“十一五”国家科技支撑计划(2006BAD01A06-3)
- 作品数:5 被引量:22H指数:3
- 相关作者:李维国郑学项钟淦彬易晓洁冯素萍更多>>
- 相关机构:中国热带农业科学院海南大学自贡市职业培训学院更多>>
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- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 用EST-SSR标记分析巴西橡胶树的遗传多样性被引量:6
- 2009年
- 利用19对EST-SSRs引物对41份巴西橡胶树材料(6个野生材料和35个栽培种)进行遗传多样性分析。结果表明:19对引物均获得了预期的扩增结果,得到92个多态性位点,每对引物检测到的等位基因数为2~7个,平均为4.84个。在相似系数为0.64的水平上,野生材料和栽培种区分开来,在相似系数0.75的水平上,又可将栽培种材料分为四个类群;栽培种和野生材料间的遗传距离在0.11~1.16之间,栽培种间遗传距离较小,野生材料间遗传距离相对较大。在栽培种和野生材料之间,遗传距离最大的是AC/T/15/114与PR261(1.16),最小的是保亭155与热研7-20-59(0.11)。
- 李维国冯素萍郑学项高新生
- 关键词:巴西橡胶树EST-SSRS
- SSR和AFLP分子标记鉴定巴西橡胶树种质资源的比较研究被引量:2
- 2016年
- 选用178份巴西橡胶树种质材料,采用SSR和AFLP分子标记技术对巴西橡胶树种质资源进行鉴定,探讨2种方法的应用效果并加以比较分析。结果显示:利用多态性强的19对SSR引物,检测到92个等位基因;用25对AFLP引物组,检测到702条有多态性的带。SSR位点的平均多态性信息量(PIC)值为0.46,而AFLP多态性带比例是54.88%,AFLP比SSR分子标记具有更高的多态性。结果说明,AFLP标记比SSR标记更适合于巴西橡胶树种质材料的鉴定和保护,同时进一步验证了在作物遗传资源的研究中,采用多种分子标记方法可以获得更加准确的研究数据。
- 钟淦彬李维国位明明郑学项易晓洁
- 关键词:巴西橡胶树SSRAFLP
- 一种快速高效适于橡胶树叶片AFLP分析的DNA提取方法被引量:11
- 2010年
- 以近200个巴西橡胶树种质材料(品种及无性系)幼嫩叶片为材料,采用改良的CTAB法对其基因组总DNA的提取进行了研究。结果表明,该方法提取的DNA溶液无色透明,OD260/OD280的比值均为1.8~2.0,1%琼脂糖凝胶电泳为清晰的一条带,无降解现象,RNA去除干净,能被限制性内切酶完全消化;其AFLP分析(引物EcoRI-TA/MseI-CTT)条带清晰,多态性好,说明此方法提取的巴西橡胶树幼嫩叶片基因组总DNA较适于AFLP分析。
- 钟淦彬李维国郑学项李海林颜园园颜园园易晓洁
- 关键词:巴西橡胶树AFLP分析DNA提取
- 巴西橡胶树SSR反应体系的优化被引量:2
- 2009年
- 以巴西橡胶树无性系针选2号为试验材料,对橡胶树SSR-PCR反应的5个主要因素:TaqDNA聚合酶、Mg2+、引物、DNA模板及dNTPs进行优化试验。筛选出了各反应因素的最佳水平,建立了橡胶树SSR-PCR最佳反应体系(20μl):TaqDNA聚合酶0.8U;Mg2+浓度为1.5mmol/L;引物浓度0.5μmol/L;模板DNA含量50ng;dNTPs浓度0.25mmol/L。并利用此反应体系,用引物1对14个巴西橡胶树品种进行SSR分析,8%的非变性聚丙稀酰胺凝胶电泳检测显示不同品种间DNA谱带多态性丰富。结果证明,此反应体系是稳定可靠的。这为下一步进行的遗传多样性分析、指纹图谱构建等研究奠定基础。
- 郑学项冯素萍李维国
- 关键词:巴西橡胶树简单序列重复
- 188份巴西橡胶树种质材料AFLP指纹图谱分析被引量:6
- 2013年
- 对188份巴西橡胶树种质材料进行AFLP指纹图谱分析,25对多态性引物在100-1 000 bp内共扩增出1 274条带,其中701条带具多态性,多态性达55.02%。每对引物扩增的谱带数在36-66之间,平均为51条。12份橡胶树种质材料具特征带。大多种质的遗传相似系数都在0.84-0.94之间,占94.6%。说明大多数供试材料的遗传差异相对较小,这与橡胶树种质遗传基础狭窄,遗传差异不丰富相吻合。UPGMA聚类结果将供试材料分为3大类,5个类群,每个类群再细分为若干个小组,橡胶树大部分种质按照类群遗传特性聚集在一起,表明AFLP分子标记指纹图谱结果与表型鉴定种质结果一致,分子标记指纹图谱技术可以作为种质鉴定的辅助方法,从微观方面来进行种质的研究保存,为选育种提供好的育种材料。
- 钟淦彬李维国吴春太易晓洁
- 关键词:橡胶树AFLP指纹图谱