4
- 2006年
- 运用定量结构-性质关系(quantitative structure-property relationsh ip,QSPR)方法对人体必需的氨基酸比旋光度进行了预测,同时运用交互检验(LOO)方法对所建立的模型进行了检验。应用启发式算法对描述符进行筛选并建立线性回归模型,所建立的模型的相关系数(R2)为0.918,但分别用+1、-1代表左旋和右旋的分子手性后,重新建立多元线性回归模型,其相关系数(R2)变为0.970。本研究所建立的QSPR模型为预测手性化合物比旋光度提供了一种有效的新方法。
- 王杰刘焕香司宏宗姚小军刘满仓胡之德
- 关键词:氨基酸定量结构-性质关系启发式算法多元线性回归
- 苯酚和苯甲酸及其衍生物在反胶束毛细管电动色谱中的分离及电泳行为
- 2007年
- 提出了以十二烷基硫酸钠/氯代正丁烷/正丁醇/水组成的反胶束体系作为分离介质,研究了17种苯酚和苯甲酸衍生物在反胶束缓冲体系中的电泳行为.结果表明:11种酚类化合物的表观电泳淌度及其离解常数存在良好的线性关系,线性方程为μ_(app)=-23.319pK_1+36.183(R=0.9556);利用启发式算法得出的17种苯酚和苯甲酸衍生物定量结构—表观电泳淌度的关系模型能够直观地得到影响分析物表观电泳淌度的参数,预测结果和实验结果具有良好的一致性。
- 王树民周雷王杰姚小军陈兴国胡之德
- 关键词:反胶束启发式算法
- 高效液相色谱-二极管阵列检测器-蒸发光散射检测器联用同时检测复方丹参片中三类有效成分(英文)
- 建立一种高效液相色谱-二极管阵列检测器-蒸发光散射检测器联用检测复方丹参片中3类 11中主要有效成分的定量测定方法.应用 HPLC-DAD-ELSD 联用技术,根据各类成分紫外吸收光谱的差异,分别在287,246,263...
- 魏玉辉姚小军武新安杜玮赵刚
- 关键词:高效液相色谱二极管阵列检测器蒸发光散射检测器复方丹参片活性成分
- 文献传递
- 分子模拟与光谱法研究愈创木酚和人免疫球蛋白的键合被引量:16
- 2007年
- 利用计算机模拟技术结合荧光增敏光谱法、圆二色谱法及傅立叶红外光谱法研究了愈创木酚与人免疫球蛋白的相互作用.分子模拟结果显示了愈创木酚与HIgG(Human Immunoglobulin)的键合机理和键合模式,表明维持药物与蛋白质的相互作用力主要是疏水作用和氢键(位于氨基酸残基LEU 80和ASP 65位).这与实验所得到的热力学参数判定作用力的结果相一致(依据范德霍夫公式计算得ΔH0与ΔS0的值分别为65.55kJ·mol-1和132.95J·mol-1·K-1).根据荧光增敏和偏振的有关方程分别求得不同温度下药物与蛋白相互作用的结合常数及结合位点数;从紫外光谱和同步荧光光谱获得的信息定性地讨论了药物与蛋白相互作用时药物对蛋白构型的影响,圆二色谱法和红外光谱法(红外去卷积谱和曲线拟合)的结果得到了定量的蛋白质二级结构变化数据.且利用Frster能量转移理论,求得药物与蛋白间的键合距离为4.57nm.此外,基于愈创木酚的荧光敏化效应,探讨了药物-蛋白质体系的几种物理化参数,包括电荷密度、离解常数(pKa)及量子产率的变化效应.
- 何文英姚小军刘鹏军高振霞胡之德
- 关键词:愈创木酚人免疫球蛋白分子模拟荧光增敏
- 异嗪皮啶与人γ球蛋白相互作用研究(英文)被引量:1
- 2009年
- 利用荧光光谱和FT-IR方法在体外研究了异嗪皮啶与人γ球蛋白(HGG)的相互作用,利用Sips和Gibbs-Helmholtz方程计算了不同温度下结合反应的亲和力常数和热动学参数,利用Docking方法研究了其相互作用模式。Sips图谱结果表明,异嗪皮啶与HGG之间主要存在两类结合位点,以及基于范德华力和氢键的非特异性的相互作用,而且结合反应是熵驱动的自发的放热结合过程。在297, 303,310,317 K下的亲和力常数分别为10.708,9.152,7.084,5.386 L/mol。利用FT-IR光谱方法计算了在异嗪皮啶加入前后HGG二级结构的含量变化,结果表明加入异嗪皮啶后,蛋白质β结构含量降低,但是蛋白质典型的β-构型仍然保持。根据Frster能量转移理论,计算得到蛋白质色氨酸残基与异嗪皮啶的平均结合距离为3.57 nm。HGG可作为异嗪皮啶的体内转运蛋白。
- 雷瑞霞刘永春杜娟杨正银姚小军胡之德
- 关键词:异嗪皮啶荧光淬灭傅里叶变换红外光谱
- 一种基于人工智能进行靶向受体的3D药物设计方法
- 本发明涉及一种基于人工智能进行靶向受体的3D药物设计方法,主要针对目前人工智能训练的模型只能生长成1D或2D的药物分子片段和不能直接靶向受体3D活性口袋的问题,通过利用MMFF94力场转化1D或2D药物片段分子,在受体的...
- 白启峰姚小军
- 文献传递
- 基于支撑向量机方法的有机化合物的生成Gibbs自由能的预测被引量:4
- 2006年
- 用支撑向量机研究了607种有机化合物的结构和他们的G ibbs自由能的关系,建立了相应的QSPR模型。表示分子结构的描述符是从CODESSA软件中计算得到的,通过前向逐步回归分析选择其中的13个描述符,多元线性回归(MLR)和支撑向量机(SVM)被分别用来构造线性和非线性模型预测有机化合物的G ibbs自由能。支撑向量机方法得到的模型对整个数据集、训练集、测试集的平均绝对偏差分别为31.098 9、30.5695和35.924 6 kJ/mol,预测结果令人满意。
- 王冰刘焕香姚小军任月英胡之德
- 关键词:支撑向量机多元线形回归吉布斯自由能
- 比较研究山姜素和豆蔻明与人-γ球蛋白的相互作用被引量:13
- 2010年
- 将互为同分异构体的两种植物药活性组分山姜素和豆蔻明作为研究对象,应用荧光光谱法、紫外光谱法以及红外光谱法并结合分子对接技术首次对这两种黄酮类化合物与人-γ球蛋白(Human gammagobulin,HG)的相互作用进行了详细研究.荧光光谱法的研究结果表明,这两种药物均与HG有较强的相互作用(结合常数均在104~105之间);山姜素对HG表现为静态猝灭机理,而豆蔻明对HG表现出非常少见的动态猝灭机理.比较不同温度(298,308和318K)下两种药物与蛋白相互作用的结合参数都有所差别,维持药物-HG体系的作用力也不同.山姜素和豆蔻明分子与HG色氨酸残基间的结合距离r值(分别为3.88和4.52nm)都小于7nm,说明发生了能量转移.同步荧光与红外光谱法定性及定量地研究了药物对HG二级结构的不同影响程度.两种分子对接结果表明了这两种药物与HG的结合区域.
- 何文英胡之德姚小军陈光英
- 关键词:山姜素相互作用
- 考拉维酸对人血清白蛋白结构的影响被引量:1
- 2014年
- 利用多种荧光光谱法、紫外光谱法并结合分子模拟等方法,表征了模拟生理条件下一种植物药活性组分考拉维酸(KA)影响人血清白蛋白(HSA)的结构信息.同步荧光及紫外光谱证实考拉维酸的存在影响了HSA的微环境;二维及三维荧光光谱表明考拉维酸可以猝灭HSA的内源荧光,使其构象发生变化.荧光偏振的测定提供了考拉维酸与HSA作用后生成的配合物弛豫时间与聚集特性的信息,揭示KA的存在使HSA的流动性和微粘度发生变化.定量求得不同温度下(298、308和318 K)考拉维酸与HSA作用的键合参数和热力学参数.分子模拟表明考拉维酸键合位点于HSA分子的疏水腔内,并与赖氨酸Lys195和天冬氨酸Asp451形成三个氢键,与HSA的键合模式主要是疏水作用;位点竞争实验证明考拉维酸在HSA亚结构域的位点II位发生作用.另外,获得的相关物理化学参数从分子水平上揭示了考拉维酸与HSA相互作用的机制.结果表明,HSA对考拉维酸有较强的结合能力,提示人血清白蛋白对考拉维酸可起到储存和转运的作用.
- 何文英姚小军华英杰黄国雷吴秀丽李小宝韩长日宋小平
- 关键词:人血清白蛋白分子模拟荧光光谱紫外-可见吸收光谱
- 用概率神经网络对多环芳烃的致癌性分类被引量:14
- 2002年
- 通过对多环芳烃的分子表面积、代谢活性区域中心碳原子的离域能、亲电活性区域中心碳原子的离域能以及分子脱毒区的总数的研究发现它们与致癌性有很大关系 .因此利用这四个参数作为网络的输入 ,用已知致癌性的 6 4个样本做训练集建立概率神经网络 ,对 13个样本的致癌性进行了预测 ,其结果优于以前工作的自组织网络的分类结果 .致癌性按高 (h)、低 (l)、非 (n)分类时预言准确率达 10 0 % .
- 相玉红姚小军张瑞生刘满仓胡之德范波涛
- 关键词:概率神经网络多环芳烃径向基网络致癌性离域能