厦门大学生命科学学院生物化学与生物技术系 作品数:22 被引量:46 H指数:4 相关作者: 黄河清 翁鹭娜 金宏伟 孔波 陈东仕 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 福建省自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 理学 医药卫生 农业科学 更多>>
细菌铁蛋白电子光谱和释放铁动力学的新颖特性 被引量:3 2006年 棕色固氮菌细菌铁蛋白(Bacterial ferritin ofAzotobacter vinelandii,AvBF)分子结构由蛋白壳、铁核和横跨蛋白壳的电子隧道组成.细菌铁蛋白由24个相同类型的亚基组成,其分子量略高于魟鱼肝铁蛋白(Liver ferritin ofDasyatis aka-jei,DALF).电泳纯的AvBF在可见光谱区内呈现出4个特征吸收峰,波长分别位于414(α峰),525(β峰),555(S峰)和585(未知)nm.经Na2S2O4还原后,其AvBF在紫外可见区内的整体吸收峰强度明显增高.经物理铂金电极还原后,AvBF的α特征吸收峰(414 nm)强度随着控制还原电位降低(-200,-400,-600 mV vs NHE)而增强.动力学研究表明,在弱碱(pH8.0)条件下,AvBF和DALF均以二分之一级反应动力学方式释放铁,均未表现出释放铁速率转换行为,认为AvBF和DALF的释放铁速率和铁蛋白蛋白壳的柔性调节速率处于同步进行状态,使铁蛋白释放铁的过程符合二分之一级反应动力学规律. 胡晓慧 黄河清关键词:细菌铁蛋白 棕色固氮菌 电子光谱 动力学 双向电泳技术研究镉诱导后牙鲆肝的差异蛋白质组 被引量:1 2008年 采用改良的TCA/丙酮法直接提取牙鲆肝脏蛋白质组,并采用双向凝胶电泳技术予以分离.实验结果表明:经氯化镉诱导后,牙鲆肝表达出16个差异蛋白质(斑点),其中4个斑点上调,2个斑点下调,6个斑点消失,新增4个斑点;并且蛋白质斑点在凝胶上的分布表现出较高的重复性.一旦这些差异蛋白质点在双向凝胶电泳图谱上实现标准指纹化后,其图谱中的差异蛋白斑点分布规律可用于监测与评价流动水体中镉污染程度及危害性. 黄清育 朱金勇 陈盈盈 陈东仕 黄河清关键词:镉污染 蛋白质组 双向电泳 牙鲆 污染监测 不同等电点的魟鱼肝铁蛋白释放铁速率的比较研究 2008年 选用热变性法、离子交换层析技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术(PAGE)小批量制备电泳纯魟鱼肝铁蛋白(Liverferritin ofDasyatis akajei,DALF)和黄牛胰脏铁蛋白(Scalper pancreas ferritin,SPF).等电聚胶电泳技术指出,DALF和SPF分别显示3和2条不同等电点铁蛋白层析带,推测这一现象与铁蛋白含铁量无关,与各自蛋白壳H和L亚基分布不同且形成不同表面电荷有关.不同等电点且相同含铁量的DALF,表现出不同的释放铁速率,其释放铁全过程均可分为快速和慢速阶段,符合一级反应动力学规律.铁蛋白可通过自身蛋白壳H和L亚基分布和相互作用强度的差异性,产生不同的柔性调节作用,控制不同释放铁的速率. 朱锋 陈盈盈 胡晓慧 林志超 王群力 黄河清关键词:等电点 动力学 提取与分离方法影响海兔口腔神经节蛋白质组的分离效果 2008年 选用丙酮沉淀法和直接裂解法分别提取离蓝斑背肛海兔(Notarcus leachii cinvsus Stimpson,NLCS)口腔神经节(Buccal Ganglion,BG)全蛋白质,发现采用直接裂解法所获得BG蛋白质种类多于丙酮沉淀法.在第一向等电聚焦电泳(IEF)中,分别选用pH为3.0—9.0,4.0~6.0和5.0~8.0的载体两性电解质,发现载体两性电解质pH范围为5.0—8.0时分离效果最好.使用Melanie 4 Trial软件统计BG蛋白质斑点数目约为290点,适于开展BG蛋白质组学研究. 朱斌琳 陈东仕 翁露娜 颜利 黄河清关键词:蛋白质组 PH 蛋白质组学技术筛选与鉴定镉诱导下褐云玛瑙螺肝脏的差异蛋白质 被引量:1 2009年 比较丙酮/TCA沉淀法和直接裂解法,优化提取与分离褐云玛瑙螺(Achatina fulica,AF)肝脏全蛋白。采用丙酮/TCA沉淀法,可获得约600个蛋白质斑点。用0.5 mg/L CdCl2溶液浸泡后的去梗小白菜喂养AF,并作为镉盐诱导AF肝脏表达应激蛋白质的实验材料。采用蛋白质组学技术筛选出由镉盐诱导AF肝脏表达的14个差异蛋白质斑点,并用肽质量指纹图谱技术(peptide mass fingerprinting,PMF)和数据库比对法初步鉴定出7种差异蛋白质,其中部分为热激蛋白(heat shock protein)、甲基转移酶(Methyltransferase)、三磷酸腺苷结合盒子转运体(ABC transporter)、钼酸盐转运子亚基(molybdate transporter subunit)和磷酸甘油酸变位酶(phosphoglycerate mutase)。差异蛋白质均参与镉盐代谢,并适合作为监测土壤或食物中镉污染程度及危害性的指示蛋白质。 陈海滨 黄琳 黄清育 凌雪萍 朱锋 黄河清关键词:差异蛋白质 蛋白质组学 污染监测 肝脏 厦门海洋微生物抗肿瘤药物研究进展 海洋微生物药物是当前药物研究领域的主要热点之一.厦门大学微生物药物学创新团队自上世纪80年代开展海洋放线菌活性物质的研究,从1995年起开始系统研究我国东南海海洋微生物资源,侧重研究台湾海峡海洋动植物共附生微生物及其活性... 沈月毛 胡志钰 王若宇 扬丽姗 吴乔 郑忠辉 黄耀坚 宋思扬 苏文金 张连茹 钱晓鸣 徐庆妍 鲁春华关键词:红树植物 内生真菌 抗肿瘤活性 文献传递 金乌贼脑和视神经节蛋白质组比较分析 2009年 采用双向凝胶电泳(2D-PAGE)技术优化分离金乌贼的脑及视神经节全蛋白质,并选用肽质量指纹谱(Peptide mass fingerprinting,PMF)技术和数据库检索方法对2D-PAGE图谱上的部分蛋白质斑点进行鉴定,初步构建了金乌贼视神经节(Optic ganglion ofSepia esculenta,SEOG)和脑神经节(Cerebral ganglion ofSepia es-culenta,SECG)部分分子解剖图谱.用Melanie 4 Trial软件分析脑神经节和视神经节蛋白质斑点总数量分别为682和594个,其中SECG蛋白质斑点数量明显多于SEOG.在脑神经节和视神经节中均发现了线粒体苹果酸脱氢酶前体(Mitochondrial malate dehydrogenase precursor,pre-MDH)及可溶性NSF连接蛋白(SNAP-typeproteins).此外,延长因子(Elongation factor G)、微管蛋白(Tubulin)和肌动蛋白(Actin)等蛋白质也具有高匹配率.已鉴定的蛋白质,多数归属于假定蛋白和结构蛋白类. 黄福生 陈海滨 黄琳 黄河清关键词:金乌贼 脑神经节 视神经节 蛋白质组学 优化海兔肝蛋白质组提取与分离技术 被引量:10 2006年 为了提高海兔肝脏蛋白质组的提取及研究效率,本文描述和比较了3种提取海兔肝脏蛋白质组的方法:裂解液浸泡-超速离心,丙酮-TCA沉淀-裂解液浸泡,裂解液浸泡-丙酮-TCA-裂解液溶解.然后采用常规SDS-PAGE双向电泳对提取出的蛋白质进行检验,用M elan ie 4 Trial软件分析电泳图谱,通过对蛋白质分辨率和斑点总数的比较,选出一种更适合海兔肝蛋白质的提取方法.结果表明采用丙酮-TCA沉淀-裂解液浸泡法提取海兔肝蛋白质所得的双向电泳图谱不论从蛋白质斑点分辨率还是总数上都优于其他两种方法,更适合提取分离海兔肝脏蛋白质. 李志丹 包晓东 黄慧英 黄河清关键词:蛋白质组 优化提取与分离海兔大脑神经节蛋白质组 被引量:3 2006年 蓝斑背肛海兔(Notarcus Leachii cirrosusStimpson,NLCS)属于海洋软体动物.NLCS大脑神经节(cerebral ganglion,CG)富含高丰度的脂类物质,并干扰了三氯醋酸-丙酮法沉淀CG蛋白质.本实验的目的是找到一种适合提取、分离海兔CG蛋白的方法.经各种实验方法对比后,发现超速离心法能有效分离CG破碎液中的脂类化合物,提高双向凝胶电泳法分离BG蛋白质组的分辨率,大约可检测到450个蛋白质点. 詹怿婕 陆永进 卓慧钦 凌雪萍 黄河清关键词:海兔 蛋白质组 电泳和质谱技术研究4种胰脏铁蛋白的亚基类型和等电点特性 被引量:1 2009年 采用电泳和质谱技术对所制备的鸡、鸭、牛和猪胰脏铁蛋白的亚基类型和等电点特性进行了研究。采用天然聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术研究的结果表明,上述4种铁蛋白呈现不同的迁移率,据此可知鸡胰铁蛋白的相对分子质量(Mr)〉鸭胰铁蛋白的Mr〉黄牛胰铁蛋白的Mr〉猪胰铁蛋白的Mr,而且均大于马脾铁蛋白(HSF)的Mr。采用十二烷基硫酸钠(SDS)-PAGE技术研究的结果表明,上述4种铁蛋白均由H(heavychain)和L(1ightchain)类型的亚基组成,但H和L亚基的相对数量(即H/L亚基数量的比值)有差别。采用肽指纹图谱技术分别鉴定各铁蛋白的H和L亚基。选用变性等电聚焦方法研究发现,上述4种铁蛋白分别由3~6种不同等电点的亚基聚合体组成,说明铁蛋白的H和L亚基之间呈现复杂的相互作用和不同的聚合体。不同陆生动物胰脏铁蛋白亚基之间相互作用的强度和聚合态存在着差异,这一差异特性可能与调控铁蛋白释放铁的速率有关,也与动物对铁的需求和铁解毒速率有关。 林志超 林青 朱峰 黄河清关键词:电泳 质谱 肽质量指纹图谱 胰脏 亚基