陆俊杏
- 作品数：47 被引量：159H指数：7
- 供职机构：重庆师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金重庆师范大学科研基金重庆市自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学轻工技术与工程更多>>
- 全国中学生生物学联赛“生物信息学”试题分析
- 2023年
- 全国中学生生物学联赛是生物学竞赛的初赛环节,2015年开始新增了生物信息学的相关内容。目前,对生物学联赛的“生物信息学”试题研究较少,通过对近八年(2015-2022)中学生物学联赛“生物信息学”试题的归纳梳理,明晰了此类试题的命题特点,且分别针对概念理解类、技术方法类、图标解析类与综合应用类样题进行了解读。据此,研究提出了注重现有课堂教学内容的广度拓展与深度进阶、强化统计学知识应用、以组学和系统生物学视角引领生命现象理解的教学建议。
- 曾雨洁陆俊杏李勃
- 关键词：生物学联赛生物信息学试题分析中学生物学
- 牡丹PoSAD基因克隆与表达分析被引量：4
- 2018年
- 以凤丹牡丹(Paeonia ostii)叶片为试验材料,采用RACE和RT-PCR方法,克隆得到凤丹牡丹硬脂酰-ACP去饱和酶基因SAD的cDNA全长,命名为PoSAD(GenBank登录号为KY038819)。序列分析表明,该基因cDNA序列全长1 559bp,其中开放阅读框1 197bp,编码398个氨基酸,3′端非编码区长172bp,5′端非编码区长123bp。多序列比对结果表明,凤丹牡丹PoSAD氨基酸序列含有2个保守结构域。系统发育分析结果显示,凤丹牡丹与蓖麻处于同一分支,其亲缘关系最近。TMHMM和TargetP亚细胞定位分析得知,PoSAD蛋白无跨膜区域,可能定位于叶绿体中发挥功能。组织特异性结果分析表明,PoSAD基因在凤丹牡丹的根、茎、叶、花瓣、雌蕊、雄蕊、种子中均有表达,且在花瓣中表达量最高,雌蕊中次之,在根中的表达量最低;不同时期种子中,60d表达量最高,80d次之,10d中表达量最低。
- 廖冰楠陆俊杏黄兴琳管丽白辉扬张涛
- 关键词：RACERT-PCR
- 芸薹属物种(B.napus,B.rapa,B.oleracea)CAMTA4基因家族的鉴定与进化分析
- 2020年
- 钙调蛋白在植物的生理代谢中起着重要作用,而钙调蛋白的转录翻译过程需要CAMTA的参与。为研究芸薹属植物中CAMTA4位点的分子进化,本研究利用生物信息学的方法,分析了甘蓝型油菜、白菜和甘蓝的CAMTA4家族核苷酸序列的基本特征和基因结构、蛋白序列的基本特征和功能域,以及它们的系统发生关系。结果显示,这3个物种的CAMTA4都具有CAMTA保守的结构域,且它们的进化符合禹氏三角理论和三倍化学说。本研究明确了甘蓝型油菜、白菜和甘蓝CAMTA4位点的进化历程,并且为研究芸薹属植物CAMTA的功能提供了生物信息学参考。
- 邓思雨唐蓓张涛陆俊杏
- 关键词：分子进化
- 甘蓝型油菜MAPK1在损伤和病原菌胁迫下的表达模式分析
- Objective The objective is to analyze tissue specific expression of BnMAPKlgenes,and explore their characteris...
- 陆俊杏李威柴友荣梁颖
- 关键词：GENEWOUNDFUNGISIGNALINGPATHWAY
- 葱兰和韭兰花色色素种类和质量分数的研究被引量：3
- 2014年
- 葱兰和韭兰背景性状相似,但花色一白一红,是园林绿化常用的一对姊妹花,有必要对其花色成分类型和色差原因进行研究.该研究提取了葱兰和韭兰的花瓣色素,用特征颜色反应法、紫外-可见分光光度计法和薄层色谱法进行了鉴定.结果表明:葱兰花瓣色素主要为黄酮类的木犀草素,不含花青素;韭兰花瓣色素既含有黄酮类的木犀草素和另一种迁移率大的未知黄酮类成分,还含有花青素类的锦葵色素.韭兰花瓣中总类黄酮质量分数为9.505mg/g,其中花青素(苷)的质量分数为1.375mg/g,葱兰花瓣总类黄酮质量分数为5.21mg/g.韭兰的红色花色源于其比葱兰多出的锦葵色素或其糖苷.该结果将深入解析韭兰和葱兰花色物质的结构和生物合成途径、克隆其相关功能基因和开展花色分子育种.
- 董博刘雪付春陆俊杏陆俊杏柴友荣
- 关键词：葱兰
- 紫苏二酰基甘油酰基转移酶2基因克隆与功能研究被引量：5
- 2020年
- 二酰基甘油酰基转移酶(diacylglycerol acyltransferase,DGAT)是植物合成三酰甘油(TAG)最后一步的关键酶,其中DGAT2在某些植物的种子油中能选择性积累更多不饱和脂肪酸。本文成功克隆了紫苏二酰基甘油酰基转移酶2基因(PfDGAT2),并进行生物信息学分析。PfDGAT2实时荧光定量结果表明,不同器官中PfDGAT2基因均有表达,10 d种子的表达量最高,在根中的表达量次之,在种子发育中后期,PfDGAT2表达量逐渐降低。与野生型拟南芥相比,过表达PfDGAT2拟南芥种子含油率提高了21.68%~77.89%,其中种子含油率增加最多的4个株系,其亚麻酸(C18:3)增加4.57%,花生一烯酸(C20:1)增加7.44%,花生二烯酸(C20:2)增加5.4%,二十二一烯酸(C22:1)增加10.37%,而棕榈酸(C16:0)、硬脂酸(C18:0)和亚油酸(C18:2)含量分别降低了3.47%、6.64%和4.83%,油酸(C18:1)和花生酸(C20:0)分别只降低了0.18%和1.91%。本研究结果表明,紫苏PfDGAT2基因不仅能提高种子含油率,还能促进亚麻酸、花生一烯酸等不饱和脂肪酸的积累,这为研究植物不饱和脂肪酸的合成积累提供了参考及理论依据。
- 鲁庚唐鑫陆俊杏李丹胡秋芸胡田张涛
- 关键词：不饱和脂肪酸紫苏
- 甘蓝型油菜MAPK7基因家族及其启动子的克隆与表达分析被引量：10
- 2013年
- 从甘蓝型油菜中克隆了MAPK7基因家族3个成员BnMAPK7-1、BnMAPK7-2和BnMAPK7-3的全长cDNA序列,它们最长标准mRNA分别为1593、1434和1547bp。系统进化分析表明,甘蓝型油菜MAPK7基因全部来自白菜,而且BnMAPK7-1/-2由白菜Bra03723祖先的基因加倍产生,而BnMAPK7-3则由白菜Bra037234的祖先基因进化形成。同时,克隆获得BnMAPK7-1/-2的启动子序列,该启动子里含有多个与光诱导相关的元件、激素响应元件和逆境胁迫响应元件。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)显示甘蓝型油菜MAPK7基因家族在所有的组织器官中均表达,并发现该基因家族的表达受植物激素(MeJA、ABA和SA)、信号分子(H2O2)、逆境(高温)以及伤害(损伤和核盘菌)的诱导,初步证明甘蓝型油菜MAPK7基因在植物逆境胁迫应答中起一定作用。实现了甘蓝型油菜MAPK7-1/-3基因的原核表达,并证明它们编码的蛋白主要以包涵体形式存在,为后续的研究提供了基础。
- 朱斌陆俊杏彭茜翁昌梅王淑文余浩李加纳卢坤梁颖
- 关键词：甘蓝型油菜实时荧光定量PCR原核表达
- 甘蓝型油菜MAPK1基因的克隆和功能鉴定
- 蛋白质激酶是一类可以使特定的蛋白质侧链中的丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基共价磷酸化的酶,蛋白质磷酸化可以控制酶的活性及其与其它分子的相互作用。促分裂原活化蛋白质激酶(mitogen-activated protein kin...
- 陆俊杏梁颖
- 关键词：MAP激酶信号通路
- 文献传递
- 甘蓝型油菜温敏细胞核雄性不育系160S花药败育的形态学特征和细胞学研究被引量：3
- 2021年
- 明确甘蓝型油菜温敏核雄性不育系160S花器形态变化、花药败育的时期和细胞学特征,初步探究败育的原因,为深入研究不育系160S的内在分子调控机制提供理论基础,也对其在油菜两系杂交育种中的实际应用具有指导意义。本研究在15℃和28℃条件下培养试验材料160S,利用体式显微镜分别观察花发育形态特征;采用醋酸洋红染色方法观察各时期小孢子发育形态;通过石蜡切片和苏木精-伊红染色对可育植株(MaleFertile/160S-MF)和不育植株(MaleSterile/160S-MS)花药细胞学特征进行显微观察;TUNEL染色法检测花药发育各时期绒毡层细胞凋亡情况。160S-MF在15℃表现为可育,雄蕊正常发育,成熟的花药呈黄色,形态饱满,正常开裂,表面一层有活性的花粉附着在上面;28℃条件下, 160S-MS花朵的雌蕊、萼片与160S-MF花朵无差异,但花瓣变小,花丝变短,雄蕊明显退化,花药干瘪呈黄褐色,无花粉粒附着在花药上,表现出雄性完全不育。160S-MF的小孢子能正常发育为成熟有活力的花粉。而160S-MS由于雄蕊完全败育,未观察到小孢子和花粉粒。160S-MS花药在造孢时期和花粉母细胞时期与160S-MF无明显差异,但在减数分裂期,160S-MS花药绒毡层形态和结构出现异常,绒毡层细胞排列不整齐,细胞空泡化,伴随提前解体。同时花粉母细胞发育受阻,无四分体结构形成,最终在减数分裂期完成前形成空的花粉囊。TUNEL检测发现, 160S-MS花药绒毡层细胞在减数分裂期开始凋亡。本研究结果表明, 160S属花粉母细胞败育型不育系,败育时期发生在减数分裂期,绒毡层异常降解,绒毡层未向腺质型转化,不能提供花粉母细胞发育所需要的营养物质,致使花粉母细胞发育受阻无法形成四分体结构,从而导致小孢子无法形成,花药形成空的花粉囊,产生雄性不育。
- 唐鑫李圆圆陆俊杏张涛
- 关键词：甘蓝型油菜花药败育细胞学研究
- 甘蓝型油菜SAMDC3基因及其启动子的克隆与分析被引量：8
- 2010年
- S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)是植物体内亚精胺和精胺前体物质形成的关键酶。本研究克隆了甘蓝型油菜(Brassica napus)BnSAMDC3基因家族2个成员的全长cDNA和启动子序列,并对其诱导表达特性进行了鉴定。BnSAMDC3-1(GenBank accession No.HM013966)和BnSAMDC3-2(GenBank ac-cession No.HM013967)的全长cDNA分别为1746bp和1754bp,开放阅读框(ORF)长度分别为1101bp和1104bp,在大ORF上游132bp处均包含一个171bp的小ORF。BnSAMDC3基因在叶片中表达量较高,受高温和干旱抑制。6-BA、GA3和SA抑制BnSAMDC3-1的表达,而GA3和甘露醇诱导BnSAMDC3-2表达上调。BnSAMDC3基因启动子具有多个与胁迫和激素诱导相关的顺势调控元件,表明BnSAMDC3可能通过ABA、6-BA和SA信号途径介导植物对非生物胁迫的响应。本研究将有助于进一步探讨甘蓝型油菜抗逆的分子机理,为甘蓝型油菜的栽培和品质改良奠定基础。
- 陆俊杏卢坤张凯曹廷李加纳梁颖
- 关键词：油菜S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶启动子激素
