徐州医科大学神经生物学实验中心 作品数:5 被引量:18 H指数:2 发文基金: 国家自然科学基金 江苏省博士后科研资助计划项目 江苏省高校自然科学研究项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
大鼠C6胶质瘤细胞的基因表达谱 2018年 目的:筛选比较大鼠C6胶质瘤细胞与正常星型胶质细胞中的差异表达基因。方法:利用Illumina Hi Seq4000技术对大鼠C6胶质瘤细胞和正常星形胶质细胞进行转录组测序并对测序结果进行功能注释。以|log2 Fold Change|≥1和q值<0.05为标准筛选差异表达基因,并通过GO和KEGG数据库分析其功能和参与的信号通路。结果:较之正常星形胶质细胞,大鼠C6胶质瘤细胞中共筛选得到4363个差异表达基因,其中1603个基因表达上调,2760个基因表达下调;GO富集结果表明:4109个差异表达基因共映射到906个GO term,主要与GTP酶活性正性调节、基因表达正性调节、蛋白结合和钙离子结合等功能相关;KEGG富集结果表明:1535个差异表达基因共参与106条通路,富集最多的是PI3K-Akt信号通路和癌症发生通路。结论:成功获取大鼠C6胶质瘤细胞与正常胶质细胞的基因表达谱,并对其差异基因进行GO和KEGG注释,结果有助于胶质瘤发生发展的研究。 王丹 张琳 沙岩 唐传喜 孙蕾 高殿帅关键词:胶质瘤 转录组测序 差异表达基因 GO 大鼠C6脑胶质瘤模型的基因表达谱分析 被引量:2 2018年 目的:筛选和分析大鼠胶质瘤模型与正常星型胶质细胞中的差异表达基因。方法:构建大鼠C6颅内胶质瘤模型,利用Illumina Hi Seq 4000技术对大鼠胶质瘤模型的胶质细胞和正常星形胶质细胞进行转录组测序并对测序结果进行功能注释。以q值<0. 05为标准筛选差异表达基因,并通过GO和KEGG数据库分析其功能和参与的信号通路。结果:较之正常星形胶质细胞,大鼠胶质瘤模型组细胞共筛选得到9221个差异表达基因,其中4604个基因表达上调,4617个基因表达下调; GO富集结果表明:这些差异表达基因共映射到575个GO term,与各类结合相关的分子如蛋白结合、离子结合、小分子结合、核苷酸结合等功能富集显著; KEGG富集结果表明:差异表达基因共参与22条通路,富集最多的是癌症发生通路、MAPK通路、胞吞通路和黏着斑通路。结论:成功获取大鼠胶质瘤模型细胞与正常胶质细胞的基因表达谱,差异表达基因富集在癌症发生通路、MAPK通路、胞吞作用通路和黏着斑等生物学通路,这些信号通路可能在胶质瘤发生发展过程中发挥重要作用,对其进一步分析将为临床治疗胶质瘤提供新的靶点。 王丹 沙岩 胡俊峰 彭绘宇 高殿帅关键词:胶质瘤 转录组测序 差异表达基因 GO 未折叠蛋白反应参与辣椒素对C6胶质瘤细胞凋亡的机制 被引量:1 2018年 [目的]研究辣椒素对C6胶质瘤细胞的影响及其作用机制。[方法]常规培养C6细胞,MTT法检测细胞存活率。然后将C6细胞分为两组:正常对照组和辣椒素组,采用Western Blot检测Bcl-2、Caspase-3、IRE1、Bip、Chop和pe IF2α的表达;在JNK抑制剂SP600125的作用下,Western Blot法分析P-JNK、IRE1、Chop、Bcl-2和Caspase-3的表达情况。[结果]MTT检测结果显示,辣椒素可以引起C6细胞活力的降低,随着孵育时间的延长,C6细胞的活力逐渐降低,至24h时达到最低,再增加辣椒素的作用时间C6细胞的活力不变。Western Blot结果显示,在辣椒素组中,Bcl-2的表达与对照组(0. 7151±. 0949)相比,表达量降低(0. 4886±0. 1205),而Caspase-3的表达(0. 7555±0. 1155)与对照组(0. 5315±0. 0876)相比升高。并且未折叠蛋白反应(UPR)相关蛋白IRE1、Bip、Chop和p-e IF2α的表达水平与对照组相比均增加,差异有统计学意义。加入JNK抑制剂SP600125后,与辣椒素单独作用相比,IRE1、Chop和Caspase-3蛋白的表达降低,而Bcl-2蛋白的表达水平升高。[结论]辣椒素能够引起C6细胞凋亡和未折叠蛋白反应(UPR)的发生,并且JNK信号通路在其中发挥了重要的作用。 刘亚萍 董富兴关键词:辣椒素 凋亡 未折叠蛋白反应 JNK 胶质瘤 2型糖尿病伴急性多发性脑梗死患者焦虑、抑郁情绪与认知功能障碍的相关性 被引量:14 2016年 目的研究2型糖尿病伴急性多发性脑梗死患者焦虑、抑郁情绪与认知功能障碍的相关性。方法 2型糖尿病患者69例,根据头颅MRI影像学检查结果分为2型糖尿病伴急性多发性脑梗死组(研究组)34例,平均年龄(66.53±9.25)岁;不伴脑梗死的单纯2型糖尿病组(对照组)35例,平均年龄(62.34±9.77)岁。受试者均测定身高、体重、血压、血脂谱、糖化血红蛋白(Hb A1c),采用汉密尔顿焦虑(HAMA)、抑郁(HAMD)量表评定两组焦虑、抑郁状况,采用蒙特利尔认知评估(Mo CA)量表测评两组认知功能。结果研究组收缩压及HAMA、HAMD评分均显著高于对照组(P<0.05)。研究组Mo CA评分显著低于对照组HAMD(P<0.001)。相关分析显示,研究组HAMD评分呈显著正相关(P<0.001),HAMD评分与Mo CA评分呈负相关(P<0.05)。结论 2型糖尿病伴急性多发性脑梗死患者比单纯糖尿病患者存在更多的焦虑、抑郁情绪及认知功能障碍,焦虑、抑郁情绪常同时存在,抑郁情绪越明显,认知功能障碍越严重。 彭丹 李伟 周冬梅 宋远见关键词:2型糖尿病 焦虑 抑郁 认知功能障碍 过表达N-cadherin基因慢病毒表达载体的构建及稳定细胞株的建立 被引量:1 2017年 目的建立稳定过表达N-cadherin的人类胃癌MGC-803细胞系。方法从含有N-cadherin的质粒中利用PCR技术克隆N-cadherin基因编码序列。制备并浓缩慢病毒颗粒,将构建好的过表达N-cadherin慢病毒载体感染MGC-803细胞,并稳定遗传,嘌呤霉素筛选的阳性克隆传代培养5代后鉴定细胞内N-cadherin的表达。结果荧光显微镜下过表达N-cadherin组细胞有绿色荧光表达;PCR扩增得到含N-cadherin基因编码序列的特异性条带;重组的过表达N-cadherin载体中,过表达N-cadherin编码序列与目标序列几乎一致;Western blotting结果显示,在分子量为98 k D处有相应条带。结论成功建立稳定过表达N-cadherin的人类胃癌MGC-803细胞,此研究为进一步探讨N-cadherin基因的功能提供了良好的研究基础。 李想 秦雪柳 丁梅 曲德伟关键词:N-CADHERIN 过表达