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孙逸: 作品数：22 被引量：57H指数：5; 供职机构：浙江省疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：国家科技重大专项浙江省自然科学基金浙江省医药卫生科学研究基金更多>>; 相关领域：医药卫生农业科学哲学宗教更多>>

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一种灭活疫苗候选株的外源因子检测方法以及灭活疫苗候选株的筛选和灭活疫苗的制备: 本发明公开了一种灭活疫苗候选株的外源因子检测方法以及灭活疫苗候选株的筛选和灭活疫苗的制备，涉及生物医药技术领域，本发明基于高通量测序技术的宏基因组测序的手段，基于候选株中病原丰度和外源因子丰度对候选株进行筛选，能够更有效...; 张严峻孙逸茅海燕周飚烽

乙型流感病毒Victoria系和Yamagata系HA1基因的分子进化研究被引量：5: 2013年; 目的探讨乙型流感病毒两大谱系的进化特征和进化规律。方法从GenBank数据库下载1940—2012年乙型流感病毒流行株共126条，采用贝叶斯－马尔科夫链－蒙特卡洛（Bayesian—MCMC）和分子钟方法，对乙型流感病毒的HA1基因进行系统发育学分析，计算乙型流感病毒两大谱系可能的起源时问与分化时间。结果1978—2010年乙型流感病毒Victoria系与Yamagata系的aa平均差异率为5．4％～10．2％，两谱系的aa差异和组间遗传距离随时问推移呈逐渐增大的趋势。与Victoria系毒株相比，Yamagata系全部毒株的163位aa及部分毒株的166位aa缺失，但是这些年来的乙型流感病毒HA1基因除个别位点外，尚未受到明显的正向选择压力。每年乙型流感病毒HA1基因的碱基替换速率为2．138×10^-3（95％HPD：1．833×10^-3～2．437×10^-3）替代／位点，推算乙型流感病毒Victoria系和Yamagata系的最近共同祖先出现在1971年（95％HPD：1969—1972年），两大谱系的分化时间点分别为1973年（95％HPD：1971—1974年）和1977年（95％HPD：1975—1978年）。结论乙型流感Victoria系和Yamagata系均较以往发生大的变异，且两大谱系的差异日趋增大，将来有可能分化为不同的亚型，在流感监测中应密切关注这一变化及其流行病学意义。; 金青青茅海燕孙逸卢亦愚冯燕徐昌平莫世华; 关键词：乙型流感病毒 HA1基因进化

人感染H7N9禽流感防控关键技术创新与应用: 陈恩富夏时畅陈直平张严峻林君芬刘社兰茅海燕何凡王笑笑龚震宇柴程良孙逸孙继民凌锋陈寅陆烨王臻吕华坤丁华方春福楼秀玉程伟余昭颜浩李傅冬潘军航王欣莹卢亦愚姚立农徐昌平王心怡冯燕张雪海高见蔡剑李榛史雯; 2013年春，中国长三角地区突发一种新型H7N9禽流感病毒引起的疾病，浙江省是全国疫情最为严重的地区。在浙江省科技厅重大专项、浙江省医药卫生科学研究基金项目、浙江省流行病学医学支撑学科以及浙江省公共卫生监测与突发事件处置...; 关键词：; 关键词：禽流感病毒传染病

浙江省一株发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒分离株全基因组测序及分子进化分析被引量：8: 2014年; 目的对一株发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒（SFTSV）浙江分离株进行全基因组测序和分子进化分析.方法从浙江省CDC采集1例SFTSV感染疑似病例的急性期全血标本,提取标本的病毒RNA并用荧光定量RT-PCR方法检测,分离得到SFTSV分离株.RT-PCR扩增覆盖全基因组的17个重叠基因片段,使用Geneious基因分析软件对测序结果进行剪辑和拼接.从GenBank 数据库中获取各地SFTSV全基因组序列,采用RAxML软件及MEGA软件对分离株基因组核苷酸序列与GenBank已经公布的SFTSV核苷酸序列和白蛉病毒属部分其他病毒进行比对,并构建进化树,进行同源性分析.结果荧光定量RT-PCR鉴定该疑似病例为阳性,并成功分离获得SFTSV毒株,命名为Zhejiang/01/2011株.对Zhejiang/01/2011株进行RT-PCR扩增并测序拼接得到全基因组cDNA序列,Zhejiang/01/2011株基因组核苷酸序列共有S、M、L3个片段.其中S片段为1 745个核苷酸,M片段为3 378个核苷酸,L片段为6 368个核苷酸.分子进化分析结果显示,Zhejiang/01/2011株与Japan/SPL004A/2013株相似性最高,其中S片段相似性为98％,M片段为97％,L片段为98％.白蛉病毒属基于3个片段分子系统进化树均显示,Zhejiang/01/2011株与白蛉病毒属部分病毒株中所有的SFTSV病毒株聚集在一起.结论笔者成功对Zhejiang/01/2011株进行了测序和分子进化分析.Zhejiang/01/2011株是SFTSV,属白蛉病毒属,且其与日本分离株在同一分支,相似性较大,与国内其他地区分离株不在同一分支,差异较大.; 冯岑张磊孙逸邵斌茅海燕蒋健敏张严峻; 关键词：逆转录聚合酶链反应发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒全基因组测序

2014年浙江省丽水市人感染H7N9禽流感病毒分离株基因特征分析被引量：3: 2016年; 目的测定浙江省丽水市1株H7N9禽流感病毒8个基因序列,从分子水平分析其基因特征和遗传变异特点。方法对人感染H7N9禽流感确诊病例标本在P3实验室进行犬肾传代细胞培养;反转录-聚合酶链反应扩增病毒8个RNA片段后测定基因序列;通过生物信息学软件将8个序列与GISAID和Gen Bank数据库下载的序列进行多重比对和匹配,发现基因特征,分析病毒关键位点的分子变异情况,最大似然法绘制系统进化树用于基因进化分析。结果从病例标本中分离到病毒：A/Zhejiang/LS01/2014（H7N9）,测序获得8个基因核苷酸全序列。HA裂解位点只包含2个碱性氨基酸,HA蛋白受体结合关键氨基酸位点发生A134T、G186V和Q226L变异;在PB2蛋白上发现E627K突变;M2蛋白上发现耐药位点S31N。LS01株HA基因与A/chicken/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013（H7N9）的同源性最高（98.90%）,NA基因与A/chicken/Changzhou/C08/2013（H9N9）的同源性最高（98.60%）,LS01株其他6个编码内部蛋白的基因均与禽源H9N2株高度同源（99.10%~99.89%）。LS01株HA和NA基因与沪苏浙一带流行的H7N9禽流感病毒株位于同一亚分支,有着直接的进化关系,在相近地域有进化关系较近的禽类流感病毒存在。结论 A/Zhejiang/LS01/2014（H7N9）株8个基因序列均符合禽源H7N9亚型禽流感病毒特征,其病原基因均为禽类来源。HA裂解位点具有低致病性禽流感病毒基因特点,Q226L和E627K位点发生变异可能与其对人具有高致病力相关。; 王晓光雷永良叶碧峰茅海燕孙逸; 关键词：禽流感病毒基因

基于TLDA技术的甲型流感病毒高通量快速分型方法的建立及应用: 2022年; 目的开发用于甲型流感病毒快速分型的Taqman低密度芯片(Taqman low density array,TLDA),可以同时开展甲型流感病毒通用、H1-H16及N1-N9亚型高通量快速鉴定,适用于流感样病例及禽流感标本中甲型流感病毒的快速分型鉴定。方法设计甲型流感病毒通用、H1-16亚型、N1-9亚型的引物探针,并将其预先定制在TLDA反应芯片上;优化TLDA退火温度;用多种亚型的甲型流感病毒核酸进行10倍梯度稀释,结合微滴式数字PCR定量方法评价TLDA检测灵敏度;用乙型流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞等其他多种常见的呼吸道病毒验证该TLDA检测特异性,同时选用多种已经明确分型的甲型流感病毒评价该TLDA的特异性和有效性;采集16例流感样病例标本及24例禽流感外环境标本用该芯片开展检测。结果该TLDA的最佳退火温度为60℃;针对甲型流感病毒H1N1、H3N2、H5N6、H7N9和H9N2,其检测灵敏度为1.52~8.00拷贝/μl;能特异性检测甲型流感病毒,与其他常见呼吸道病毒无交叉反应,并能精准鉴定多种甲型流感病毒的亚型;应用该方法检测16例流感样病例标本和24例禽流感外环境监测标本,均可分型。结论基于TLDA技术建立的甲型流感病毒高通量快速分型检测方法具有较好的灵敏度和特异性,适用于流感样病例和禽流感标本的病原快速检测,特别是对目前用常规商业化试剂尚无法鉴定的新型甲型流感病毒能够进行快速的亚型筛查与鉴定。; 楼秀玉赵翔王欣莹陈寅孙逸李榛余昭茅海燕; 关键词：甲型流感病毒

新型人感染H7N9禽流感病毒病原学研究进展被引量：5: 2014年; 2013年中国暴发的新型人感染H7N9禽流感引起了全世界的关注。本文通过整理目前已发表在数据库(PubMed)上的新型人感染H7N9禽流感病原学方面文章,对关于该病毒核酸检验、序列分析、溯源研究,以及其致病力、耐药性和传播力研究等方面已经明确的结论进行综述。该病毒核酸可以通过各种数量实时定量PCR方法检测,有较好的敏感度和特异性,能较快获得检测结果,其中逆转录实时荧光定量PCR仍是目前检测的主流方法。该病毒来自于禽类,对禽类属于低致病性病毒,但经过近几年的多次重组事件后,已能和人呼吸道受体α-2,6Gal结合,并可通过直接接触传播感染人类引起较为严重的临床过程。除H7N9之外,其他新重组形成H7亚型,如H7N7,亦具有较高的哺乳动物感染力,因此需加强对禽流感病原监测。相比容易感染青少年的高致病性人禽流感H5N1病毒,新型H7N9病毒更易引起老年人的严重呼吸系统症状。虽然已经出现耐神经氨酸抑制剂毒株,但是该病毒临床仍可用奥司他韦等药物进行治疗,目前已发现其他药物可以抑制耐药与非耐药毒株在体内的复制。如出现聚集性病例,其感染来源可能存在共同暴露史,但亦不能排除存在有限的、非持续的人传人可能。; 孙逸楼秀玉张磊茅海燕张严峻卢亦愚; 关键词：禽流感病原学

1999--2012年浙江省乙型流行性感冒病毒血凝素与三个内部基因的变异分析被引量：2: 2013年; 目的探讨乙型流行性感冒病毒（简称乙型流感病毒）分离株血凝素（hemagglutinin，HA）、核蛋白（nucleoprotein，NP）、基质蛋白（matrixprotein，M）和非结构蛋白（nonstructuralprotein，NS）基因的分子变异特征。方法选取浙江省1999--2012年乙型流感病毒分离代表株31株，进行HA重链区（HAl）、NP、M和NS基因测序，并构建基因进化树，估算此4个基因的核苷酸进化速率并分析其氨基酸变异位点。结果31株乙型流感病毒分离株在删J基因进化树上分别处于Victoria系和Yamagata系两大分支，分别以B／Victoria／2／87和B／Yamagata／16／88为代表。2010年之后Victoria系分离株的ⅣP基因与Yamagata系毒株高度同源，处于同一进化分支。估算HAJ、ⅣP、M和NS．基因的核苷酸年进化速率分别为2．29×10^-3、1．39×10^-3、1．78×10^-3、1．30×10^-3／位点。Victoria系分离株HAl氨基酸重要变异位点主要包括K48E、L58P、N75K、K80R、K129N／S、N165K、S172P、S197N／D和A202V，Yamagata系分离株HAl的变异位点包括R48K、S150I、N166Y、N203S、G230D和D233N。2010年之后的Victoria系分离株NP氨基酸序列与Yamagata系毒株类似，与之前的毒株存在4个特征性氨基酸位点的变异，分别为A60D、L233V、N513S和V534I。结论1999--2012年浙江省乙型流感病毒分离株发生明显变异，表面抗原基因HAl进化速度快于内部基因，基因重配和基因突变是病毒发生变异的主要机制。; 茅海燕孙逸张严峻周敏陈寅李榛卢亦愚; 关键词：流感病毒B型流感病毒

一种寨卡病毒微滴式数字PCR检测引物探针组合物及其应用: 本发明提供了一种寨卡病毒微滴式数字PCR检测引物探针组合物及其应用，属于分子生物学技术领域。本发明具体公开了检测寨卡病毒的微滴式数字PCR引物探针组合物，核苷酸序列如SEQ ID No.1‑3所示。同时本发明还公开了寨卡...; 茅海燕颜浩孙逸严菊英楼秀玉王丰史雯张严峻

人感染禽流感病毒A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株HA基因序列分析: 2015年; 目的测定本市首例人感染禽流感病毒A/Zhejiang/LS01/2014（H7N9）株HA基因序列,分析H7N9禽流感病毒HA基因特点。方法采用real-time PCR检测患者H7N9禽流感病毒核酸,RT-PCR扩增病毒HA基因后测定核苷酸序列。结果实验室确诊丽水首例人感染H7N9禽流感患者。测序得到H7N9禽流感病毒长度为1 683 bp的HA基因核苷酸全序。A/Zhejiang/LS01/2014（H7N9）与我国江浙沪分离株HA基因核苷酸和氨基酸序列相似性都比较高,分别为98.8%~99.5%、98.9%~99.5%;与浙江鸡分离株A/chicken/Zhejiang/C483/2013（H7N9）序列相似性最高。A/Zhejiang/LS01/2014（H7N9）与我国江浙沪H7N9病毒株HA基因序列均处于同一进化分支;与浙江外环境分离株A/environment/Hangzhou/34/2013（H7N9）进化关系最近;与浙江鸡分离株A/chicken/Zhejiang/C483/2013（H7N9）进化关系次之;与韩国野鸟分离株A/wildbird/Korea/A3/2011（H7N9）处于同一进化分支。结论 A/Zhejiang/LS01/2014（H7N9）HA基因来源于浙江鸡携带的H7亚型流感病毒。HA基因具有低致病性禽流感病毒基因特征,但与人类呼吸道上皮细胞的亲和力增加,更容易感染到人。; 雷永良王晓光孙逸茅海燕叶碧峰刘敏; 关键词：禽流感病毒血凝素基因

孙逸

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