缪炜
- 作品数:104 被引量:193H指数:9
- 供职机构:中国科学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国科学院知识创新工程中国科学院知识创新工程重要方向项目更多>>
- 相关领域:生物学环境科学与工程农业科学医药卫生更多>>
- 嗜热四膜虫组蛋白甲基化酶EZL2蛋白的功能研究
- 构成核小体的组蛋白上携带大量的表观遗传信息,其中组蛋白的翻译后修饰是最重要的形式之一.这些修饰影响以DNA为模板的几乎所有过程,如基因表达、DNA复制等.四膜虫的EZL2基因编码一种组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶,可催化形成...
- 陈晓熊杰缪炜刘一凡高珊
- 微型生物群落eDNA-PFU监测被引量:2
- 2021年
- 微型生物群落在水生态系统中起着至关重要的作用,是水生态系统食物链的关键环节,其结构和功能可以很好地反映不同生境的水质特征。《水质微型生物群落监测PFU法》是我国首个生物监测国家标准,被证明是一种快速、经济、准确的监测方法。然而,由于PFU法对专业知识要求较高、费时耗力且不易标准化,严重阻碍了该方法进一步的推广与应用。近年来,环境DNA(eDNA)技术的快速发展突破了微型生物形态鉴定的瓶颈,能高效、准确地鉴定出水环境中包括微型生物在内的各种水生生物。为此,文章提出微型生物群落eDNA-PFU法,即基于eDNA技术改进的PFU法,对微型生物群落进行监测。为了对eDNA-PFU法进行验证,文章针对武汉东湖水体中的原生动物群落开展了预实验,结果表明eDNA-PFU法较传统PFU法覆盖度与灵敏度均更高,可以真实、全面、准确地揭示水体中微型生物群落结构特征。因此,基于eDNA-PFU法的微型生物群落监测有望为湖泊、河流、水库等水体的生态考核提供新一代的生物监测标准。
- 姜传奇熊杰黄洁冯伟松龚迎春缪炜
- 关键词:微型生物群落原生动物藻类生物监测
- 基于嗜热四膜虫ABC转运蛋白鉴定分析的真核生物ABC转运蛋白分子进化研究
- 熊杰傅诚杰缪炜
- 缘毛类纤毛虫ITS1区的特征序列
- <正> Corliss在1968年将缘毛类纤毛虫提升为亚纲,作为寡膜纲四大组成类群之一(另三个亚纲分别为膜口亚纲、咽膜亚纲和盾纤亚纲)。现有游动目(Mobilida)和固着目(Sessilida),其中固着目包括12科3...
- 缪炜沈韫芬余育和
- 文献传递
- 嗜热四膜虫可变剪接基因鉴定及功能分析被引量:1
- 2015年
- 可变剪接是产生蛋白质组多样性和调节基因表达的重要机制,相关研究在高等真核生物中开展较多,而在单细胞真核生物中则较少,尤其是单细胞原生动物纤毛虫中,仅有少量报道。本文基于单细胞模式原生动物嗜热四膜虫种大量转录组数据,对其可变剪接基因进行了鉴定及分析。在嗜热四膜虫中共鉴定到2 894个可变剪接位点,涉及到2 698个可变剪接基因,可分为四类。考虑到转录本拼接的准确性,选择了其中464个与基因组预测模型完全一致的可变剪接基因进行深入分析,其中生长(growth)时期、饥饿(starvation)时期、接合生殖(conjugation)时期特异性的可变剪接基因分别为49个、79个和135个。对可变剪接基因的功能进行分析表明其涉及的功能广泛且显著富集于蛋白激酶过程,提示可变剪接基因在嗜热四膜虫蛋白磷酸化和信号传导中具有重要作用。
- 宁应之赵康平熊杰袁冬霞缪炜
- 关键词:嗜热四膜虫转录组可变剪接功能分析
- 原生动物四膜虫“小材”有“大用”被引量:10
- 2010年
- 在概述了原生动物四膜虫的基本知识和回顾了四膜虫在分子生物学领域的重要贡献的基础上,介绍了利用该单细胞真核模式生物所开展的四膜虫功能基因组学、毒理基因组学、进化基因组学和表观基因组学等方面的研究工作,并展望了四膜虫作为普通生物学实验进入中学和大学课堂的应用前景。
- 缪炜
- 关键词:四膜虫基因组学
- 四膜虫rDNA表达载体的改造及用于异源基因的高效表达被引量:1
- 2013年
- 基于四膜虫小核rDNA改造得到的pD5H8载体,在转染进接合生殖时期的四膜虫后能发育成9000~10000拷贝的大核rDNA,因此pD5H8载体是四膜虫异源基因表达的研究热点;但其载体上匮乏合适的克隆位点和无启动子结构阻碍了该载体的进一步发展。本研究在四膜虫启动子HSP70—2和终止子HSP70-I之间,通过稀有酶切位点I-SceI导入细菌绿色荧光蛋白NGFP)这一筛选标记,由此组成的DNA片段(HSP70-25’UTR.I-SceI—HGFP.I—SeeI—HSP70-13’UTR)整合进pD5H8,将之改造成pD5H8-HGFP表达载体。来自真核生物的绿色荧光蛋白(GFP)藉由l-SceI酶切位点一步导入pD5H8一HGFP表达载体后,在四膜虫中大量表达且具有生物学活性。因此,改造后的pD5H8一HGFP表达载体拥有一步法引入异源基因,几乎无酶切位点的限制,有效的筛选标记,高效的异源基因表达能力,以及环境友好、便捷可控等诸多优点,这对于深入开展四膜虫基因功能的过表达研究和开发异源基因在四膜虫这一真核表达系统中的应用奠定了技术基础。
- 袁冬霞冯立芳熊杰缪炜
- 关键词:四膜虫RDNA
- CYP5013C2蛋白及其编码基因以及表达CYP5013C2蛋白的四膜虫
- 本发明公开了一种CYP5013C2蛋白及其编码基因,并提供了表达CYP5013C2蛋白的四膜虫及其在降解DDT中的应用。本发明保护过表达CYP5013C2基因的四膜虫在降解DTT中的应用;所述CYP5013C2基因为编码...
- 缪炜冯立芳袁冬霞
- 文献传递
- 西藏温泉两种中国新记录纤毛虫第一双小核草履虫和明布雷斯四膜虫的形态学和系统发育学研究被引量:1
- 2020年
- 研究利用活体观察、蛋白银和氨银染色技术对采自西藏温泉的寡膜纲咽膜类纤毛虫第一双小核草履虫(Paramecium primaurelia)和膜口类纤毛虫明布雷斯四膜虫(Tetrahymena mimbres)进行了形态学研究,首次描述了这两种纤毛虫细胞核器的形态和位置、纤毛图式和口膜的排布模式;并且测定了SSU rDNA和COXⅠ标记基因序列,基于这两种基因的系统发育树均支持P.primaurelia聚在草履虫P.aurelia复合种中,T.mimbres聚在四膜虫T.borealis类群中。两种纤毛虫均为中国新记录种,且首次在高原温泉中发现,不仅为西藏地区温泉原生动物生物资源的发掘提供新的方法和思路,也为原生动物环境适应性研究提供基础资料。
- 姜传奇谷思雨安瑞志巴桑缪炜
- 关键词:纤毛虫形态学系统发育学
- 嗜热四膜虫SPO11基因缺陷型细胞株的基因表达变化分析被引量:2
- 2016年
- 有性生殖的关键过程是通过减数分裂产生生殖细胞,而减数分裂的一个重要环节是进行基于DNA双链断裂的同源染色体重组。在同源染色体重组过程中,SPO11蛋白催化产生DNA双链断裂,从而起始同源染色体的重组。因此,研究SPO11基因缺失在减数分裂过程中所引起的基因表达变化有助于在转录组水平上了解该基因的作用。本研究通过对嗜热四膜虫(Tetrahymena thermophila)野生型和SPO11敲除细胞株在接合生殖时期2 h、3 h、4 h、5 h四个时间点的转录组进行高通量测序。通过差异表达基因分析和功能富集分析,发现SPO11基因敲除之后嗜热四膜虫在接合生殖时期2 h时,与DNA代谢过程和DNA复制相关基因的表达发生变化,推测SPO11基因敲除导致的减数分裂过程异常可能与DNA代谢过程和DNA复制相关。
- 张晶闫冠雄田苗袁冬霞熊杰缪炜
- 关键词:嗜热四膜虫减数分裂基因表达转录组