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黄家敏

作品数：4 被引量：2H指数：1
供职机构：中山大学附属第三医院更多>>
发文基金：国家自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

合作作者

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 4篇医药卫生

主题

  • 3篇生物信息
  • 3篇生物信息学
  • 2篇申克孢子丝菌
  • 2篇念珠
  • 2篇念珠菌
  • 2篇孢子丝菌
  • 2篇白念珠菌
  • 1篇蛋白
  • 1篇刀豆
  • 1篇刀豆蛋白A
  • 1篇荧光
  • 1篇粘附
  • 1篇粘附能力
  • 1篇生长活性
  • 1篇生物信息分析
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇磷酸合成酶
  • 1篇活性
  • 1篇基因
  • 1篇海藻糖

机构

  • 4篇中山大学附属...
  • 4篇中山大学孙逸...
  • 3篇广东省妇幼保...
  • 1篇中山大学
  • 1篇深圳市宝安区...

作者

  • 4篇黄怀球
  • 4篇张静
  • 4篇黄家敏
  • 3篇李美荣
  • 3篇黄丽林
  • 3篇孙瑶
  • 3篇高文超
  • 2篇张云青
  • 2篇尹颂超
  • 1篇旷翠娥
  • 1篇李玉哲
  • 1篇胡南
  • 1篇陆春

传媒

  • 3篇皮肤性病诊疗...
  • 1篇中山大学学报...

年份

  • 1篇2019
  • 1篇2018
  • 2篇2017
共 4 条 记 录，以下是 1-4
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排序方式：
白念珠菌Mdr1基因生物信息学分析
2017年
目的:探讨白念珠菌多重耐药基因(Mdr1)DNA、mRNA、蛋白的潜在生物学性质。方法:采用生物信息学方法对白念珠菌Mdr1基因DNA、mRNA、蛋白序列进行分析。结果:Mdr1 DNA中无内含子,Mdr1 mRNA中含有多个调控元件和腺苷酸化位点、AU富集区,对二级结构分析显示,Mdr1 mRNA全长序列可形成棒状结构。蛋白质的理化性质分析显示MDR1蛋白稳定系数为37.14,提示MDR1蛋白较为稳定。Target P 1.1和Signal P 4.1预测结果显示MDR1蛋白不含有线粒体定位序列和分泌信号肽。SWISS-MODEL 3D建模,MDR1蛋白质的3D结构类似于通道管状形态。Motif Scan分析结果显示,MDR1蛋白第116-557个氨基酸构成主要协同转运蛋白超家族,TMHMM预测在此范围内含有12个跨膜区间,为跨膜蛋白。结论:Mdr1基因的表达可能受其它基因的调控,MDR1蛋白为主要协同转运蛋白超家族成员,其功能域或为潜在的药物靶点。
何泰龙高文超孙瑶黄家敏黄丽林张静张云青李美荣尹颂超黄怀球
关键词：白念珠菌MDR1基因生物信息学
申克孢子丝菌chs1基因生物信息分析被引量：1
2017年
目的:对申克孢子丝菌几丁质合成酶基因(chs1)及其编码蛋白的结构和特性进行分析和预测。方法:利用NCBI网站、Ex PASy和CBS等工具预测申克孢子丝菌chs1基因及编码蛋白的结构和功能。结果:chs1 mRNA全长2 745 bp,编码914个氨基酸。BLAST分析显示,申克孢子丝菌与巴西孢子丝菌、蓝菌属真菌、足马杜拉分枝菌等真菌chs氨基酸序列一致性达到99%,且有保守域。预测chs1蛋白相对分子量为102 714.7,理论等电点为6.71。预测chs1编码蛋白ɑ螺旋、β折叠、β转角、无规则卷的比例分别是38.40%、17.94%、10.39%、33.26%。chs1蛋白是一种疏水蛋白,包含9个跨膜区,未发现信号肽。结论:成功预测了chs1基因及编码蛋白质的生化性质及结构特征,为下一步对其进行克隆、表达和敲除奠定基础。
孙瑶高文超何泰龙黄家敏黄丽林张静李美荣张云青尹颂超黄怀球
关键词：申克孢子丝菌生物信息学
钙荧光白和荧光刀豆蛋白A标记的白念珠菌生长活性和粘附能力
2019年
【目的】探讨钙荧光白和荧光刀豆蛋白A标记白念珠菌后对其生长活性和粘附能力的影响,以明确在念珠菌和宿主细胞相互作用研究中钙荧光白和荧光刀豆蛋白A是否适用于活念珠菌的标记。【方法】分别使用钙荧光白和结合Alexa fluor 488的刀豆蛋白A标记20株白念珠菌,将标记荧光的白念珠菌酵母细胞接种至酵母提取物蛋白胨葡萄糖培养基,通过菌落计数法检测荧光标记的白念珠菌的生长活性。将荧光标记的白念珠菌酵母细胞分别与巨噬细胞和肠上皮细胞共培养,使用荧光显微镜检测白念珠菌的粘附能力。【结果】钙荧光白组和荧光刀豆蛋白A组白念珠菌的菌落数目和未标记的对照组相比,均无统计学差异(P=0.942,P=0.885);钙荧光白组和荧光刀豆蛋白A组的白念珠菌在巨噬细胞上的粘附数目均比对照组少(P=0.000,P=0.000);钙荧光白组和荧光刀豆蛋白A组的白念珠菌在肠上皮细胞上的粘附数目也均比对照组组少(P=0.000,P=0.000)。对照组组白念珠菌与细胞共培养半小时后可长出菌丝,而钙荧光白标记的白念珠菌与细胞共培养半小时后未长出菌丝。【结论】钙荧光白和荧光刀豆蛋白A标记白念珠菌后不影响其生长活性,可显著降低其粘附巨噬细胞和肠上皮细胞的能力。钙荧光白染色影响白念珠菌的出芽过程。钙荧光白和荧光刀豆蛋白A不适用活念珠菌的标记。
张静吴晓雁黄家敏陆春黄怀球
关键词：白念珠菌刀豆蛋白A
申克孢子丝菌TPS基因生物信息学分析被引量：1
2018年
目的:分析和预测申克孢子丝菌海藻糖磷酸合成酶(TPS)基因及其编码蛋白的生物信息学特征及功能。方法:利用生物信息学软件和网站分析预测申克孢子丝菌TPS基因及其编码蛋白的结构和功能特征。结果:申克孢子丝菌TPS基因全长为2 864 bp,编码905个氨基酸。Target P和MotifScan预测该蛋白定位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点,其中磷酸化位点尤为丰富,包含cAMP依赖性磷酸激酶、蛋白激酶C(PKC)和酪氨酸激酶(CK2)磷酸化位点。TPS蛋白是亲水性蛋白,无跨膜结构,未发现信号肽。结论:预测申克孢子丝菌TPS基因编码蛋白位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点的结构功能特点,可行相应小分子抑制剂筛选以开发新型抗真菌药物。
黄家敏李玉哲高文超吴晓雁孙瑶黄丽林张静李美荣胡南旷翠娥刘佳庆黄怀球
关键词：申克孢子丝菌生物信息学
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