公共文化服务平台

共 6 条记录，以下是 1-6

全选清除导出

排序方式：

普通烟草钙依赖蛋白激酶NtCDPK15的基因克隆及表达分析被引量：8: 2013年; 钙依赖蛋白激酶(CDPK)对Ca2+信号转导通路下游元件的调控具有重要作用。本实验采用同源克隆技术从普通烟草中分离得到1个CDPK基因,命名为NtCDPK15(GenBank登录号为JN662020),cDNA全长为1963 bp,ORF大小为1569 bp,编码522个氨基酸。多序列比对结果表明,NtCDPK15的编码产物具有典型的CDPK保守序列,C末端调控区有4个EF手性结构。系统进化树分析显示,NtCDPK15可能来源于绒毛状烟草,预测NtCDPK15与NtCDPK1这对旁系同源基因在功能上可能非常保守。实时荧光定量PCR分析结果表明,NtCDPK15在根和叶中的表达量显著高于茎中的表达量,但经盐胁迫诱导后NtCDPK15在茎中的表达量显著增加,同时,盐胁迫还使基因在叶中的表达量显著上调,ABA胁迫可诱导基因在根中的表达,而干旱胁迫可使基因在根和叶中的表达量下调,这些结果说明NtCDPK15在普通烟草中的表达受盐胁迫及ABA胁迫诱导,但受干旱胁迫抑制。; 康乐张丽张磊吴清章丁安明宗鹏刘贯山; 关键词：普通烟草 CDPK RACE 非生物胁迫

茄子microRNAs与其靶基因的生物信息学预测被引量：6: 2011年; microRNAs(miRNAs)是一类在真核生物中发现的长度为21 nt左右、非编码、内源性的单链小分子RNA,通过与靶基因的互补发挥转录后水平的负调控作用。目前,已在许多物种中报道了miRNAs的存在,然而还未见关于茄子miRNAs的报道。根据miRNAs在植物中的高度保守性及其前体的二级结构特征,文章通过同源预测的方法,将已知植物的miRNAs与茄子EST数据库比对,经过一系列的筛选,最终预测到12个家族的16条茄子miRNAs,其中包括3个miRNA家族的正义/反义miRNAs,而miR390和miR399家族的正义/反义miRNAs属于第一次发现。文章还通过在线软件psRNATarget预测到15条茄子miRNAs的71个靶基因,这些靶基因主要编码与茄子生长发育、新陈代谢以及胁迫响应等过程相关的蛋白。; 张磊晁江涛崔萌萌陈雅琼宗鹏孙玉合; 关键词：茄子靶基因生物信息学 EST

烟草突变体TILLING筛选体系的建立与应用: 定向诱导基因组局部突变技术（Targeting Induced Local Lesions In Genomes，TILLING）是一种新的反向遗传学方法，目前已成功应用于拟南芥、小麦、玉米等多种植物突变体筛选中，鉴定了...; 宗鹏; 关键词：烟草 TILLING 点突变突变体筛选; 文献传递

基于SSR荧光标记分析我国主要审(认)定烤烟及白肋烟品种遗传多样性被引量：5: 2013年; 将毛细管电泳荧光检测技术应用于烟草SSR标记研究，分析我国审（认）定通过的63份烤烟与8份白肋烟种质的遗传多样性。选取36对SSR引物，共扩增产生多态性带205条。运用NTSYS-pc2．10e软件计算Dice遗传相似系数，结果显示71份烟草种质的遗传相似系数介于0．223-0．924之间，平均为0．658。表明我国审（认）定通过的烟草栽培种间的遗传基础狭窄、遗传多样性不丰富。; 陈雅琼王卫峰丁安明宗鹏李凤霞张磊孙玉合; 关键词：烟草 SSR荧光标记

烟草TILLING技术体系的建立及NtPhyB基因的筛选被引量：1: 2014年; 定向诱导基因组局部突变技术（Targeting Induced Local Lesions In Genomes，TILLING）是一种新近发展起来的高通量检测点突变的反向遗传学方法。本研究首次将TILLING技术用于EMS处理的烟草突变体筛选中，通过对正反向荧光引物使用量的摸索，确定了10μL PCR体系中IRDye-700标记的正向引物（1μM）适用量为0.32～0.64μL，IRDye-800标记的反向引物（1μM）适用量1.12～1.6μL；对异源双链CELⅠ酶切体系实验表明，10μL PCR产物中加入0.6μL CEL I酶，1.5μL 10× Buffer酶切效果最好。从而建立并优化了适用于普通烟草基因组研究的TILLING技术体系。在此基础上，以NtPhyB为目标基因，在1000份0.6% EMS诱变的M2突变体中进行筛选，共得到13个突变体，该基因突变频率约为1/94 kb。本试验建立的TILLING筛选体系能够快速、高效地筛选任意已知序列基因的突变体，对烟草功能基因组研究具有重要意义。; 宗鹏李凤霞王倩刘贯山龚达平陈雅琼孙玉合; 关键词：功能基因组学烟草化学诱变突变体

番茄PPR基因家族的鉴定与生物信息学分析被引量：11: 2014年; PPR(Pentatricopeptide repeats)基因家族在植物中广泛存在,其在植物生长发育过程中至关重要。文章采用生物信息学方法,利用Pfam已鉴定的PPR保守结构域序列检索番茄(Solanum lycopersicum L.)基因组计划注释的蛋白序列,最终确定了番茄中可能存在的471个PPR编码基因;根据拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)中鉴定的各个结构域的特点对其进行了蛋白结构分析、分类和保守序列分析,并对番茄PPR基因家族进行了系统进化树构建、染色体定位、亚细胞定位预测、表达和GO分析等。结果表明:番茄PPR基因家族分为P和PLS两个亚家族,各占序列数目的一半,PLS亚家族又分为PLS、E、E+和DYW四类,且在进化树中形成不同的分支;各个结构域在植物中非常保守;PPR基因家族分布在番茄12条染色体上,且多数无内含子结构;大部分PPR蛋白具有线粒体或叶绿体定位序列,GO分析表明PPR蛋白参与RNA相关的生物学过程。; 丁安明李凌屈旭孙亭亭陈雅琼宗鹏李尊强龚达平孙玉合; 关键词：番茄生物信息学

全选清除导出

共1页<1>

宗鹏