王绪祯 作品数:18 被引量:140 H指数:6 供职机构: 中国科学院水生生物研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 中国博士后科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
基于线粒体CO1基因序列的DNA条形码在鲤科鲌属鱼类物种鉴定中的应用 被引量:96 2009年 本研究探讨了线粒体CO1基因作为DNA条形码对鲌属鱼类进行物种鉴定的可行性。研究中获得了鲌属4种鱼类共32个个体长度为816bp的CO1基因序列。利用MEGA软件计算鲌属鱼类种间及种内遗传距离,利用邻接法、最大简约法、最大似然法和Bayesian方法分别构建分子系统树。结果显示,鲌属鱼类的种间遗传距离显著大于种内遗传距离。在系统树中,鲌属鱼类每一物种的个体分别形成各自独立的分支。基于CO1基因的DNA条形码在识别鲌属鱼类物种方面和传统形态学基本一致,而且该基因可以探讨鲌属鱼类种间的系统发育关系。本研究表明以CO1基因作为鲌属鱼类DNA条形码进行物种鉴定具有一定的可行性。 彭居俐 王绪祯 王丁 何舜平关键词:DNA条形码 物种鉴定 东亚地区淡水鱼类生物多样性历史的系统发育重建与物种分化研究 何舜平 刘焕章 王绪祯 彭作刚 陈宜瑜 由于复杂的生态环境类型和季风性气候的影响,东亚地区孕育了众多的淡水鱼类。东亚是世界淡水鱼类多样性最为丰富的地区之一,仅中国就分布了1300余种淡水鱼类,数量居世界第二,在世界鱼类区系中占有重要地位。东亚淡水鱼类以鲤形目和...关键词:关键词:淡水鱼 水产养殖 基于线粒体ND4基因序列的七种条纹光唇鱼系统发育及对半刺光唇鱼分类地位的质疑 被引量:10 2010年 光唇鱼属(Acrossocheilus)隶属于鲤形目(Cyprini-formes)鲤科(Cyprinidae)鲃亚科(Barbinae Oshima,1919),广泛分布于东南亚和东亚,其中包括中国南部(包含台湾和海南岛)、越南和老挝。伍献文等[1]于1977年鉴定了本属的19个种或亚种, 王莉 王绪祯 何舜平关键词:系统发育 亚种 基于S6K1基因部分序列的鲤科鱼类系统发育关系及内含子1Indel位点分析 被引量:2 2007年 鲤科鱼类在东亚分布广泛且数量丰富,在物种演化上具有重要的系统发育地位.本研究基于S6K1基因5′端功能调控序列,通过PCR扩增、克隆和测序,共获得30种鱼类S6K1前端部分DNA序列(外显子1,外显子2及内含子1),对序列变异进行分析,并采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯法(Bayesian)重建鲤科鱼类系统发育关系.亚口鱼科的胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus)作为外类群,通过4种方法所得系统发育分支图大致相同,均以较高的节点支持率支持雅罗鱼系和鲃系的划分,雅罗鱼系包括雅罗鱼亚科东亚类群(East Asian group in Leuciscinae)、鲢亚科(Hypophthalmichthyinae)、鲴亚科(Xenocyprinae)、鲌亚科(Cultrinae)、亚科(Gobioninae)、鳑鲏亚科(Acheilognathinae)和亚科(Danioninae)部分种类;系统分支图也以较高的节点支持率支持鲤科鱼类东亚类群形成单系群.鲃系包括裂腹鱼亚科(Schizothoracinae)、鲃亚科(Barbinae)、鲤亚科(Cyprininae)和野鲮亚科(Labeoninae);另外,亚科中的斑马鱼(Danio rerio),麦氏(Danio myersi)和三线波鱼(Rasbora trilineata)形成一个单系群,位于系统树基部.以内含子1中大片段的插入或缺失(Indel)对物种分化及亲缘关系进行分析,以帮助理解鲤科鱼类系统发育关系或争议物种之间的亲缘关系.结果显示,内含子1中大片段的插入或缺失与物种分化具有一定的相关性,对于理解系统发育关系具有补充作用;内含子1中有许多区域较为保守,可能与功能调控有关,但本研究中并未发现S6K1序列变异与鱼类物种特征尺寸之间具有对应关系. 孔祥会 王绪祯 甘小妮 李俊兵 何舜平关键词:系统发育 内含子 伊洛河马口鱼遗传差异及其种群分化研究 被引量:3 2020年 研究利用细胞色素b(Cyt b)基因分析了采自于伊洛河的48个马口鱼(Opsariichthys bidens)个体间的遗传距离,并构建其系统发育关系。分析结果显示,48个个体聚为两个支持率为100%的分支,分支间没有共享单倍型。每个分支的样本覆盖了所有的采样点,分支内个体间的平均遗传距离为0.2%,而分支间的遗传距离为3.1%。微卫星分析结果显示,99.88%的遗传差异来自于种群内个体间,种群间的差异只占了0.12%,两个分支种群并没有发生显著的遗传分化(Fst=0.0012,P=1)。以δ13C和δ15N构建了两个分支的生态位,结果显示,伊洛河马口鱼的两个分支的营养生态位没有发生分离。基于线粒体Cyt b基因的遗传分歧,伊洛河马口鱼的两个分支可能代表不同的物种。但它们在种群遗传结构上并没有发生显著的种群分化,个体间亲缘关系树与系统发育树的分歧暗示种群间不存在生殖隔离,营养生态位也没有分离。研究结果并不符合隐存种的解释,伊洛河马口鱼两个分支间线粒体DNA的遗传差异可能源自于祖先种群或者种间杂交。 邓艳 王雪 林鹏程 刘焕章 王绪祯关键词:马口鱼 细胞色素B 微卫星 稳定同位素 种群分化 一种深海诱捕摄像着陆器系统 本发明公开了一种深海诱捕摄像着陆器系统,包括浮球装置,还包括设置在浮球装置内的电源装置、在浮球装置内还设置有均由电源装置供电的USB集线器、加速度记录仪、遥控定时开关、铱星数传GPS终端和光诱摄像装置,还包括设置在浮球装... 陆苏祥 何舜平 王绪祯文献传递 DNA条形码技术促进我国水产领域信息化进程——重要水产动物DNA条形码及其在食品安全领域的应用 被引量:1 2016年 DNA条形码是利用简短的标准化基因片段对物种进行快速鉴定的技术,并为快速的物种鉴定提供了分子水平的精细分类学标准。DNA条形码技术不但可以在食品安全监管中发挥重要作用,还为突破现有检测技术与社会发展需求之间的矛盾提供了可行性。为此,中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室主任何舜平研究员组织开展了“重要水产动物DNA条形码及其在食品安全领域的应用”研究, 沈彦君 王绪祯 甘小妮关键词:食品安全监管 条形码技术 水产动物 信息化进程 物种鉴定 基于分区贝叶斯法和最大似然法的鲤科鱼类系统发育分析及其系统学意义 被引量:9 2012年 鲤科是淡水鱼类中最大的科,但其高阶元类群之间的系统发育关系目前尚不明确.本研究选择核基因组中的重组活化基因2、线粒体基因组中的16SrRNA基因和细胞色素b基因作为遗传标记,重建鲤科鱼类的系统发育关系.研究结果显示,分区策略对解决鲤科鱼类的系统发育关系和提升其节点支持率并没有显著效果,因此在所有分析中,不分区策略是最佳选择.贝叶斯分析结果显示,鲤科中单系类群间关系为:(鲤亚科,野鲮亚科),((鱊亚科,((雅罗鱼亚科,丁鱥亚科),鮈亚科)),鲴亚科).分化时间估算表明,鲤科鱼类的主要类群的分化集中在渐新世晚期到中新世晚期.本研究中的系统发育分析结果有助于促进对鲤科鱼类进化历史的认识. 王绪祯 甘小妮 李俊兵 MAYDEN Richard L. 何舜平关键词:鲤科 系统发育 一种深海诱捕摄像着陆器系统 本发明公开了一种深海诱捕摄像着陆器系统,包括浮球装置,还包括设置在浮球装置内的电源装置、在浮球装置内还设置有均由电源装置供电的USB集线器、加速度记录仪、遥控定时开关、铱星数传GPS终端和光诱摄像装置,还包括设置在浮球装... 陆苏祥 何舜平 王绪祯文献传递 一种深海诱捕摄像着陆器系统 本实用新型公开了一种深海诱捕摄像着陆器系统,包括浮球装置,还包括设置在浮球装置内的电源装置、在浮球装置内还设置有均由电源装置供电的USB集线器、加速度记录仪、遥控定时开关、铱星数传GPS终端和光诱摄像装置,还包括设置在浮... 陆苏祥 何舜平 王绪祯文献传递