河南农业大学农学院中药材工程技术研究中心
- 作品数：5 被引量：43H指数：4
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- 碎米桠及其近缘种的分子鉴定和亲缘关系研究被引量：10
- 2013年
- 目的构建碎米桠Isodonrubescens及其与近缘种之间系统发育关系，准确鉴别碎米桠及其近缘种。方法提取碎米桠及其近缘种DNA，对核基因ITS片段和叶绿体基因psbA-trnH序列扩增和测序，计算物种种内、种间Kimura2-parameter（K2P）遗传距离。采用最近距离、相似性搜索、构建Neighbor-joining（NJ）系统聚类树3种方法进行鉴定分析。结果ITS和psbA-trnH分子系统树支持碎米桠5个居群样本聚为一单系分支，支持率为94％和68％；其中，碎米桠与毛叶香茶菜、香茶菜和内折香茶菜聚在一支，支持率为70％和51％；溪黄草和显脉香茶菜构成姐妹群分支，支持率为81％和63％。碎米桠及其近缘种种间ITS和psbA—trnH序列的K2P遗传距离为0．00708～0．07261和0．00806～0．02476，均远大于碎米桠种内的遗传距离0～0．00176和0～0．00268。结论碎米桠与毛叶香茶菜、香茶菜和内折香茶菜亲缘关系较近，溪黄草和显脉香茶菜亲缘关系最近。ITS和psbA-trnH序列可以准确鉴别碎米桠及其近缘种。
- 夏至张红瑞李贺敏高致明
- 关键词：ITS亲缘关系
- 基于psbA-trnH基因序列对中药材茜草的分子鉴定被引量：7
- 2016年
- 目的通过对中药材茜草及其近缘种（易混品）的psb A-trn H基因序列进行分析,为中药材茜草的分子鉴定提供依据。方法提取中药材茜草及其近缘种的DNA,对叶绿体基因psb A-trn H序列扩增和测序,计算物种种内、种间Kimura 2-parameter（K2P）遗传距离。采用最近距离、相似性搜索、构建Neighbor-joining（NJ）系统聚类树3种方法进行鉴定分析。结果 psb A-trn H分子系统树支持中药材茜草不同居群样本聚为一单系分支,支持率为65%;中药材茜草与其近缘种psb A-trn H序列的种间遗传距离为0.00751~0.19338,远大于中药材茜草种内遗传距离0~0.00372。结论叶绿体基因psb A-trn H序列可以快速准确鉴别中药材茜草。
- 夏至王璐静李贺敏张红瑞高致明
- 关键词：PSBA-TRNH茜草分子鉴定
- 黄芩及其同属近缘种的DNA条形码鉴定研究被引量：25
- 2014年
- 目的利用DNA条形码鉴定技术，快速、准确地鉴别黄芩及其同属近缘种（易混品）。方法提取黄芩及其同属近缘种的DNA，对ITS和psbA．trnH序列扩增和测序，计算物种种内种间Kimura2-parameter（K2P）遗传距离。采用相似性搜索法、最近距离法、构建Neighbor-joining（NJ）系统聚类树等方法进行鉴定分析。结果黄芩及其同属近缘种种间的ITS和psbA-trnH’序列的遗传距离为0．06797～0．08880和0．05061～0．05737，明显大于黄芩种内的遗传距离0～0．00640和0～0．00311。ITS和psbA．trnH分子系统树显示，黄芩8个居群个体均聚为一单系分支，支持率均为100％，与其5个同属近缘种很好地区分开。3种鉴定方法表明，ITS和psbA．trnH序列适合鉴别黄芩及其同属近缘种。结论ITS和psbA．trnH序列可以有效准确鉴别中药材黄芩及其近缘种。
- 夏至冯翠元高致明李贺敏张红瑞
- 关键词：DNA条形码ITSPSBA-TRNH黄芩
- 鬼针草及其近缘种的分子鉴定和亲缘关系研究被引量：11
- 2014年
- 目的构建鬼针草Bidenspilosa及其与近缘种之间系统发育关系，准确鉴别鬼针草及其近缘种。方法提取鬼针草及其近缘种DNA，对核基因ITS片段和叶绿体基因psbA．trnH序列扩增和测序，计算物种种内、种间Kimura2-parameter（K2P）遗传距离。采用最近距离、相似性搜索、构建Neighbor-joining（NJ）系统聚类树3种方法进行鉴定分析。结果ITS和筇鲥．trnH分子系统树支持鬼针草不同居群样本聚为一单系分支，支持率为79％~I87％：其中，鬼针草与白花鬼针草构成一单系分支，金盏银盘与婆婆针构成姐妹群分支，上述两分支ITS和联合数据支持率均为100％；狼把草与柳叶鬼针草、大狼把草构成一单系分支（ITS和联合数据支持率为100％，psbA．trnH数据支持率为96％）。鬼针草及其近缘种种间ITS和psbA．trnH序列的遗传距离为0．00794～0．12880和0．00518～0．07452，均远大于鬼针草种内遗传距离0～0．00159和0～0．00252。结论鬼针草与白花鬼针草亲缘关系最近，金盏银盘与婆婆针构成姐妹群关系，狼把草与柳叶鬼针草、大狼把草亲缘关系较近。ITS和psbA—trnH序列可以准确鉴别鬼针草及其近缘种。
- 夏至高致明李贺敏张红瑞
- 关键词：PSBA-TRNH鬼针草分子鉴定亲缘关系
- 败酱及其近缘种的分子鉴定及亲缘关系研究被引量：1
- 2018年
- 为了构建败酱Patrinia scabiosifolia与近缘种之间系统发育关系,准确鉴别败酱及其近缘种,对其核基因ITS片段和叶绿体基因psbA-trnH序列扩增和测序,计算物种种内、种间Kimura 2-parameter,(K2P)遗传距离,并采用最近距离、相似性搜索和构建Neighbor-joining,(NJ)系统聚类树3种方法进行鉴定分析。结果表明,ITS和psbAtrnH分子系统树支持败酱不同居群样本聚为一单系分支,支持率分别为65%和68%;其中,败酱与攀倒甑(P. villosa)构成一单系分支,ITS和psbA-trnH数据的支持率分别为51%和99%。败酱及其近缘种种间ITS和psbA-trnH序列的遗传距离为0. 008 31～0. 072 92和0. 005 86～0. 039 18,均远大于败酱种内遗传距离0～0. 003 31和0。由此可知,中药材败酱与攀倒甑亲缘关系最近,ITS和psbA-trnH序列可以准确鉴别败酱及其近缘种。
- 李贺敏张红瑞夏至黄勇
- 关键词：ITS序列PSBA-TRNH败酱分子鉴定亲缘关系
