张红梅
- 作品数:6 被引量:33H指数:4
- 供职机构:郑州大学医药科学研究院更多>>
- 发文基金:河南省教育厅自然科学基金河南省科技攻关计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 蒲公英ISSR-PCR反应体系及扩增程序的建立与优化被引量:9
- 2012年
- 目的:优化蒲公英ISSR-PCR反应体系及扩增程序;筛选适合的引物,并确定最佳退火温度。方法:采用CTAB法提取蒲公英叶片的DNA,利用正交试验设计,从Taq酶MIX、模板DNA、引物3种因素2个水平,对蒲公英ISSR-PCR反应体系进行考察;采用单因素实验对其扩增程序进行优化。结果:确立了适合于蒲公英的最佳ISSR-PCR反应方法,即在25μL反应体系中,内含Taq酶MIX 15μL(1.25 U Taq DNA聚合酶,1.8 mmol.L-1 Mg2+,dNTPs各0.24 mmol.L-1),0.3μmol.L-1引物,5 ng模板。在此基础上,从50条引物中筛选出16条扩增稳定、多态性丰富的ISSR引物,并通过梯度PCR试验,确定引物最佳退火温度。结论:采用单因子试验和正交设计方法可以快速建立ISSR-PCR反应体系,经过验证,证明该体系稳定可靠,可用于蒲公英遗传分析。
- 李喜凤邱天宝张红梅胡利欣胡春月郑楠楠唐露
- 关键词:蒲公英ISSR-PCR正交实验设计
- 不同种群蒲公英的内转录间隔区(ITS)序列及其亲缘关系分析被引量:4
- 2013年
- 目的对20个不同种源蒲公英样品内转录间隔区(ITS)序列进行序列测定与分析,分析其遗传关系。方法用特异引物进行PCR扩增,扩增产物纯化后,用PCR产物直接测序法测序。用DNASRTAR软件分析测序结果。结果各样品的内转录间隔区序列总长为711 bp,ITS1、5.8S、ITS2序列长度分别为225、262、226 bp。5.8S区较为保守,ITS1和ITS2碱基频率差异显著。结论内转录间隔区序列分析技术可用于蒲公英不同种群的亲缘关系分析。
- 李喜凤邱天宝张红梅胡利欣胡春月郑楠楠唐露
- 关键词:蒲公英亲缘关系
- 基于高通量测序的精神分裂症患者肠道菌群多样性被引量:11
- 2019年
- 目的探讨精神分裂症患者肠道菌群多样性变化。方法收集16例精神分裂症患者(schizophrenia,Sch)与18例健康者(healthy donor,HD)的粪便样本,提取肠道菌群基因组,扩增16SrRNA基因,运用Illumina平台进行测序。对测序结果进行多样性和物种组成差异分析。结果精神分裂症患者组肠道菌群在门、纲、目、科、属、种、分类操作单元(operational taxonomic units,OTUs)水平的群落种类数目少于健康对照组。Alpha多样性指标中患者组的Ace指数(226.58±31.67)、Chao1指数(222.29±34.45)和Shannon指数(2.66±0.69)明显低于健康对照组(293.63±56.07、302.2±57.99、3.59±0.36),差异均有统计学意义(Ps<0.001),而Simpson指数(0.20±0.17)明显高于健康对照组(0.07±0.03),差异有统计学意义(P<0.01);Beta多样性分析显示两组研究对象肠道菌群样本可被鉴别区分。精神分裂症患者组与健康对照组样本在门和属水平上肠道菌群组成和含量有差异,其中患者组拟杆菌门和软壁菌门占比明显低于健康组,差异有统计学意义(21.76%vs.27.05%,P=0.008;0.00%vs.0.20%,P=0.033),而放线菌门明显高于健康组(13.52%vs.2.88%,P=0.020),差异有统计学意义;患者组拟杆菌属和柔嫩梭菌属占比明显低于健康组(9.15%vs.20.60%,P=0.031;3.29%vs.9.58%,P=0.005),差异有统计学意义,而双歧杆菌属、普雷沃菌属和巨单胞菌属明显高于健康组(10.89%vs.1.78%,P=0.025;10.88%vs.1.98%,P=0.046;10.78%vs.2.69%,P=0.026),差异有统计学意义。结论基于16SrRNA的高通量测序有助于分析精神分裂症患者肠道菌群多样性变化,为研究肠道菌群与精神分裂症的关系提供新的思路和理论依据。
- 赵星梅王喜苹周火祥张红梅王秀丽罗予郭葳
- 关键词:精神分裂症RRNA肠道菌群多样性
- C反应蛋白与双相障碍相关性的Meta分析被引量:1
- 2019年
- 目的应用Meta分析系统评价双相障碍(bipolar disorder,BD)与C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)水平之间的关系。方法计算机检索MEDLINE、Cochrane Library、Web of Knowledge、中国期刊全文数据库(CNKI)、万方数据资源系统(WanFang Data)和维普中文期刊数据库(VIP),收集有关BD与CRP的横断面研究文献,检索时间截止至2018年10月。由两位研究者严格按照纳入和排除标准独立筛选文献、提取资料数据并评价纳入研究的方法学质量。运用Stata 12.0软件进行Meta分析。结果共纳入研究文献18篇,包括2208例BD患者和1421例健康对照。Meta分析显示BD患者CRP浓度高于健康对照(SMD=0.52 mg/L,95%CI:0.34~0.69 mg/L,Z=5.77,P<0.001)。按照BD患者不同心境状态进行Meta分析,躁狂期、抑郁期和缓解期分别纳入9篇、6篇和8篇文献,结果显示躁狂期和抑郁期的BD患者CRP浓度均明显高于健康对照组(SMD=0.87mg/L,95%CI:0.60~1.14 mg/L,Z=6.41,P<0.001;SMD=0.95mg/L,95%CI:0.48~1.42 mg/L,Z=3.94,P<0.001),缓解期的浓度也有所升高(SMD=0.63mg/L,95%CI:0.16~1.11 mg/L,Z=2.60,P<0.01)。敏感性分析显示Meta分析结果稳定性较强。该Meta分析存在明显的发表偏倚,但其对分析结果影响较小。结论 BD患者各个心境状态CRP浓度均较健康对照增高,支持了炎症与BD发生发展密切相关的假说,提示可以将CRP作为BD的生物标志物。
- 郭葳赵星梅王喜苹周火祥王秀丽张红梅
- 关键词:双相障碍C反应蛋白META分析
- 蒲公英遗传多样性的ISSR分析被引量:8
- 2012年
- 目的分析蒲公英的遗传多样性。方法采用ISSR分子标记对21个居群蒲公英遗传多样性进行分析,用软件Popgen32分析Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),采用NTSYS 2.10e软件进行聚类分析和主坐标分析。结果 16条ISSR引物共扩增出166条条带,其中多态性条带152条,平均多态性百分率为90.4%,平均H为0.286 5,平均I为0.437 0;遗传距离和遗传一致度分别为0.156 2~0.590 2和0.554 2~0.855 4;UPMGA法进行聚类分析显示,聚类结果与地理来源有较强的一致性,可以看出来源于同一地区的蒲公英种质聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律。结论采用ISSR分析蒲公英遗传多样性,蒲公英表现出丰富的多态性,表明可以用ISSR标记技术对蒲公英进行分子水平的遗传多样性分析。
- 李喜凤邱天宝张红梅胡春月胡利欣郑楠楠唐露
- 关键词:蒲公英ISSR聚类分析
- 脑损伤患儿巨细胞病毒感染及患儿母乳带毒检测
- 目的 了解脑神经发育减慢就诊患儿巨细胞病毒感染情况.方法 应用荧光定量PCR法检测就诊患儿尿中和母亲母乳中巨细胞病毒(HCMV).结果FQ-PCR检测HCMV DNA尿中的阳性率(≥5×102基因拷贝/ml)为...
- 罗予杜开先郭葳赵国新张红梅孟林敏
- 关键词:巨细胞病毒感染脑损伤患儿