曹玉婷
- 作品数：5 被引量：15H指数：3
- 供职机构：南京林业大学更多>>
- 发文基金：江苏高校优势学科建设工程资助项目国家林业公益性行业科研专项江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 柳杉维管形成层及木质部区转录组序列及基因表达分析被引量：3
- 2019年
- 柳杉是中国南方重要的针叶用材树种,具有树形高大,纹理直等特点,已广泛用于板材和建筑生产中,研究柳杉木材形成过程中维管形成层及木质部区转录组特征,为木材形成主要过程的分子机理,木材形成有关基因调控,培育优良材质的林木提供理论参考。本研究以柳杉形成层组织为材料,通过Illumina Hiseq测序平台对4个不同发育阶段的柳杉维管形成层进行转录组测序;对Unigene进行了蛋白功能注释、分类及KEGG代谢通路分析等。测序数据参照无参转录组测序流程进行分析,一共产生105.9 Gb的数据,过滤后Clean reads均达到90%以上。Clean reads经Trinity软件进行组装,一共产生64 969个Unigene,对Unigene进行拼接,拼接后的Contigs序列有29 381条、Singletons有35 588条,总长度为83 003 836 bp。将Unigen与七大功能数据库(NR, NT, GO, COG, KEGG, Swissprot, Interpro)进行比对,共有42 836个Unigene得到注释,占总Unigene的66.05%。GO注释共有89 644个转录本得到注释。对GO注释转录本进行分类,其中有38 432个转录本(42.87%)注释为生物过程,有32 749个转录本(36.53%)注释为细胞组分,有18 463个转录本(20.6%)注释为分子功能。KEGG注释有31 580个Unigene得到注释。分为6大类为:细胞代谢过程、环境信息处理、遗传信息处理、人类疾病、代谢作用、生物体系统。其中代谢作用涉及的Unigene最多达18 580个,占KEGG总注释Unigene的58.83%。另有37 762个Unigene得到COG注释,被分为25类,其中注释数目最多的类型是仅预测一般功能的Unigene,占总数的16.9%;其次是转录,比例为8.8%;再次是复制、重组及修复,占总数的7.8%。本研究最后分析了可能参与木材形成重要功能基因,为探讨木材发育的分子机制及进行重要功能基因的挖掘提供了提供了依据。
- 曹玉婷莫家兴莫家兴施季森欧阳磊
- 关键词：柳杉维管形成层转录组测序
- 一种柳杉扦插繁殖方法
- 本发明公开了一种柳杉扦插繁殖方法，包括：1)插穗预处理；2)采用外源激素NAA50～150ppm+IBA100～300ppm，浸泡插穗0.5～1.5h；3)扦插；4)扦插后管理。本发明的柳杉扦插繁殖方法，试验证实，采用外...
- 徐进戴丽华曹玉婷施季森
- 文献传递
- 柳杉全同胞家系生长和材性的遗传变异及优良家系选择被引量：9
- 2019年
- 研究林木家系间生长性状和材性性状遗传变异情况,并从中挑选优良家系,为林木生长及材性改良提供科学依据。以福建霞浦国有林场40个柳杉全同胞家系子代为研究对象,分析其生长性状(树高、胸径和材积)和材性性状(比重、心材率、偏心率、树皮率、管胞长度、管胞宽度和管胞长宽比)遗传变异特点。结果表明:1)柳杉不同家系间树高、胸径、树皮率、管胞长度、管胞宽度和管胞长宽比均达到了差异极显著水平,比重、材积性状达到显著差异水平,而木材心材率和偏心率则差异不显著;2)比重、材积、偏心率、树皮率、树高、胸径、管胞长度、管胞宽度、管胞长宽比均受到中等及中等以上遗传力控制;3)柳杉树高与胸径、材积存在极显著正相关;胸径与材积、管胞长度、管胞长宽比存在显著水平正相关,材积与管胞长度、管胞长宽比也存在极显著正相关;4)以胸径和比重作为简单指数选择法的选择性状,计算出各家系选择指数值I值,按10%入选率,选出I值最高的4个家系,分别是34#(7-3)、3#(6-2)、2#(7-5)和20#(20-10)。这些结论可为柳杉生长及材性改良提供科学参考。
- 莫家兴莫家兴翁怀峰曹玉婷戴丽华曹玉婷欧阳磊徐进
- 关键词：柳杉家系材性
- 一种柳杉扦插繁殖方法
- 本发明公开了一种柳杉扦插繁殖方法，包括：1)插穗预处理；2)采用外源激素NAA50～150ppm+IBA100～300ppm，浸泡插穗0.5～1.5h；3)扦插；4)扦插后管理。本发明的柳杉扦插繁殖方法，试验证实，采用外...
- 徐进戴丽华曹玉婷朱千雨施季森
- 文献传递
- 柳杉无性系指纹图谱的构建及遗传多样性分析被引量：5
- 2017年
- 【目的】为了构建柳杉无性系的DNA指纹图谱,准确区分柳杉无性系。【方法】利用SSR标记分析了柳杉89个无性系的遗传多样性和指纹图谱。【结果】11对引物共检测出53个等位点,平均每个SSR位点有5个,变化范围为3~6个;有效等位基因数(Ne)变化范围为1.887 0~4.295 6,平均为3.041 1;Shannon信息指数(I)变化范围为0.774 9~1.556 3,平均为1.208 1。表明SSR标记具有较高的多态性。根据SSR标记特点及引物的顺序,将SSR引物扩增统计的"0"、"1"转换成基因型,通过不同基因型组合,构建了柳杉89个无性系的DNA分子指纹图谱,使每个无性系都获得了1个22位数的指纹图谱号码,同时基于个体间的遗传距离将柳杉89个无性系分为5类。【结论】SSR标记适用于柳杉无性系遗传多样性分析及鉴定,柳杉的遗传多态性处于中等偏高水平。
- 骆鹏曹玉婷莫家兴翁怀峰施季森徐进
- 关键词：SSR标记指纹图谱
