王敏
- 作品数:4 被引量:11H指数:2
- 供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 利用基因芯片技术分析空肠弯曲菌的遗传特征被引量:1
- 2016年
- 目的为分析我国弯曲菌遗传特征,本研究根据已发表多株弯曲菌的全基因组测序特征及比对结果自行设计基因芯片,利用芯片对我国不同宿主来源菌株进行遗传特异性分析。方法根据前期基因组水平比对分析的结果,利用Combimatrix tiling Custom ArrayTM90K芯片,设计DNA芯片。芯片包含已测序菌株ICDCCJ07001、269.97、NCTC11168、81-176、81-116和RM1221共3384个CDS的探针序列,以及空肠弯曲菌耐药及致病性相关2个质粒共80个CDS的探针序列,与脂寡糖的合成相关基因簇16种共219个CDS的探针序列、荚膜多糖合成相关基因簇7种共160个CDS的所有序列。对我国不同宿主来源27株分离菌株提取DNA,利用芯片进行杂交,获得杂交信息并分析不同菌株CDS分布特征分析及聚类特点。结果中国菌株的主要变异区域主要存在于与脂寡糖、荚膜多糖合成相关的基因簇、鞭毛修饰相关的基因簇、DNA限制/修饰相关的基因簇以及空肠弯曲菌Mu样噬菌体基因簇。基因组水平不同来源菌株CDS分布的聚类结果没有发现显著的宿主归因特点,但GBS相关菌株脂寡糖合成相关基因组成具有共性特征。结论通过验证以及与过去研究的比较,本次研究中的基因芯片技术结果准确可信,本研究所用基因芯片在分析空肠弯曲菌基因多态性方面具有很好的优势,可用于弯曲菌遗传特征和重要毒力因子的分析和检测。
- 梁昊刘红莹尤元海顾一心张艾煜王敏何利华孟凡亮张建中张茂俊
- 关键词:空肠弯曲菌基因芯片
- 志贺氏菌、沙门氏菌、肠出血性大肠杆菌O157∶H7缺失基因分析
- 2004年
- 王敏张晶波徐建国
- 关键词:志贺氏菌沙门氏菌肠出血大肠杆菌
- 志贺菌属编码赖氨酸的基因簇缺失情况分析被引量:3
- 2003年
- 目的 探讨编码赖氨酸利用的cadABC基因簇的缺失在志贺菌中的普遍性。方法 根据大肠杆菌K 12MG16 5 5菌株的cadABC基因簇序列设计引物 ,使用PCR和核酸杂交试验检测。结果在志贺菌的 4个群 4 2个血清型 4 3株菌中 ,均发生了cadABC基因簇的缺失。其中 2 9(6 7.4 % )株菌发生了cadABC基因簇的全部缺失 ,主要表现在A群和C群。A群的 12个血清型中有 10个发生了完全缺失 ,C群的 18个血清型中有 16个发生了完全缺失。其余 13个血清型中的 14株菌发生了部分缺失或重组。不完全缺失主要发生在B群 ,B群的 11个血清型中的 8个表现为部分缺失。D群的 2个菌株和肠侵袭性大肠杆菌的 2个菌株全部表现出部分缺失 ,但缺失的程度不同。结论 在志贺菌属的 4个群 4 2个血清型中 ,全部发生了cadABC基因簇的缺失 ,表现为完全缺失和部分缺失。结果提示 ,志贺菌的进化可能和cadABC基因簇的缺失有关。
- 张晶波李新军王敏徐建国
- 关键词:志贺菌属赖氨酸
- 北京市零售鸡肉标本中弓形杆菌污染初步分析被引量:7
- 2016年
- 目的了解北京市零售鸡肉标本中弓形杆菌的污染情况。方法随机购买北京地区6个农贸市场零售鸡肉样本60份,应用驱动增强双孔滤膜法对鸡肉样品进行弓形杆菌的分离培养,利用多重PCR及16S rRNA、rpo B基因测序的方法进行菌株及菌种鉴定。结果 60份零售鸡肉样本弓形杆菌的检出率为73.33%(44/60)。44份阳性标本中,共获得125株弓形杆菌分离株,其中以嗜低温弓形杆菌为主(91.20%),其次是布氏弓形杆菌(8.00%),斯氏弓形杆菌(0.80%)。两种及以上菌种混合污染率为15.00%(9/60)。结论驱动增强双孔滤膜法可有效分离肉类样本中弓形杆菌。本地区零售鸡肉样本中弓形杆菌污染严重,鸡肉中嗜低温弓形杆菌的污染高于布氏弓形杆菌。
- 王敏顾一心梁昊付燕燕何利华张建中张茂俊
- 关键词:鸡肉