国家林业公益性行业科研专项(201104033)
- 作品数：18 被引量：169H指数：8
- 相关作者：徐刚标刘雄盛肖玉菲梁艳吴雪琴更多>>
- 相关机构：中南林业科技大学广西大学国家林业局更多>>
- 发文基金：国家林业公益性行业科研专项湖南省教育厅重点项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 南岭山地伯乐树天然种群和人工种群遗传多样性比较被引量：11
- 2012年
- 为评价伯乐树迁地保护林的遗传完整性,采用ISSR分子标记技术对南岭山地伯乐树2个人工种群和4个天然种群的遗传多样性进行分析比较。结果显示:7条引物共检测出86个条带,其中62条为多态条带;各种群多态条带百分比(PPB)和Shannon表型多样性指数(HPOP)分别为36.05%～53.49%和0.2040～0.3079;天然种群PPB和HPOP分别为70.93%和0.3882,高于人工种群(PPB=53.49%,HPOP=0.2941)。分子方差分析(AMOVA)表明,天然种群的遗传分化(ΦST=0.3407)明显高于人工种群(ΦST=0.2248)。研究结果认为,伯乐树在物种水平和种群水平都具有较高的遗传多样性,已建立的迁地保护种群不能有效地保护南岭地区天然种群的遗传完整性,建议营建人工迁地保护种群尽可能地从多个不同种群中收集种质材料。
- 梁艳徐刚标张合平吴雪琴申响保王爱云
- 关键词：伯乐树ISSR天然种群人工种群
- 伯乐树种群遗传多样性及遗传结构被引量：14
- 2013年
- 了解种内遗传变异信息是制定种群遗传多样性保护策略的前提。伯乐树(Bretschneidera sinensis)是古老的单科属孑遗植物,被列为国家一级保护植物。为了揭示伯乐树天然种群的遗传多样性和遗传结构,采用7条ISSR引物分析了采自湖南、江西、广东、广西和贵州5个省区15个天然种群的219株个体的样本。结果显示,伯乐树遗传多样性水平较高,物种和种群水平上的多态位点百分率(PPB)分别为74.42%和38.06%,Shannon’s表型多样性指数(I)分别为0.3630和0.2081,Nei’s基因多样性指数(He)分别为0.2397和0.1405。种群间遗传分化显著,基于表型多样性指数和分子方差分析揭示的伯乐树天然种群间遗传分化系数分别为FST=0.4267、GST=0.2973。UPGMA聚类表明,参试的15个天然种群可分为2大组群;Mantel检测发现,种群间遗传距离与其地理距离存在显著相关性(r=0.3096,P=0.008)。基于上述研究结果,我们认为,伯乐树濒危原因不是种群遗传进化潜力小,而是由于生境破坏严重,以及自身繁殖能力低、适应性差、竞争力弱等生物学特征导致的。建议优先保护遗传多样性较为丰富的阳明山、莽山、乳阳、八面山种群,并对种群近交衰退开展相应的监测工作。
- 徐刚标梁艳蒋燚刘雄盛胡尚力肖玉菲郝博搏
- 关键词：SINENSISISSR标记种群遗传结构濒危机制
- 南方红豆杉4个微卫星位点等位基因变异分析被引量：1
- 2016年
- 以南方红豆杉(Taxus chinensis var.mairei)的4个微卫星位点为例,通过等位基因长度和序列变异分析,对各位点等位基因的变异特点、变异来源和进化关系进行研究。结果表明:这4个位点在南方红豆杉种内表现出丰富而复杂的变异特点,既有SSR重复区突变形成的等位基因,也有因侧翼序列插入/缺失(Indel)形成的等位基因,还存在同一长度形态的同形异源等位基因(allelic homoplasy),同时,在1个mt SSR位点中检测到了线粒体基因的异质性(heteroplasmy)。SSR重复序列和侧翼序列突变的共同作用是引起等位基因长度异常的主要原因。等位基因分布及其进化关系研究表明,4个位点的序列突变更符合逐步突变模型(SMM),常见等位基因在进化上具有原始性。
- 谢伟东文亚峰韩文军周宏徐刚标陈建华
- 关键词：南方红豆杉微卫星标记等位基因基因突变
- 极度濒危植物水松大孢子发生、雌配子体发育及胚形成被引量：6
- 2015年
- 【目的】通过对水松生殖发育解剖结构的研究，探讨水松属分类地位，分析水松种子严重败育的原因，进一步为水松繁殖和保护提供丰富、完善的胚胎学研究资料。【方法】2011年9月至2013年9月，采用石蜡切片技术对水松大孢子发生、雌配子体发育和胚形成过程进行系统地显微观察，详细观测水松雌球果发育过程中外部形态变化。【结果】9—11月为水松雌球果芽分化期，12月至翌年5月为大孢子发生和雌配子体发育期，6月为受精期，6月下旬至7月为原胚发育期，8月为早期胚发育期，9月为后期胚发育期。大孢子母细胞减数分裂形成直线型四分体，其中3个大孢子逐渐退化，仅靠近合点端的大孢子发育成为功能大孢子；复合颈卵器由6～17个颈卵器构成，外层有双核套层细胞。套层细胞具有明显的极性分布；复合颈卵器大多数着生于雌配子体顶端，少数侧生；中央细胞不形成卵核和腹沟细胞，直接发育为成熟的卵细胞；精细胞进入颈卵器时，不损伤颈细胞；受精作用主要发生在颈卵器中部，偶尔发生在颈卵器两端。精核与卵核融合过程中，精核的核仁发生解聚和复聚；合子转移到合点端后，进行有丝分裂形成原胚自由核；受精作用属于有丝分裂前配子融合类型。原胚发育属松杉类标准型，为简单多胚类型；原胚发育形成原胚柄，但不形成初生胚柄。受精作用过程中，存在严重授粉不足现象。【结论】基于雌配子游离核、颈卵器和颈细胞数目，颈卵器类型和着生位置，中央细胞及原胚发育等特征综合分析表明，水松属与台湾杉属、水杉属、柳杉属、落羽杉属亲缘关系密切，与杉木属亲缘关系较近。授粉不足可能是水松大量瘪粒种子形成的主要原因。
- 徐刚标刘雄盛梁文斌
- 关键词：大孢子发生配子体发育胚发生水松
- 伯乐树cpDNA-PCR反应体系的优化与引物筛选被引量：7
- 2013年
- 伯乐树为国家一级保护植物,在研究被子植物的系统发育和古地理、古气候等方面具有重要的科学价值。cpDNA-PCR反应是在分子水平上确定伯乐树系统分类的基础。建立了伯乐树cpDNA-PCR反应体系,对影响扩增反应的因素(Mg2+浓度、dNTP浓度、引物浓度以及模板DNA浓度)进行了优化,得到了伯乐树cpDNA-PCR扩增反应的最佳体系,并筛选出了适合伯乐树分子谱系地理研究的非编码区序列和引物。伯乐树cpDNA-PCR最佳反应体系为:30μL反应体系含有10×PCR buffer、2.9 mmol Mg2+、120 mmol dNTP、上下游引物各11μmol、DNA模版30 ng以及3个单位的Taq酶。适合于伯乐树分子谱系地理学研究的3对引物及其退火温度为PipetB1411F-PipetD738R(52℃)、psbA-trnHGUG(59℃)、trnL-trnF(56℃)。
- 胡尚力徐刚标梁艳刘雄盛肖玉菲郝博搏
- 关键词：伯乐树CPDNA引物筛选
- 濒危植物南方红豆杉大孢子发生和雌配子体发育被引量：12
- 2015年
- 南方红豆杉（Taxus chinensis var.mairei）为第三纪孑遗树种,也是我国Ⅰ级保护植物。本文通过对其大孢子发生及雌配子发育过程进行细胞学观察发现,南方红豆杉胚珠多为直立单生,偶见1个苞片内着生2个胚珠;大孢子母细胞减数分裂形成4个大孢子,其中3个退化,仅位于合点端的大孢子发育为功能性大孢子;功能性大孢子经过有丝分裂形成256个游离核;颈卵器单生,2~6个;从传粉到受精约2个月;有16个原胚自由核,原胚为标准型;简单多胚和裂生多胚并存,胚发育不同步。因南方红豆杉胚珠直立单生、游离核数目、传粉到受精间隔期、原胚游离核数目等特征与松科差异较大,而与广义柏科具有许多相似之处,故我们支持将红豆杉科置于广义柏科之下的观点。此外,本研究结果还表明,南方红豆杉大孢子发生与雌配子体发育正常,不是致其濒危的主要原因。
- 徐刚标肖玉菲刘雄盛梁文斌
- 关键词：南方红豆杉大孢子发生雌配子体发育胚胎发育
- 濒危植物观光木遗传多样性及遗传结构分析被引量：23
- 2014年
- 采用筛选的8条ISSR引物对濒危植物观光木13个野生种群的遗传多样性及遗传结构进行分析,结果显示:物种和种群水平上多态性位点百分率分别为79.67%和46.84%,Shannon表型多样性指数分别为0.3880和0.2192,与木兰科其他近缘植物相比,遗传多样性水平较高;分子方差分析表明,观光木野生种群间遗传分化系数为0.3752,种群间存在显著的遗传距离;STRUCTURE分析和UPGMA聚类表明,参试的13个野生种群可分为3大类群;相关性分析表明,种群间遗传距离与其地理距离呈显著正相关。南昆山、笔架山、弄相山种群的遗传多样性最丰富,建议优先加以保护。
- 徐刚标吴雪琴蒋桂雄胡尚力刘雄盛肖玉菲郝博搏
- 关键词：观光木ISSR标记
- 南岭地区观光木自然和人工迁地保护种群的遗传多样性被引量：18
- 2013年
- 迁地保护是珍稀濒危植物保护的重要措施。观光木(Tsoongiodendron odorum)是古老的孑遗树种,被列为国家二级重点保护植物,营建迁地保护林是对其进行保护的重要手段,但已经营建的迁地保护林每个种群目前只保存下来几十株个体。为了评价这些迁地保护林的遗传多样性现状,作者采用ISSR分子标记对南岭地区观光木3个人工迁地保护种群和4个自然种群的遗传多样性进行了比较。结果显示:16条ISSR引物共扩增出362个条带,其中301个为多态条带,多态条带百分比(P)为83.2%,各种群P值为37.9–62.2%,平均为53.1%,表明观光木在物种和种群水平都具有较高的遗传多样性。自然种群总体P值和Shannon信息指数(I)(80.9%,0.3629)均高于人工迁地保护种群(66.6%,0.2990),说明人工迁地保护种群遗传多样性较低。种群结构分析表明3个人工迁地保护种群均有可能来源于源口自然种群。4个自然种群间遗传分化系数(GST)为0.2495,表明自然种群间存在显著遗传隔离,基因流受阻和生态环境差异是造成种群遗传分化的主要原因。在今后的迁地保护工作中,我们建议从不同生态地理区收集种质材料,并在不同生态类型区开展迁地保护工作,同时开展观光木种群生态生殖生物学研究。
- 吴雪琴徐刚标梁艳申响保
- 关键词：ISSR自然种群迁地保护
- 微卫星标记中的无效等位基因被引量：46
- 2013年
- 微卫星标记以其独有的优点广泛应用于遗传学研究,但无效等位基因(nullalleles)的存在与潜在影响是其最大缺陷之一,在研究工作中并未得到足够重视。本文在综述国内外相关文献的基础上,明确了微卫星无效等位基因的概念与特点,对其可能的产生原因、频率估算方法、相关分析软件及其对群体遗传学、亲本分析等研究结果的影响进行述评,以期对无效等位基因有较为全面、深入的了解。微卫星无效等位基因的产生与SSR侧翼序列的变异(点突变、插入或缺失)及引物结合位点有关,其与同工酶标记中的无效等位基因有本质区别,并非基因本身的自然属性。虽然微卫星无效等位基因具有普遍性、复杂性和隐匿性等特点,但完全可以通过Hardy-Weinberg平衡检验、亲子代基因型分析和重新设计引物等方法认识、检测并估算其频率。无效等位基因会对遗传学相关研究结果造成显著影响,如降低群体遗传多样性,加大群体间遗传分化;降低亲本分析排除率,甚至可能造成亲本分析结果的错误与混乱。今后研究工作中,我们应对无效等位基因予以足够重视并谨慎对待,从标记位点选择、无效等位基因数据调整及重新设计引物分析等多个方面尽可能减少和避免其影响,以获得最真实的分析结果。
- 文亚峰Kentaro Uchiyama韩文军Saneyoshi Ueno谢伟东徐刚标Yoshihiko Tsumura
- 关键词：微卫星标记等位基因频率
- 观光木SSR-PCR反应体系优化及引物筛选被引量：2
- 2015年
- 在单因素试验基础上,采用正交试验优化影响观光木SSR-PCR扩增的5种主要影响因素,获得最佳反应体系(10μL)为:Mg2+1.0 mmol,d NTP 0.20 mmol,引物0.25μmol,Taq DNA聚合酶0.75 U,模板DNA 60ng。利用优化SSR-PCR扩增体系,从12对引物中筛选出5对多态性高、重复性好的引物。这为进一步开展观光木种群遗传多样性研究奠定了前期实验基础。
- 黄芳芳何长青闫丽君汪灵丹徐刚标
- 关键词：观光木SSR引物筛选
