宁夏医科大学医学科学技术研究中心(宁夏回族自治区医学科学研究所) 作品数:34 被引量:69 H指数:5 相关作者: 雄英 王淑静 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 宁夏回族自治区自然科学基金 教育部“春晖计划” 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 化学工程 更多>>
细粒棘球绦虫蛋白Actin-binding LIM protein 1的生物信息学分析 被引量:1 2023年 目的对细粒棘球绦虫肌动蛋白结合LIM蛋白1(Actin-binding LIM protein 1,AbLIM1)进行生物信息学预测,以期为包虫病的诊断治疗积累研究资料。方法通过NCBI数据库获取EgAbLIM1的氨基酸序列;使用在线软件分析蛋白质的理化性质、二级结构、三级结构,并对其亚细胞定位、蛋白质结构以及抗原表位进行预测;使用GEPIA2.0数据库预测编码EgAbLIM1基因的相关基因,使用DAVID数据库以及R语言进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果EgAbLIM1由753个氨基酸组成,理论等电点为9.51;EgAbLIM1的二级结构中α螺旋占22.05%,延伸链占12.62%,β-转角占5.44%,无规卷曲占59.89%。优势B细胞表位肽有6条,优势HLA-DRB1*0401限制性Th表位位置为572-584位氨基酸;优势HLA-DRB1*0701限制性Th表位位置为247-261、504-511位氨基酸。分子生物学功能相关程度最高的是钙黏连结合(cadherin binding)、参与细胞-细胞粘附的钙黏连结合(cadherin binding involved in cell-cell adhesion)、细胞-细胞粘附介质的活性(cell-cell adhesion mediator activity)等。结论生物信息学方法预测细粒棘球绦虫AbLIM1含有多个抗原表位并对其关联基因进行了富集分析,为包虫病的诊断和药物治疗靶点筛选提供理论依据。 钱炳硕 张婷婷 王明霞 朱明星关键词:细粒棘球绦虫 生物信息学分析 抗原表位 黄芪注射液对大鼠脑出血后出血灶周围神经元超微结构的影响 目的:研究黄芪对大鼠脑出血灶周围凋亡神经元超微结构的保护作用。方法:将25只雄性SD大鼠随机分成黄芪治疗组,出血对照组和正常对照组;其中黄芪治疗组又分成出血后0、6、24 h治疗组。各组均于72 h后处死。电镜观察不同时... 秦毅 张海宇 马全瑞 张焱 张莲香 王登科 孙征关键词:脑出血 超微结构 文献传递 宁夏野生荨麻水提取物对糖尿病大鼠血糖血脂的调节作用 被引量:3 2016年 [目的]观察宁夏野生荨麻(Urticaangustifolia Fisch.Ex Hornem.)水提取物对2型糖尿病大鼠血糖、血脂及氧化应激的影响。[方法]SD大鼠适应性喂养1周后,随机分出10只为正常对照组喂以基础饲料,自由进食进水;其余大鼠喂以高脂饲料自由饮水,喂养4周后腹腔注射链尿佐菌素(STZ,45 mg/kg)诱导2型糖尿病模型。将造模成功的大鼠随机分成3组,每组10只,即糖尿病模型组,荨麻高剂量组(300 mg/kg),荨麻低剂量组(150 mg/kg)。各组给予相应药物灌胃,正常对照组和糖尿病模型组给予生理盐水灌胃,均每日1次,连续灌胃4周结束。期间每周测定空腹血糖值1次,并于灌胃结束后测定各组大鼠血清中总胆固醇(CHOL)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)、超氧化物歧化酶(SOD)及丙二醛(MDA)。[结果]与模型对照组相比,高、低浓度荨麻组均能够降低大鼠CHOL(P<0.05);低浓度荨麻组能够降低TG(P<0.05),高、低浓度荨麻组对HDL和LDL的作用不明显(P>0.05)。与模型对照组相比,高、低浓度荨麻组均可以升高血清中SOD水平(P<0.01);低浓度荨麻组可以降低血清中MDA水平(P<0.01),但高浓度荨麻组对于MDA水平的影响无统计学意义。[结论]宁夏野生荨麻水提取物具有降低血糖、调节血脂和抗氧化应激的作用。 陈铭扬 马巧莹 马佳媛 陈金珠 李辉 黄琪 袁登举 苏文贵 王嘉丽 朱明星关键词:血糖 血脂 多房棘球绦虫热休克蛋白90的生物信息学分析 2023年 目的预测多房棘球绦虫热休克蛋白90(Echinococcus multilocularis HSP90,EmHSP90)的生化特性、结构和抗原表位,为泡型包虫病肽疫苗的研究提供理论基础。方法登陆NCBI数据库检索并下载EmHSP90的氨基酸序列,通过Expasy在线预测网站预测EmHSP90的理化性质;采用PRABI数据库中的SOPMA预测EmHSP90的二级结构;利用SWISS-MODEL在线预测网站预测EmHSP90的三级结构;通过在线工具NetAcet-1.0预测EmHSP90的乙酰化位点,Netphos3.1预测EmHSP90的磷酸化位点,NetNGlyc1.0预测EmHSP90的N-糖基化位点;利用在线数据库TMHMM预测EmHSP90的跨膜结构域;利用在线数据库Signal P-5.0 Server预测EmHSP90的信号肽序列;通过在线数据库Predicting Antigenic Peptides预测EmHSP90的抗原决定簇;利用IEDB数据库预测EmHSP90的优势B细胞表位;利用SYFPEITHI在线数据库预测EmHSP90的T细胞优势表位。结果EmHSP90由711个氨基酸组成,其相对分子质量为80.04924×10^(3),不稳定系数41.09,为不稳定蛋白;亲水性平均系数-0.276,是亲水性蛋白;其二级结构中α螺旋占50.91%,β转角占4.92%,延伸链占13.92%,无规则卷曲占30.24%;含有1个乙酰化位点,64个磷酸化位点(40个丝氨酸(Ser)磷酸化位点,16个苏氨酸(Thr)磷酸化位点,8个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点)及4个N-糖基化位点;不含信号肽序列和跨膜结构域;EmHSP90的平均抗原倾向指数为1.0244,共有27个抗原决定簇区域;该蛋白共有B细胞优势表位10条,CTL细胞优势表位13条,Th细胞优势表位14条。结论生物信息学方法预测EmHSP90为不稳定亲水性蛋白,含有B细胞优势表位和T细胞优势表位,可为泡型包虫病肽疫苗的研制提供参考。 常亮亮 吕咏雪 张翠影 朱亚洲 赵巍关键词:多房棘球绦虫 疫苗 载三联抗痨药人工缓释材料的制备及物理性能测定 目的:通过压缩强度的测定和扫描电镜的观察,评价本研究制备的载三联抗痨药HRZ硫酸钙/聚氨基酸人工缓释材料的物理性能,从而制定构成缓释材料各成分的优化配比方案。方法:实验组分为A1、A2、A3、A4、A5五个亚组,避光环境... 王骞 刘海涛 王自立 施建党 耿广起 杨宗强 王洁关键词:抗痨药 扫描电镜 细粒棘球绦虫重组Eg.myophilin蛋白诱导免疫小鼠脾细胞增殖及细胞因子水平的变化 目的:探讨细粒棘球蚴绦虫(Echinococcus granulosus,Eg)亲肌肉抗原重组疫苗(Eg.myophilin)诱导ICR小鼠产生的免疫保护机制。方法:将亲肌肉抗原重组疫苗采用皮下注射的方法免疫ICR小鼠,... 马锐 师志云 王娅娜 李宗吉 孙俊峰 赵巍关键词:细粒棘球蚴 脾细胞 文献传递 细粒棘球绦虫抗原Fis1的生物信息学分析 被引量:3 2022年 目的利用生物信息学的方法分析细粒棘球绦虫Fis1(EgFis1)蛋白的抗原表位,为分子肽疫苗的研发奠定理论基础。方法在NCBI数据库中检所并下载EgFis1蛋白的氨基酸序列;利用EXpasy软件预测蛋白的理化性质;采用SignalP5.0和TMHMM sever 2.0软件预测EgFis1蛋白的信号肽和跨膜结构域;利用SOPMA和SWISS-MODLE预测EgFis1蛋白的二级结构和三级结构;采用IEDB、ABCpred和SYFPEITHI数据库预测EgFis1蛋白的T、B细胞表位。结果细粒棘球绦虫EgFis1是由157个氨基酸组成的等电点为5.86,分子质量单位为16.93ku的蛋白质;不含有信号肽序列,但具有一个跨膜结构域;其二级结构中α-螺旋占比例为48.41%,延伸连占19.11%,β-转角占7.01%,无规则卷曲占25.48%。亲水性较强的区域主要位于12aa-24aa,42aa-52aa,64aa-69aa,81aa-90aa,97aa-105aa,126aa-150aa。Eg-Fis1含有3个优势B细胞表位,7个T细胞表位以及2个T、B联合表位。结论生物信息学方法预测EgFis1蛋白含有4个优势B细胞表位、7个T细胞表位以及2个T、B联合表位,可作为免疫治疗和药物治疗的靶点。 肖静 曲晨 赵嘉庆关键词:细粒棘球绦虫 生物信息学 抗原表位 青春期大鼠癫痫发作后海马齿状回颗粒细胞层神经细胞增殖的改变 被引量:7 2012年 目的:探讨青春期大鼠癫痫发作后海马齿状回颗粒细胞层神经细胞数量的变化。方法:选择健康4周龄雄性SD大鼠,应用氯化锂-匹罗卡品药物点燃造模,造模成功后根据取脑组织时间分为24 h组、2周组、4周组,并设相应的对照组。溴脱氧尿嘧啶核苷(BrdU)标记后免疫荧光染色,用激光共聚焦观察大鼠海马齿状回(DG)颗粒细胞层BrdU阳性细胞。结果:24 h和2周实验组BrdU阳性细胞显著增多,分别较对照组增加55.1%和39.6%,2周实验组比24 h实验组降低15.5%(P<0.05);4周实验组BrdU阳性细胞数较对照组无明显差异(P>0.05)。结论:青春期大鼠癫痫发作可引起海马齿状回颗粒层神经细胞增殖的升高,但随着时间的延长有下降的趋势,至4周左右神经细胞的增殖趋于正常。 郑艳宇 张义伟 马江波 李云鸿 刘娟关键词:癫痫 增殖 海马齿状回 BRDU 细粒棘球绦虫原头节抗原Eg-01883的B细胞表位预测、筛选及其血清学诊断价值 被引量:2 2019年 目的应用计算机软件分析细粒棘球绦虫原头节特异性抗原分子Eg-01883,预测其可能形成的B细胞表位,并探讨其B细胞表位的免疫反应性及诊断价值。方法使用在线软件SOPMA及DNAStar分析Eg-01883的二级结构,采用SWISS-Model预测该蛋白的三级结构。应用在线软件ABCPred和IEDB结合其亲水性、柔韧性、表面可及性、抗原性等二级结构和三级结构对其B细胞表位进行分析预测、并人工合成表位肽段;以完整蛋白rEg-01883免疫小鼠产生的抗血清为一抗,采用间接ELISA方法筛选免疫反应性较强的表位,然后再以感染细粒棘球绦虫的小鼠血清为一抗,ELISA检测其免疫反应性,评价其诊断价值。结果初步筛选出7条抗原指数较高的Eg-01883表位,B细胞表位区域位于1-15、19-34、155-169、180-196、216-232、236-248、271-287位氨基酸。合成上述表位,纯度为99.99%。使用完整蛋白免疫血清筛选出2条反应原性较强的优势表位19-34和180-196,细粒棘球蚴感染小鼠血清能识别这两条B细胞表位,A450值结果分别为0.8218±0.0406和0.6398±0.0447,与对照组A_(450)值0.3312±0.0267和0.2961±0.0284比较差异均有统计学意义(P<0.05)。结论成功筛选到两个潜在的B细胞表位诊断抗原肽,对进一步开发细粒棘球绦虫早期诊断抗原和研究优势表位疫苗具有重要意义。 赵殷奇 徐士梅 朱明星 朱明星 吕咏雪 赵瑞 赵巍关键词:细粒棘球绦虫 B细胞表位 黄芪注射液对大鼠脑出血后出血灶周围神经元超微结构的影响 目的:研究黄芪对大鼠脑出血灶周围凋亡神经元超微结构的保护作用。方法:将25只雄性SD大鼠随机分成黄芪治疗组,出血对照组和正常对照组;其中黄芪治疗组又分成出血后0、6、24h治疗组。各组均于72h后处死。电镜观察不同时间点... 秦毅 张海宇 马全瑞 张焱 张莲香 王登科 孙征关键词:脑出血 超微结构 文献传递