甘小妮 作品数:44 被引量:122 H指数:6 供职机构: 中国科学院水生生物研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 中国博士后科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 金属学及工艺 医药卫生 环境科学与工程 更多>>
一种可用于环境DNA采样的轮盘式滤膜更换系统 本发明提供一种可用于环境DNA采样的轮盘式滤膜更换系统,滤膜更换系统包括:弹匣式机构,内部设置有若干待采样的滤膜,并用于逐一将若干待采样的滤膜进行释放;采样区,用于接收待采样的滤膜,以对待采样的滤膜进行水样采集;输送装置... 曾宏辉 陆苏祥 熊凡 甘小妮中国科学院水生生物研究所科学数据中心:助推大数据时代水生生物学研究新发展 被引量:1 2023年 中国科学院水生生物研究所(以下简称“水生所”)是研究内陆水体生命过程、生态环境保护与生物资源利用的综合性学术机构。自20世纪50年代开始,水生所科研人员率先有计划地针对全国主要水体开展了实地科学考察,产生了大量的水生生物原始生态学数据;随着显微拍照和测序技术的进步,调查还产生了各种浮游生物显微照片和大量的遗传数据。这些数据为水生态监测服务系统和数据库的构建提供了数据支持,有助于推进水生生物学研究的发展。此外,面向国家在水环境保护、渔业可持续发展方面的重大战略需求,中国科学院水生生物研究所科学数据中心(以下简称水生所科学数据中心)(http://sdb.ihb.ac.cn/)聚焦科学数据标准规范、安全可控和开放共享,对上述科学数据进行收集保存、汇交整合、分级管理和分析挖掘,以期为生态环境保护与生物资源保护利用等领域的基础性、战略性和前瞻性的科学研究和技术创新服务。 缪荣丽 魏朝军 王宝强 彭新奎 陈凯 熊凡 方成池 甘小妮 曾宏辉关键词:水生生物 水环境保护 渔业可持续发展 一种可用于环境DNA采样的弹匣式滤膜更换系统 本发明提供一种可用于环境DNA采样的弹匣式滤膜更换系统,滤膜被环状的壳体装配为一体结构的滤饼,滤膜更换系统包括:弹匣式机构、采样区和输送机构,弹匣式机构内装有若干待采样的滤饼;采样区位于弹匣式机构的一侧,用于接收待采样的... 曾宏辉 陆苏祥 熊凡 甘小妮文献传递 DNA条形码技术促进我国水产领域信息化进程——重要水产动物DNA条形码及其在食品安全领域的应用 被引量:1 2016年 DNA条形码是利用简短的标准化基因片段对物种进行快速鉴定的技术,并为快速的物种鉴定提供了分子水平的精细分类学标准。DNA条形码技术不但可以在食品安全监管中发挥重要作用,还为突破现有检测技术与社会发展需求之间的矛盾提供了可行性。为此,中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室主任何舜平研究员组织开展了“重要水产动物DNA条形码及其在食品安全领域的应用”研究, 沈彦君 王绪祯 甘小妮关键词:食品安全监管 条形码技术 水产动物 信息化进程 物种鉴定 一种可用于环境DNA采样的夹取式滤膜更换系统 本发明提供一种可用于环境DNA采样的夹取式滤膜更换系统,滤膜被环状的壳体装配为一体结构的滤饼,滤膜更换系统包括:弹匣式机构,弹匣式机构的内部设置有若干待采样的滤饼;采样区,采样区用于接收待采样的滤饼,并对待采样的滤饼进行... 陆苏祥 曾宏辉 熊凡 甘小妮短尾蝮蛇IRF-2基因的克隆和特征分析 被引量:1 2011年 报道了短尾蝮蛇Gloydius brevicaudus干扰素调节因子2基因(IRF-2)的克隆和cDNA全序列测定分析。目前除在爬行类外,IRF-2基因在大部分的脊椎动物如鱼类、两栖类、鸟类和哺乳类都有报道。为了获得爬行类IRF-2基因的全序列,从短尾蝮蛇的肾、脾、肝和肠4种组织中使用Trizol试剂盒提取了总RNA。从已知的IRF-2基因序列比对设计了简并引物来扩增保守片段。最后使用RACE方法得到IRF-2的cDNA全序列。结果显示短尾蝮蛇的IRF-2基因开放阅读框包含有978个核苷酸,编码326个氨基酸,其3′UTR包含137个核苷酸。与脊椎动物其他四足动物序列比对分析还发现,短尾蝮蛇的IRF-2基因和推导的氨基酸序列都非常保守,与大部分四足动物的IRF-2相似。从其氨基酸序列中可以辨别出DBD、IDA2和transactivating dom ain等大部分元件和阻遏模体。 甘小妮 陈新文关键词:蝮蛇 爬行类 线粒体D-loop序列变异与东方鲀属鱼类系统发育 被引量:5 2009年 东方鲀属的红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)是后基因组时代的一种重要模式生物。本研究中,利用东方鲀属11种鱼类(18尾)的D-loop基因序列,对东方鲀属鱼类的系统发育关系进行研究。经序列比对排定后,分析中D-loop序列有841个位点,其中395个位点为可变位点,267个位点为系统发育信息位点。分别采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯方法构建了分子系统树。研究结果表明:(1)东方鲀属鱼类为一单系类群;(2)由横纹东方鲀(T. oblongus)和铅点东方鲀(T. alboplumbeus)构成的姊妹群位于这个类群的基部。此外,本属鱼类物种分类现状还需要进一步的澄清。 张玉波 甘小妮 何舜平关键词:系统发育 D-LOOP 东方鲀属 利用气相色谱/质谱联用分析林麝麝香中麝香酮和甾类成分 被引量:7 2009年 采用气相色谱/质谱(GC/MS)联用的方法,对林麝麝香中的甾体成分进行分析,确定了林麝麝香样品含有多种甾体成分的结构,并分析了不同来源的林麝麝香的麝香酮及甾体成分。通过检索NIST05质谱库,进一步确定了麝香中含有16种甾体成分。利用外标法、标准曲线法同时测定了麝香样品中3种甾类成分(胆固醇、苯胆烷醇酮及麝香酮)的含量,麝香酮的定量分析显示所有样品麝香中麝香酮含量均较高(30.1~45.2mg/g),但甾类成分含量波动较大。聚类分析显示,9个麝香样品聚为两支。利用GC/MS技术检测麝香成分的方法,可以提供麝香较为全面的甾类信息,可高效准确地对麝香进行质量分析。 苏国义 吴艾林 甘小妮 岳碧松 李静关键词:麝香 林麝 聚类分析 一种用于检测黄鳝的特异性引物组、探针及其应用 本申请涉及生物检测技术领域,尤其涉及一种用于检测黄鳝的特异性引物组、探针及其应用;所述特异性引物组包括上游引物和下游引物,上游引物具有如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列,下游引物具有如SEQ ID NO.2所示的核... 陆苏祥 曾宏辉 方成池 王成 杨连东 甘小妮 何舜平基于分区贝叶斯法和最大似然法的鲤科鱼类系统发育分析及其系统学意义 被引量:9 2012年 鲤科是淡水鱼类中最大的科,但其高阶元类群之间的系统发育关系目前尚不明确.本研究选择核基因组中的重组活化基因2、线粒体基因组中的16SrRNA基因和细胞色素b基因作为遗传标记,重建鲤科鱼类的系统发育关系.研究结果显示,分区策略对解决鲤科鱼类的系统发育关系和提升其节点支持率并没有显著效果,因此在所有分析中,不分区策略是最佳选择.贝叶斯分析结果显示,鲤科中单系类群间关系为:(鲤亚科,野鲮亚科),((鱊亚科,((雅罗鱼亚科,丁鱥亚科),鮈亚科)),鲴亚科).分化时间估算表明,鲤科鱼类的主要类群的分化集中在渐新世晚期到中新世晚期.本研究中的系统发育分析结果有助于促进对鲤科鱼类进化历史的认识. 王绪祯 甘小妮 李俊兵 MAYDEN Richard L. 何舜平关键词:鲤科 系统发育