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张明清: 作品数：15 被引量：42H指数：4; 供职机构：广州大学生命科学学院更多>>; 发文基金：广东省科技计划工业攻关项目国家公益性行业科研专项国家级大学生创新创业训练计划更多>>; 相关领域：农业科学生物学医药卫生化学工程更多>>

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光倒刺鲃mc5r基因的克隆及对饥饿的响应被引量：3: 2019年; 通过同源克隆和染色体步移对光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)黑素皮质素受体-5 (melanocortin receptor-5,mc5r)基因进行了克隆,应用生物信息学方法对mc5r 基因序列和推测的氨基酸序列进行分析,采用荧光定量PCR 技术研究其mRNA 的组织分布、日周期变化以及饥饿再投喂的表达情况。结果表明mc5r 基因长度为1 947 bp,含有1 个987 bp 的外显子,编码329 个氨基酸。通过序列同源比对及系统发育进化分析,光倒刺鲃mc5r 的氨基酸序列与鲤(Cyprinus carpio)、犀角金线鲅(Sinocyclocheilus rhinocerous)的mc5r 同源性达到98%。光倒刺鲃mc5r 在大脑中显著表达,在间脑、心脏的表达量次之,在中脑、小脑表达量较少,在肾脏、胃、肌肉、脾、肠、性腺、肝脏、延脑、眼中微量表达。光倒刺鲃mc5r mRNA 的日周期表达量随昼夜节律而变化,饥饿再投喂实验发现饥饿再投喂组鱼其脑中表达量会显著升高,随后会有下降趋势,表明mc5r 可能与光倒刺鲃的摄食调控有关。; 周惠强陈凯棱舒琥杨扬钟东明张明清; 关键词：光倒刺鲃克隆

大刺鳅促黄体生成素基因克隆及其组织表达分析被引量：2: 2020年; 【目的】克隆大刺鳅(Mastacembelus armatus)促黄体生成素(LH)基因及明确其表达规律,为进一步阐明LH基因在大刺鳅性腺发育过程中的生理功能及揭示大刺鳅的生殖调控机理提供参考依据。【方法】采用RACE克隆大刺鳅LH基因cDNA全长序列,从GenBank中选择硬骨鱼类、两栖动物、鸟类和哺乳动物等物种的LH氨基酸序列,通过ClustalX 2.1进行氨基酸序列比对,以MEGA 6.0中的邻接法(NJ)构建系统发育进化树,并应用实时荧光定量PCR检测分析大刺鳅LH基因在不同组织及不同性腺发育期的表达情况。【结果】大刺鳅LH基因c DNA序列全长799 bp,包括224 bp的5’非编码区(5’-UTR)、131 bp的3’非编码区(3’-UTR)和444 bp的开放阅读框(ORF),共编码147个氨基酸残基,第1~22位氨基酸残基组成其信号肽区域。大刺鳅LH氨基酸序列C-末端区域高度保守,但N-末端区域与其他硬骨鱼类、两栖动物、鸟类和哺乳动物存在明显差异。大刺鳅LH氨基酸序列与其他鱼类的LH氨基酸序列同源性较高,其中与黄鳝(Monopterus albus)的亲缘关系最近。大刺鳅LH基因在其脑组织中的相对表达量最高,显著高于在其他组织中的相对表达量(P<0.05);在卵巢、心脏、肝脏和精巢中的相对表达量次之;大刺鳅LH基因在不同发育期卵巢和精巢中的表达变化趋势一致,从Ⅱ期开始其相对表达量随之增加,至V期时达峰值。【结论】大刺鳅LH氨基酸序列具有高度保守区域,其基因在各组织中广泛表达,尤其在脑组织和性腺中具有较高表达量,提示LH的靶基因可能在脑-垂体-性腺轴上,参与大刺鳅的性腺发育调控,主要促进卵母细胞和精子成熟并刺激排卵或排精。; 黄小琪钟东明何佩莹张明清周惠强舒琥; 关键词：性腺发育基因克隆

华南地区7个大刺鳅野生群体的形态差异分析被引量：20: 2017年; 为了解华南地区大刺鳅资源现状,通过测量大刺鳅7个野生群体171尾的可量性状及框架结构,对其体重与形态性状关系、群体形态差异进行分析.通径分析发现,全长对体重的直接作用最大,体宽次之,头高对体重的直接作用为负值.主成分分析显示,大刺鳅群体的形态性状差异体现在躯干部和头部,这些性状与摄食密切相关.聚类分析发现7个大刺鳅群体聚为3支,龙岩、乐昌、五华、百色、恩平群体聚为1支,红河为1支,白沙单独为1支.将这3支按水系划分成珠江-韩江水系、红河水系、南渡江水系,做判别分析,判别率都达95%以上.主成分分析、聚类分析和判别分析结果表明,华南及邻近地区的大刺鳅在形态上已经有明显的分化.; 舒琥江小璐杨华强林婷婷周惠强张明清查广才; 关键词：通径分析主成分分析聚类分析

大刺鳅EPICs标记的开发及应用: 大刺鳅广泛的分布在我国华南地区,群体谱系地理学分析大部分选用的是线粒体标记,缺少核基因标记。本研究用表达序列标签(EST)与基因组比对的方法,共筛选了52对EPICs的引物,稳定扩增的有26对,可用于系谱地理学研究的有7...; 江小璐舒琥林婷婷周惠强钟东明张明清; 关键词：谱系地理学; 文献传递

丁酸梭菌对集装箱养殖的吉富罗非鱼生长、免疫及肠道菌群的影响: 本研究以吉富罗非鱼为研究对象，旨在探究丁酸梭菌对集装箱养殖的吉富罗非鱼肠道菌群、生长性能及免疫参数的影响.实验选用规格一致，初始体质量为(24.02±2.04)g的罗非鱼，随机分成4个组，每组1 200尾，分别饲喂添加0...; 张明清钟东明赖星星舒琥; 关键词：罗非鱼肠道菌群免疫

陆基多营养级复合水产养殖模式研究进展: 在过去的几十年,陆基海水养殖业取得了稳步的发展,为人们提供了大量的海产品。但是在陆基海水养殖业发展的同时,其也对海岸环境产生了显著的影响,成为一种潜在的海岸污染源。为了达到生态养殖的目的,陆基多营养级复合水产养殖在可持续...; 张明清钟东明周惠强舒琥; 关键词：生物修复水质净化可持续发展; 文献传递

大刺鳅mstn基因克隆及表达分析被引量：6: 2020年; 【目的】了解大刺鳅(Mastacembelus armatus)肌肉生长抑制素(myostatin)基因mstn的序列及其在生长发育中的调控功能。【方法】利用RACE方法克隆大刺鳅mstn全长cDNA序列,采用荧光定量PCR分析其在不同组织和胚胎发育阶段的表达情况。【结果与结论】大刺鳅mstn cDNA序列全长2690 bp,包含200 bp 5′非编码区、1359 bp 3′非编码区和1131 bp开放阅读框,编码376个氨基酸。前22个氨基酸残基为信号肽,第37~254位氨基酸残基为TGF-β前肽域,第282~376位是TGF-β结构域,具蛋白酶水解位点RARR和C端生物活性区的9个保守半胱氨酸残基。系统发育分析表明,大刺鳅MSTN氨基酸序列与合鳃目、鲈形目鱼类同源性较高,与哺乳动物、鸟类、爬行类、两栖类同源性较低。实时定量PCR分析表明,大刺鳅mstn基因在各组织中均有表达,肌肉中表达量最高,眼、脑次之,鳃表达量最低;大刺鳅胚胎发育的各阶段mstn基因均有表达,囊胚期表达量最高,其次为多细胞期,出膜期表达量最低。; 钟东明赖星星张明清舒琥; 关键词：MSTN 基因克隆

饲料中添加酪酸菌对宝石鲈生长性能的影响被引量：4: 2019年; 为了研究在饲料中添加不同浓度的酪酸菌(Clostridium butyricum)对集装箱循环水养殖的宝石鲈(Scorturm barcoo)生长性能、肠道消化酶活性及肝脏抗氧化性的影响,分别向基础饲料里添加浓度为0.1%,0.5%和1%酪酸菌饲喂宝石鲈。结果显示:添加浓度0.5%酪酸菌试验组终末体质量显著高于对照组(P<0.05),肠道胰蛋白酶,淀粉酶活性最高,显著高于对照组(P<0.05),且该试验组宝石鲈总抗氧化能力(T-AOC)、超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(CAT)等抗氧化指标显著高于对照组(P<0.05),丙二醛(MDA)含量显著低于对照组(P<0.05)。标明酪酸菌最适宜添加浓度为0.5%。; 舒琥郭静文詹博锐张明清罗智展候丽萍舒锐; 关键词：宝石鲈消化酶活性

酪酸菌对集装箱养殖的宝石鲈生长性能及肠道菌群的影响被引量：3: 2019年; 实验旨在研究添加酪酸菌(Clostridium butyricum)对宝石鲈(Scortum barcoo)生长发育及肠道菌群的影响。实验选用规格一致,初始体质量为(24.02±2.04)g的宝石鲈,随机分成4个组,每组1 200尾,分别饲喂添加0(Control组)和0.1%(Diet 1组)、0.5%(Diet 2组)、1.0%(Diet 3组)酪酸菌的日粮,饲养周期为60 d。实验结果表明:①与Control组对比,Diet 2组宝石鲈的终体质量、相对增长率显著提高(P<0.05)。②随着养殖时间的增加,宝石鲈肠道菌群的物种组成更加多样化。③Diet组中以鲸杆菌属(Cetobacterium)、芽孢杆菌属(Bacillus)、大洋芽孢杆菌属(Oceanobacillus)为主的益生菌群的比例提高,以邻单胞菌属(Plesiomonas)、拟杆菌属(Bacteroides)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)为主的致病菌的含量降低。; 张明清周惠强舒琥郭静文钟东明侯丽萍舒锐; 关键词：宝石鲈肠道菌群致病菌

大刺鳅生长激素基因克隆与表达分析被引量：4: 2020年; 【目的】揭示生长激素(GH)是否能以旁分泌或自分泌方式对大刺鳅(Mastacembelus armatus)的生长和发育起作用,为其生长调节研究积累基础数据。【方法】采用RACE克隆大刺鳅GH基因cDNA序列,并通过实时荧光定量PCR对大刺鳅不同组织及胚胎不同发育时期GH基因的表达情况进行分析。【结果】大刺鳅GH基因c DNA序列全长815 bp,其中,5’端非编码区长33 bp,3’端非编码区长167 bp,开放阅读框(ORF)615 bp,共编码204个氨基酸,GenBank登录号MH885947;大刺鳅GH氨基酸序列的前17个氨基酸残基组成信号肽,也存在4个保守的半胱氨酸残基(69Cys、177Cys、194Cys和202Cys)。大刺鳅GH蛋白分子量为23007.33 Da,理论等电点(pI)为6.90,其氨基酸组成中以亮氨酸(Leu)的含量最高(15.7%),丝氨酸(Ser)次之(14.2%),色氨酸(Trp)含量最低(0.5%)。大刺鳅GH氨基酸序列与斑鳜(Siniperca scherzeri)、花鲈(Lateolabrax maculatus)和黄鳝(Monopterus albus)的同源性较高,对应的同源性分别为95.59%、95.07%和92.16%;在基于GH氨基酸序列同源性构建的系统发育进化树中,大刺鳅与同属于合鳃目的黄鳝聚为一支,亲缘关系最近。GH基因在大刺鳅不同组织中均有表达,其中以脑组织中的相对表达量最高,而肠道中的相对表达量最低;GH基因在大刺鳅胚胎各发育时期也均有表达,其中以囊胚期的相对表达量最高,而出膜期的相对表达量最低。【结论】大刺鳅GH基因具有高度的保守区域,在各组织中广泛表达,尤其在脑组织中高表达,说明GH是以自分泌或旁分泌方式对大刺鳅生长发挥重要作用,且在胚胎发育过程中对细胞分化具有促进作用。; 钟东明黄小琪何佩莹周惠强张明清舒琥; 关键词：基因克隆系统发育进化树

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