新疆维吾尔自治区高技术研究发展计划项目(201111116) 作品数:11 被引量:44 H指数:5 相关作者: 李波 杨洋 胡文冉 李晓东 王玉晶 更多>> 相关机构: 新疆农业科学院 新疆农业大学 新疆师范大学 更多>> 发文基金: 新疆维吾尔自治区高技术研究发展计划项目 国家自然科学基金 新疆维吾尔自治区自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
陆地棉CAD基因家族的进化和表达分析 被引量:5 2016年 【目的】对陆地棉CAD基因家族成员进行进化和表达分析,了解其在棉纤维发育中的作用。【方法】应用生物信息学方法,从棉花基因组中筛选出21个CAD基因,并对CAD的基因结构、染色体分布、基因倍增模式以及系统进化进行分析。利用深度表达数据分析CAD基因在棉纤维发育各时期的表达。对比观察拟南芥cad5突变体和野生型根毛表型。【结果】同源性高的CAD基因复制对之间有相似的基因结构;片段重复和串联重复是CAD基因扩增的主要方式。进化分析可知,CAD基因可分为七个亚组,且功能相近的基因聚类在相同亚组。利用深度测序表达数据分析可知,CAD基因在棉纤维各个发育时期均有表达。对比拟南芥cad5突变体和野生型根毛发现,突变体相比于野生型有更长的根毛。【结论】CAD基因参与了棉纤维的发育的过程,并对棉花纤维发育起到一定的调控作用。 张经博 李波 杨洋 胡文冉 陈方圆 谢丽霞 范玲关键词:棉纤维 系统进化分析 根毛 棉花GhCOMT1基因的正义、反义与RNAi干扰载体的构建及转化 2013年 【目的】咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)是苯丙烷代谢途径中的一个关键酶催化,通过转基因技术深入研究GhCOMT1基因在棉纤维发育和木质素代谢途径中的作用。【方法】采用由棉纤维组织特异性启动子E6驱动的GhCOMT1基因构建正义、反义表达载体GhCOMT1基因的植物表达载体和RNAi干扰载体并转化棉花。【结果】目的基因成功整合至表达质粒中并且获得转基因后代。【结论】构建了由棉纤维组织特异性启动子E6驱动的GhCOMT1基因正义、反义表达载体;同时克隆了GhCOMT1基因的一段450 bp高度保守的NBD区序列,构建了GhCOMT1基因的RNAi干扰载体,并将上述载体转入农杆菌菌株LBA4404并成功转化棉花。 李晓东 李波 倪志勇 张桦 范玲关键词:棉花 RNAI 棉花种间SSR标记遗传图谱的构建 被引量:1 2014年 【目的】利用已有的棉花种间分子遗传连锁图谱信息,在陆地棉和海岛棉之间筛选具有共显性差异的SSR标记,并用这些标记构建新疆棉花海陆杂交BC1群体的遗传图谱。【方法】使用Bio Mercator软件比较分析10张不同群体(亲本不同)构建的遗传图谱,选择至少已在3个不同的群体中被定位,且在不同的图谱中被定位在同一条染色体上的SSR标记作为候选标记。将候选标记在多个陆地棉和海岛棉品种间进行多态性检测后,利用具有共显性差异的标记对陆海杂交BC1群体进行基因型分析,使用Joinmap软件构建遗传连锁图谱。【结果】从5 501对SSR引物中初选了763对,经检验具有多态性的引物403对,多态性比例为53%。选用其中77对引物在5个陆地棉和5个海岛棉之间进行扩增,有21对SSR引物在所有的亲本之间均具有多态性。77对SSR引物对BC1群体[(Gh line 565×Gb新海25号)×Gh line 565]的94株材料基因型进行检测,构建了一张由53个SSR标记,16个连锁群组成,全长为643.4 c M的遗传连锁图谱。【结论】利用77个SSR标记构建了棉花种间遗传图谱。为新疆棉花遗传图谱的绘制提供较准确的锚定标记和有育种潜力的共显性差异标记。 王玉晶 杨洋 胡文冉 曹佳强 张桦 范玲关键词:棉花 SSR 海岛棉与陆地棉不同纤维发育时期苯丙烷代谢相关基因表达差异比较 2012年 【目的】比较研究在海岛棉与陆地棉纤维发育过程中苯丙烷代谢相关基因(PAL和4CL)表达模式的差异。【方法】利用荧光定量PCR,检测不同品种来源纤维在不同发育时期目的基因表达量。【结果】发现PAL1及4CL1基因的表达量随纤维发育天数的增加而增加,在陆地棉军棉1号中,基因表达量在15 DPA达到最高,而在海岛棉新海20号中PAL1及4CL1基因的表达高峰期则为20 DPA。【结论】发现PAL1基因与4CL1基因的表达模式在海岛棉与陆地棉纤维发育过程中出现差异,海岛棉中两个基因的表达高峰期均晚于陆地棉,为逐步揭示海岛棉和陆地棉纤维品质差异的分子机理奠定了一定实验基础。 吕淑萍 李波 李晓东 杨洋 范玲关键词:陆地棉 海岛棉 纤维品质 基因表达 外源松柏醛和芥子醛影响棉纤维苯丙烷代谢途径基因表达及生长 被引量:2 2013年 利用棉花胚珠离体培养和半定量RT-PCR及数字化图像处理技术,通过体外饲喂不同浓度苯丙烷代谢途径中间代谢物松柏醛(CA)和芥子醛(SA)来研究在棉花纤维发育过程中苯丙烷代谢关键中间产物对棉花纤维发育的影响。结果表明,在离体培养棉纤维中,不同浓度(100μmol.L-1、200μmol.L-1)外源松柏醛(CA)和芥子醛(SA)不但诱导了以CA和SA为底物的基因产物表达量增加,也诱导了苯丙烷代谢途径上游基因产物的表达量增加,且高浓度(200μmol.L-1)诱导的表达量高于低浓度(100μmol.L-1),芥子醛高于松柏醛;对GhEx-pansin1的表达和纤维生长均有抑制作用,且高浓度(200μmol.L-1)抑制作用更加明显,芥子醛抑制作用大于松柏醛。 李晓东 杨洋 李波 杨家平 范玲关键词:基因表达 棉花LIM蛋白基因家族的进化及表达特征分析 被引量:6 2015年 植物LIM蛋白参与细胞骨架的调节及调控次生细胞壁的发育。本研究在雷蒙德氏棉(D5)、亚洲棉(A2)基因组和陆地棉的A、D亚基因组中分别鉴定出14个LIM基因。陆地棉GhLIM基因在2个亚组间的染色体上的分布及基因的复制模式是一致的。推测其复制发生在其祖先同可可(6个LIM)分开之后,A2、D5基因组分化之前;陆地棉LIM除多倍体化使其数目加倍外,没有基因复制与丢失事件发生。蛋白系统进化分析表明,所有被子植物LIM蛋白可以划分为4个亚组(部分具有小亚组):αLIM1(FLIM1、WLIM1、PLIM1)、βLIM1、γLIM2(WLIM2)、δLIM2(PLIM2-I、PLIM2-II)。陆地棉GhLI M的同源复制基因分别在WLIM2和PLIM2-I、PLIM2-II中聚为独立的分支。通过分析深度测序表达谱,发现陆地棉GhLIM有3种表达类型:组成型表达的GhLIM1、2(FLIM),GhLIM3(WLIM1),GhLIM13(βLIM1)和GhLIM4、8、14(WLIM2);雄蕊中优势表达的GhLIM7、9(PLIM2-I),GhLIM5、6、10、11(PLIM2-II);在雄蕊和纤维中优势表达的GhLIM12(PLIM2-I)。实时荧光定量PCR分析表明,GhLIM基因各成员在不同的纤维发育阶段具有不同的表达特征,GhLIM1、13、14在纤维的快速伸长期(5~15 DPA)上调表达,在15 DPA表达量最高;GhLIM2则在纤维次生壁发育期(18~28 DPA)显著上调表达,在28 DPA表达量最高。而GhLIM12在10~23 DPA持续高表达,在28 DPA则没有表达。上述结果说明GhLIM家族基因在纤维发育的不同阶段发挥着不同的功能。 杨洋 李波 胡文冉 张经博 范玲关键词:棉花 LIM 纤维发育 基因复制 基因表达模式 基因工程改良棉花纤维品质研究进展 被引量:4 2012年 棉花作为世界上重要的经济作物,其纤维品质是衡量棉花品质的重要指标。优良的纤维品质是国内外棉花育种的主要目标之一,面临常规育种改良品质的瓶颈,通过转基因技术改良棉花纤维品质是棉花遗传育种致力研究的重要领域。介绍棉纤维发育相关分子机理研究、棉纤维品质改良功能基因的发掘以及利用基因工程技术改良棉花纤维品质的最新进展,并对今后的研究进行展望。 李晓东 李波 范玲关键词:棉花 基因工程 纤维品质 棉花GhCOMT1基因原核表达载体构建及蛋白纯化和Western鉴定 被引量:6 2012年 为进一步研究GhCOMT1基因的功能,构建了原核表达载体pET-28a-GhCOMT1,酶切鉴定并测序后转化到大肠杆菌BL21(DE3)中,在0.2mmol/L IPTG浓度条件下分别进行不同温度梯度诱导,用蛋白标记亲和层析柱(His TrapTM HP)对重组蛋白进行纯化,并用SDS-PAGE和Western blotting方法鉴定表达产物。结果表明:16℃诱导12h、30℃诱导3h和37℃诱导3h后融合蛋白均以包涵体的形式表达,其中16℃诱导12h的蛋白表达量最大;SDS-PAGE检测目的蛋白相对分子量约为39.748kD;Western blotting分析表明,目的蛋白能与His多克隆抗体起特异性反应。 李波 倪志勇 李晓东 范玲关键词:原核表达 蛋白纯化 WESTERN BLOTTING 木质素生物合成中肉桂醇脱氢酶基因(CAD)的研究进展 被引量:15 2014年 木质素(Lignin)是植物苯丙烷代谢途径中的重要产物之一,它为植物细胞壁提供了必要的强度、疏水性以及对外界恶劣环境的抗性。其中肉桂醇脱氢酶(CAD)是木质素合成途径中的一种关键酶,参与S-木质素、G-木质素和H-木质素的合成。本文主要对CAD基因特征、CAD在木质素生物合成中的作用及酶学分析、CAD基因在木质素合成调控中的研究状况进行了综述,并且对CAD基因的研究方法和在实际生产中的应用作出了展望。 曹佳强 李波 杨洋 胡文冉 王玉晶 范玲关键词:肉桂醇脱氢酶 木质素 生物合成 发育中棉纤维硫酸木质素含量的动态变化 被引量:7 2012年 [目的]比较发育中棉纤维硫酸木质素含量的动态变化。[方法]采用硫酸法测定发育中棉纤维木质素含量。[结果]单位棉铃硫酸木质素含量随棉纤维次生壁的增厚呈递增趋势,海岛棉硫酸木质素含量总体低于陆地棉。棉纤维硫酸木质素含量的动态变化呈"S"型曲线,棉纤维硫酸木质素含量变化符合Logistic函数,陆地棉硫酸木质素含量快速累积时期持续的时间长于海岛棉,但单位棉铃硫酸木质素含量最大累积速率出现的时间要晚于海岛棉,而陆地棉单位棉铃硫酸木质素最大累积速率(V_(max))与海岛棉间没有显著差异。[结论]海岛棉与陆地棉相同发育时期内的硫酸木质素含量差异显著。 曹双瑜 胡文冉 范玲关键词:棉纤维