杨琳
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：武汉大学基础医学院更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1结构的同源模建被引量：2
- 2016年
- 通过同源模建方法构建猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶Ts CL-1的三维结构模型,并对其结构进行分析。结果表明,Ts CL-1的结构模型具有半胱氨酸蛋白酶CA族典型的α/β折叠模式,结构骨架主要由两个不同的结构域组成。结构模型具有保守的半胱氨酸催化三聚体(Cys25-His163-Asn183),催化三聚体位于两个结构域的表面,结构模型中存在3对二硫键。研究结果将为进一步深入研究Ts CL-1的结构和功能关系奠定结构基础。
- 杨琳赵琴平杨力权
- 关键词：同源模建
- 猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1动态结构柔性分析研究被引量：1
- 2017年
- 通过对猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶Ts CL-1的结构模型进行分子动力学模拟,并对其进行模拟过程中的结构稳定性和动态结构柔性分析。结果表明,模拟过程中Ts CL-1总体结构相对稳定;分子的结构骨架具有较小的波动,而分子的表面环区和底物结合区域则具有较大的波动和较强的构象柔性。研究结果将为进一步深入研究Ts CL-1的动力学行为和功能关系奠定基础。
- 杨琳朱月勋杨艳超赵琴平杨力权
- 关键词：分子动力学模拟
- 猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1的分子大尺度协同运动与催化功能关系研究
- 2019年
- 目的:通过分析猪囊尾蚴半胱氨酸蛋白酶TsCL-1的分子大尺度协同运动对功能发挥的影响,阐述TsCL-1分子动力学行为与其催化性能的关系。方法:通过对TsCL-1分子动力学模拟的平衡轨迹进行本质动力学分析,对TsCL-1的大尺度协同运动进行研究,探讨其运动模式与生物学功能的关系。结果:TsCL-1的大尺度协同运动模式主要表现为大量表面环区和底物结合部位环区的运动,这些运动会导致底物结合口袋在尺寸和形状上的变化,因此可能和底物的结合、定位、催化以及产物释放有关。结论:TsCL-1的大尺度协同运动模式,与底物的结合、定位和催化反应相关,将有利于其催化功能的发挥。
- 杨琳杨琳赵琴平赵琴平
- 关键词：猪囊尾蚴
