张智
- 作品数：4 被引量：13H指数：2
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院基础医学院基础医学研究所更多>>
- 发文基金：中华医学基金会基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 生物医学异构数据库集成的研究进展被引量：5
- 2010年
- 随着生物医学的快速发展,不断地涌现出许多生物医学数据库。将这些相互独立的数据库有机地组织在一起,对于提高一个学科或领域的整体知识水平,以及对该学科或领域进行更深入、更全面的理解是十分重要的。数据集成可以实现数据更广泛的共享和更有效的利用,已经成为生物信息学的核心研究内容之一。介绍生物医学异构数据库集成的方法,综述生物医学异构数据库集成领域内最新的研究进展,并且讨论和总结各种方法的特点及使用条件。
- 张智张正国
- 关键词：异构数据库数据集成联邦数据库中间件
- 基于元数据的异构蛋白质-蛋白质相互作用数据库整合被引量：1
- 2010年
- 研究蛋白质-蛋白质相互作用是理解生命活动的基础。在蛋白质-蛋白质相互作用的研究过程中,产生了大量来源于实验和预测的数据。这些数据存储于彼此异构的数据库中。对上述异构数据库进行数据整合是实现共享和最大限度利用已有蛋白质-蛋白质相互作用数据必须解决的关键问题。据此问题提出了基于元数据理论和查询转换方法的异构数据库整合方案,并构建了一个基于网络的蛋白质-蛋白质相互作用相关异构数据库的整合平台,成功实现了对9个蛋白质-蛋白质相互作用数据库的整合。
- 张智张正国
- 关键词：蛋白质-蛋白质相互作用异构数据库数据整合元数据
- 基于Web Service的生物学实体映射数据库被引量：1
- 2010年
- 生物学实体映射就是要实现对基因、蛋白质、小分子物质、化合物和药物等实体的不同标识符和名称之间的相互转换。生物学实体映射可以帮助生物医学研究者将实验结果关联到海量的在线生物医学数据资源,并为生物医学文本挖掘和信息检索的研究者在命名实体识别和查询关键词扩展方面提供技术支持。构建一个生物学实体映射数据库,其中存储了大量的生物学实体映射信息;还构建一个基于Web Service的生物学实体映射网络应用系统,为用户同时提供通过浏览器和通过Web Service的两种方式访问生物学实体映射数据库。
- 张智张正国
- 关键词：映射网络服务数据库
- 蛋白质相互作用的文本挖掘研究进展被引量：7
- 2008年
- 生物体的生理功能主要由细胞中的蛋白质调控,因此研究蛋白质间的相互作用成为理解生命活动的基础。使用文本挖掘方法研究蛋白质相互作用可以充分利用现有的大量文献揭示出与蛋白质相关的潜在知识,构造蛋白质相互作用网络。着重从相关的语料集和工具、所涉及的技术和方法等方面,对蛋白质相互作用的文本挖掘进行综述,并对研究前景进行展望。
- 张智张正国
- 关键词：文本挖掘关系抽取蛋白质相互作用模式识别
