郑红霞
- 作品数：6 被引量：9H指数：2
- 供职机构：华东师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：上海市自然科学基金上海大学生创新活动计划上海市教育发展基金会晨光计划项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 人类基因组miRNA转录调控区保守性DNA序列生物信息学分析被引量：1
- 2009年
- MicroRNA(miRNA)的表达调控方式一直是一个有争议的问题,为了研究miRNA潜在的转录调控特点,本文通过Sanger网站miRNA数据库获得人类miRNA的信息,并建立miRNA相关信息数据库,用MEME和Wordspy两个软件对其上游2000bp序列进行保守性分析,得到保守性的DNA序列(motif),用TESS软件分析保守性DNA序列,预测其转录因子结合情况。通过比较位于基因间、反义链和内含子中的三类不同miRNA转录调控区的保守性和自主转录能力的差异,结果发现位于基因间、反义链上的miRNA上游调控区的保守性比位于内含子的miRNA高,在miRNA的转录调控区存在RNA聚合酶Ⅱ类型的转录因子结合位点,miRNA还表现出自身独特的转录调控方式。通过分析,我们还得到了miRNA表达调控中一些重要的转录因子以及独特的调控序列。本研究结果为miRNA转录调控机制的进一步研究提供了理论依据。
- 郑红霞窦同海蔡燕燕詹晓莹沈逢焘吴奇涵
- 关键词：MIRNA转录调控保守序列
- Cyclin H基因启动子区-1 SNP对转录活性的影响被引量：1
- 2008年
- 目的探讨CCNH基因启动子区-1SNP位点碱基变异对CCNH基因转录活性的影响。方法通过PCR和定点突变技术,构建了含CCNH基因基础启动子及-1G突变启动子,用双荧光素酶报告系统观察此SNP对CCNH基因启动子转录活性的影响。结果在AD293细胞中,-1G突变启动子活性比CCNH基础启动子活性低26%(P<0.05)。结论-1T→G碱基变异可显著降低CCNH基因启动子转录活性。
- 陈佩林陈鑫郑红霞吴奇涵
- 关键词：SNP
- 黑素皮质1型受体基因的SNP及其应用
- 本发明涉及遗传学领域，提供人黑素皮质素1型受体(melanocortin1 receptor，MC1R)基因CDS区第421位和第497位的单核苷酸多态性(SNP)及应用。通过对MC1R基因单核苷酸多态性进行广泛而深入的...
- 郑红霞蔡燕燕顾海英吴奇涵
- 文献传递
- CYP1A1基因Ile462Val多态位点在吸烟人群中与肺癌易感性显著相关被引量：1
- 2011年
- 利用meta分析的方法探讨吸烟人群中CYP1A1基因多态位点与肺癌易感性的关系.获取1986年至2010年2月pubmed等数据库中有关CYP1A1基因Ile462Val和Msp1位点多态性与肺癌易感性关系的研究结果,统计对应的吸烟者或非吸烟者的研究数据,运用RevMan4.2软件对各研究原始结果进行统计处理,计算合并OR值及95%可信区间.按照纳入标准,最终入选文献共有29篇病例对照研究,吸烟者中Ile462Val位点与肺癌发生显著相关,基因型Val/Val+Ile/Val比Ile/Ile的合并OR值为1.29(95%CI∶1.03,1.63),P<0.05,而该位点在非吸烟者中及Msp1位点在两种人群的分析结果均不具统计学意义.上述结果提示,对目前相关研究结果的Meta分析显示,吸烟者中CYP1A1基因Ile462Val位点多态性与肺癌易感性之间存在一定相关性.
- 蔡燕燕谭晓明郑红霞顾海英詹晓莹吴奇涵
- 关键词：肺癌CYP1A1基因多态性META分析
- 中国汉族人群MC1R基因多态与皮肤颜色等表型特征关联研究被引量：3
- 2013年
- 皮肤癌是一种比较常见的肿瘤,在西方人群中研究表明,通过影响皮肤颜色等色素表型特征,黑色素生成通路中相关基因多态性(MC1R等)可增加皮肤癌发生风险.本研究首次在中国汉族人群中选择MC1R基因编码区的多态位点为研究对象,分析其与中国汉族人群的皮肤颜色、对阳光的敏感性、雀斑情况及头发颜色的关联性.在MC1R基因编码区发现7个SNP位点:c.200G>A,c.274G>A,c.359T>C,c.421G>A,c.488G>A,c.497C>G和c.942A>G.其中c.421G>A为新发现的SNP位点,c.497C>G则首次在中国汉族人群中报道.c.942A>G与皮肤颜色相关,其突变纯合基因型GG与皮肤颜色浅显著相关(P=0.044,OR=0.16,95%CI:0.03～0.95).c.359T>C杂合基因型TC与雀斑数目多显著相关(P=0.040,OR=5.76,95%CI:1.05～31.53),表明MC1R基因多态与中国汉族人群的皮肤颜色等色素表型特征具有一定相关性,为相关临床研究提供了参考.
- 顾海英郑红霞路阳阳胡海群李玥玥张丽贺亚男吴奇涵
- 关键词：MC1R基因皮肤颜色汉族人群
- MC1R基因多态与皮肤颜色等表型特征在中国汉族人群中的关联研究
- MC1R(melanocortin-1 receptor)即黑色素皮质1型激素受体，是一种G蛋白偶联受体，主要功能是负责黑色素生成，将棕黑色素(eumelanin)转换成褐黑色素(pheomelanin)。当MC1R被α...
- 郑红霞
- 关键词：皮肤颜色汉族人群表型特征
- 文献传递
