国家自然科学基金(31260258)
- 作品数:15 被引量:47H指数:4
- 相关作者:李冠宁雪飞王贤磊高兴旺卢浩更多>>
- 相关机构:新疆大学新疆农业科学院新疆农垦科学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金新疆维吾尔自治区自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 新疆甜瓜品种‘PHHL’白粉病抗病基因初步定位被引量:1
- 2017年
- 以新疆甜瓜白粉病抗病品种‘PHHL’与感病品种‘XM2’为亲本,构建F2代遗传分离群体,研究了抗病品种‘PHHL’中白粉病抗性基因的遗传规律。采用BSA(Bulked Segregation Analysis)法和SSR(Simple Sequence Repeat)分子标记技术,对白粉病抗性基因进行遗传定位,为抗白粉病育种提供种质资源。结果表明:甜瓜‘PHHL’品系对白粉病Podosphaera xanthii的抗性受一个显性基因控制;筛选11个SSR多态性标记,通过连锁分析,将该基因定位于LGVII标记SSR12510与ECM123之间;327、328号标记发生了偏分离现象且差异显著,这2个标记存在偏分离位点。
- 毛云陈刚刚王贤磊宁雪飞李冠
- 关键词:甜瓜抗白粉病基因SSR标记
- 甜瓜果斑病致病基因生物信息学分析被引量:2
- 2017年
- 以已报道的甜瓜果斑病的致病基因和多个与致病性相关的未知蛋白为试材,采用生物信息学方法研究了其致病基因,并且利用生物信息学的工具和软件分析这些未知蛋白,以期为今后从分子水平防治果斑病奠定理论基础。结果表明:通过DNAMAN软件的比对分析,得到3个综合匹配程度较高的未知蛋白,预测这些蛋白是由该病菌Ⅲ型分泌系统的hrp基因簇编码;通过Bioedit和ProtParam软件工具分析获得6个未知蛋白的氨基酸组成、大小、分子质量、理论等电点和疏水性;同时运用DNAMAN软件分析得到相对应的二级结构。该研究结果可为今后深入研究此类基因提供指导作用。
- 毛云苏小龙宁雪飞李冠
- 关键词:甜瓜果斑病致病基因生物信息学
- 甜瓜基因组SSR位点分布规律与多态性初探被引量:1
- 2014年
- 以3个甜瓜品种"BM7"、"伽师瓜"和"Y8"为试材,选取甜瓜基因组的3个DNA区域进行SSR位点的分布规律分析,进一步通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检验甜瓜基因组SSR位点的多态性,以期初步揭示甜瓜基因组中SSR位点的分布规律及其多态性,进而为甜瓜及其它物种开展相关研究提供参考。试验表明:甜瓜基因组中平均每1.9kb就有一个SSR位点,富含A和T的重复基序出现的频率远高于富含C和G的重复基序的频率,没有发现全部由C、G构成的重复基序;二、三、四碱基重复基序的SSR位点占绝大多数(83.3%),五、六碱基重复基序的SSR位点分布较少(16.7%)。二、三、四、五、六核苷酸重复基序SSR位点平均长度依次为21、15、14、16、20bp。设计的82对SSR引物中81对扩增出产物,多态比例最高为48.1%。试验表明,甜瓜基因组中SSR分布具有一定规律,并且可以利用SSR分子标记开展相关研究;试验同时对更好地开展SSR和ISSR分子标记的相关研究奠定了理论基础和依据。
- 高兴旺王贤磊杨雅婷张自强卢浩李冠
- 关键词:甜瓜基因组SSR多态性
- 甜瓜细菌性果斑病抗性基因连锁的SSR分子标记被引量:2
- 2018年
- 为研究甜瓜抗果斑病资源辽宁神帅的抗性基因遗传规律和紧密连锁的简单重复序列(simple sequence repeat,简称SSR)分子标记,以甜瓜抗病品种辽宁神帅和感病品种皮山奎瑞克的杂交F2分离群体作为试验材料,采用集群分离分析法(bulked segregation analysis,简称BSA)和SSR分子标记辅助选择的方法对甜瓜抗果斑病基因初步定位。结果表明,从288对SSR引物组合中筛选出1对与抗性基因连锁的标记BCM184,遗传距离为12.4 c M,最终将抗性基因初步定位到连锁群(linkage group,简称LG)Ⅳ上。
- 俞志杰宁雪飞王贤磊李冠
- 关键词:甜瓜细菌性果斑病抗性基因SSR分子标记抗病育种
- 甜瓜掌状裂叶基因pll的精细定位被引量:6
- 2015年
- 以甜瓜掌状裂叶材料bm7和甜瓜圆叶材料Y8为亲本,构建BC1分离群体作为作图群体,同时利用甜瓜基因组序列,采用SSR分子标记技术,结合混合分离分析法(BSA),将甜瓜裂叶基因pll进一步定位到SSR标记G61和G76之间65kp的区间之内。结果表明:在此区域内,共有6个候选基因,从MELO3C010780到MELO3C010785,其中,MELO3C010784与ANT转录因子相似。根据文献报道,在拟南芥中过表达从椰子中克隆的ANT基因导致叶片出现锯齿形边缘,该表型与甜瓜株系bm7的裂叶形状具有相似性。这些结果表明MELO3C010784为最可能的候选基因。
- 高兴旺王贤磊宁雪飞张自强卢浩李冠
- 关键词:甜瓜SSR叶发育
- 利用紧密连锁抗白粉病基因的SSR标记鉴定甜瓜种质被引量:4
- 2016年
- 在本研究中,利用12对紧密连锁甜瓜抗白粉病基因的SSR分子标记,对18份甜瓜品种进行遗传背景及亲缘关系分析,提出一种快捷简便的鉴别甜瓜抗病品种亲缘关系的方法。结果表明,遗传相似性系数较高且遗传背景相近的抗白粉病甜瓜品种聚为一类,故推测其携带相同抗白粉病基因。本研究使用的12对SSR标记,可用于甜瓜抗白粉病品种鉴定,能够完全区分18个甜瓜品种对白粉病的抗感性,为甜瓜种质资源评价、鉴定及新品种培育工作提供帮助。
- 李思怡卢浩赵莉李冠
- 关键词:甜瓜SSR白粉病亲缘关系
- 一种快速筛选转抗霜霉病基因甜瓜种子的方法研究
- 2014年
- 以用花粉管通道技术转入抗霜霉病基因At2的甜瓜T1代转基因种子为试材,采用组培技术得到膨大的外植体,利用PCR技术对组培得到的外植体进行检测,以期尽快筛选出阳性植株。结果表明:在甜瓜外植体培养过程中,筛选到的种子最佳灭菌条件为72℃、干灭4h,抑菌效果最好的培养基组分是MS无机盐+B5维生素+2mg/L 6-BA+7g/L琼脂+500mg/L头孢噻肟钠+1.1g/L甲基托布津;对1 100个转抗霜霉病基因At2的T1代种子外植体进行PCR检测,阳性率为4.5‰。
- 宁雪飞韩小路王贤磊高兴旺李冠
- 关键词:甜瓜霜霉病
- CRISPR/Cas9技术编辑新疆甜瓜全缘叶基因被引量:4
- 2018年
- 【目的】以新疆甜瓜地方品种老汉瓜为研究材料,对其全缘叶基因进行基因编辑,构建新疆甜瓜CRISPR/Cas9敲除载体,分析甜瓜耐受潮霉素最大浓度,为研究新疆甜瓜裂叶基因的功能奠定基础。【方法】在课题组前期确定甜瓜全缘叶基因PLL的基础上,结合甜瓜基因组数据,设计PLL基因外显子的特异靶位点,构建甜瓜全缘叶基因PLL的CRISPR/Cas9敲除载体,将构建好的载体转化到大肠杆菌中,并测序验证,然后对甜瓜耐受潮霉素浓度进行分析。【结果】针对全缘叶基因PLL外显子选择一个长约20 bp的靶位点,根据靶位点设计sgRNA框,并成功将其构建到CRISPR/Cas9敲除载体上,然后将载体成功转化到大肠杆菌中。分析出甜瓜可耐受潮霉素的最大浓度为10 mg/L。【结论】成功获得甜瓜全缘叶基因PLL的敲除载体,并转化到大肠杆菌中。分析出甜瓜耐受潮霉素的最大浓度,为进一步利用CRISPR/Cas9基因编辑技术研究新疆甜瓜裂叶基因pll的功能奠定基础。
- 王丹王旭辉王旭辉高兴旺
- 关键词:甜瓜PLL潮霉素
- 甜瓜蔗糖转化酶基因的密码子偏好性分析被引量:2
- 2016年
- 以甜瓜蔗糖转化酶基因序列为材料,研究甜瓜蔗糖转化酶基因密码子偏好性,为改良甜瓜风味与品质提供理论依据。运用在线分析软件Codon W对甜瓜蔗糖转化酶的编码序列(Coding sequence,CDS)进行密码子分析,利用Mobyle在线工具分析同义密码子相对使用度(RSCU)、有效密码子数(ENC)、GC及GC1s、GC2s、GC3s含量。甜瓜蔗糖转化酶基因偏好于以A或T结尾的密码子。密码子ATT、GTT和AGA的RSCU值都大于1,属于共同偏好使用的密码子,而密码子GCG、CGG的RSCU值小于1,属于使用频率较低的密码子。发现密码子偏好性与亲缘关系的远近有一定的关系。要实现目的基因在外源表达系统中的成功表达和提高其表达量,可通过增加目的基因剂量,目的基因密码子优化,改善培养条件等方法实现,其中目的基因密码子优化起到了关键作用。
- 赵莉李思怡张立虎李冠
- 关键词:甜瓜蔗糖转化酶密码子偏好性
- 壳聚糖与大蒜素联用抑菌与伽师瓜抗菌贮藏研究被引量:5
- 2018年
- 针对伽师瓜贮藏过程中常致腐烂的4种病原菌:毛霉菌、镰饱菌、链格孢菌、青霉菌,研究了天然抑菌剂壳聚糖和大蒜素对这4种病原菌的抑菌活性,分别测定了壳聚糖和大蒜素对这4种病原菌的抑菌活性,并研究了壳聚糖与大蒜素联用时的抑菌活性与稳定性。将联合抑菌剂用于伽师瓜贮藏,检测联合抑菌剂对伽师瓜腐烂率与保鲜期的影响。结果显示,壳聚糖、大蒜素对毛霉菌、镰饱菌、链格孢菌、青霉菌均有抑菌效果。对这4种病原菌,壳聚糖的最小抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)分别为3. 7、3. 1、4. 2、5. 5 g/L,大蒜素的MIC分别为2. 3、1. 7、2. 2、2. 6 g/L。2种抑菌剂联合使用,抑菌活性较单独使用一种抑菌剂时有显著增强;联合抑菌剂在50℃以下、p H为5~8和紫外光照射时间20 min内能保持良好的抑菌活性,稳定性良好;将伽师瓜用联合抑菌剂处理后贮藏,与未做抑菌处理的对照组相比,腐烂率显著降低,并大幅延长了保鲜期。
- 张强张强王丹
- 关键词:壳聚糖大蒜素