孙晓梅
- 作品数：16 被引量：46H指数：4
- 供职机构：石河子大学动物科技学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家生猪现代产业技术体系建设项目国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生更多>>
- 猪lncRNA-ENSSSCT00000018610的克隆及其在猪卵泡中的表达被引量：3
- 2018年
- 为了探究lncRNA-ENSSSCT00000018610在猪卵泡发育过程中的作用,本研究采用RACE技术对lncRNA-ENSSSCT00000018610的全长序列进行了扩增克隆,用Real-time PCR进行组织表达谱分析,并分析其在梅山猪和杜洛克猪卵泡中的表达情况以及采用顺式和反式两种方法对lncRNA-ENSSSCT00000018610靶基因进行预测。结果表明,克隆获得了lncRNA-ENSSSCT00000018610全长序列1 731bp;lncRNA-ENSSSCT00000018610在肌肉、心、肝、脾、肺、肾、十二指肠、卵巢、输卵管、子宫、垂体、黄体、下丘脑中均有不同程度的表达,其中以肾、肺、子宫、卵巢表达量相对较高;lncRNA-ENSSSCT00000018610在杜洛克猪S、L卵泡中的表达量显著高于梅山猪(P<0.05),在杜洛克猪M1和M2卵泡中的表达水平极显著高于梅山猪(P<0.01)。lncRNA-ENSSSCT00000018610的潜在靶基因TNIP1、CYP2J2、SCARB1、IBSP等与猪产仔性状相关,并且参与猪的卵泡发育。提示其可能通过对靶基因的调控间接参与卵泡发育过程。
- 李梦寻黄涛马力鹏刘乙李涛公红斌邱梅玉谢苏孙晓梅
- 关键词：卵泡表达量母猪
- 母猪妊娠早期血液中差异表达蛋白的鉴定被引量：1
- 2022年
- 为了研究母猪妊娠早期外周血液中蛋白质的表达情况,寻找潜在的母猪妊娠早期生物标志物,本试验采集了8头健康、生产表现正常且体况相近的配种后15 d妊娠与非妊娠的长大二元经产母猪外周血液,分离蛋白,利用iTRAQ技术及生物信息学方法筛选与胚胎附植相关的差异表达蛋白,用ELISA验证其表达情况,并进行ROC曲线分析。结果显示,筛选到配种后15 d妊娠与非妊娠母猪外周血中的24个差异表达蛋白(妊娠母猪中19个上调,5个下调),主要富集的信号通路包括PI3K-Akt、p53、MAPK、Estrogen和mTOR等重要信号通路。ELISA结果验证其表达趋势与iTRAQ检测结果一致。ROC曲线分析发现,配种后15 d血液中的FLNC、ADIPOQ、HP和TERF2以及FLNC-ADIPOQ、ADIPOQ-HP联合使用均可作为母猪早期妊娠潜在的生物标志物,且准确性与特异性较好。本研究鉴定了配种后15 d母猪血液中差异表达蛋白,且发现FLNC、ADIPOQ、HP和TERF2可作为母猪妊娠早期的潜在生物标志物,并为母猪胚胎附植机制研究提供新视角。
- 祁梦凡谢苏高若男孙义姗孙晓梅和军飞鲁慧文卢世豪陈鑫李清春黄涛
- 关键词：ITRAQ蛋白组学早期妊娠生物标志物
- 猪miR-23a-27a-24簇启动子预测及活性分析
- 2023年
- 目的 本研究旨在对猪miR-23a-27a-24簇(miR-23a-27a-24 cluster)的潜在启动子区域进行预测和分析,为进一步探索miR-23a-27a-24基因对猪转录调控机制的研究奠定基础。方法 利于生物信息学分析猪miR-23a-27a-24簇的启动子区域、CpG岛及其潜在的转录因子;利用截短突变和PCR技术克隆得到5个逐级缺失的miR-23a-27a-24基因启动子片段,构建双荧光素酶报告载体,通过检测各载体的双荧光素酶活性获得miR-23a-27a-24基因的核心启动子区域。结果 pGL3-cMiR启动子在猪miR-23a-27a-24簇上游341bp至994bp区荧光素酶活性最强,为pGL3-basic空载体活性的5.02倍(P<0.05),视为miR-23a-27a-24簇核心启动区。生物信息学分析表明:猪miR-23a-27a-24簇启动子区不含CpG岛,其核心启动子区可能存在SP1、VDR、MAZ、YY1、E2F1和ELF1六种潜在的转录因子结合位点。结论 本研究构建并确定了猪miR-23a-27a-24簇核心启动子区域,可为今后开展猪miR-23a-27a-24簇的转录调控机制奠定基础。
- 李清春孙晓梅孙敬礼黄涛
- 关键词：启动子转录调控
- VRTN基因型对猪生长和繁殖性能的影响被引量：5
- 2022年
- 目的为了研究椎骨发育相关(vertnin,VRTN)基因对猪生长和繁殖性能的影响。方法利用PCR产物电泳法检测加系长白、加系大白、加系杜洛克及美系杜洛克母猪的VRTN基因多态性,以分析VRTN基因不同基因型对生长(校正100 kg背膘厚、校正100 kg体重日龄、校正100 kg眼肌面积等)和繁殖性能(繁殖指数、父系指数、母系指数、总仔数EBV、活仔数EBV等)的影响。结果在加系大白猪中,3种基因型间生长、繁殖性状无显著差异(P>0.05);在加系长白猪中,背膘厚qq基因型显著大于Qq基因型(P<0.05),qq基因型校正100 kg背膘厚EBV极显著高于Qq基因型(P<0.01)、显著高于QQ基因型(P<0.05);加系杜洛克猪中,QQ基因型校正100 kg体重日龄EBV显著大于qq基因型(P<0.05),母系指数qq基因型极显著高于Qq、QQ基因型(P<0.01),父系指数qq基因型极显著高于QQ基因型(P<0.01)、显著高于Qq基因型(P<0.05);在美系杜洛克猪中,qq基因型的校正100 kg体重日龄EBV显著大于Qq(P<0.05),母系指数和父系指数Qq基因型均极显著高于qq基因型(P<0.01)。结论VRTN基因对长白和杜洛克猪的生长和繁殖性能存在影响,为培育出多肋骨的商品猪提供了依据。
- 卢世豪崔浩闫耀晖孙晓梅李清春陈鑫祁梦凡何凡黎明国黄涛
- 关键词：多态性基因型
- 大白猪FUT1和PRLR基因多态性与产仔性状的关联分析被引量：2
- 2019年
- 为探讨FUT1和PRLR基因多态性与母猪繁殖性状的相关性,该试验采取PCR-RFLP和PCR检测方法对909头大白猪群体进行FUT1和PRLR基因的多态性检测,并对不同基因型的总产仔数、产活仔数、健仔数、窝重等与繁殖相关的性状进行了关联性分析。分析结果显示,在该试验群体中B基因是FUT1的优势等位基因,A基因是PRLR的优势等位基因。对于FUT1基因,AA型个体死胎比BB型少0.31头/胎(P <0.05),AA型个体总活仔数比AB型个体高1.30头/胎(P <0.05),其他繁殖性状上各基因型间均无显著差异。对于PRLR基因,AA型个体窝重比BB型个体显著高出0.84头/胎(P <0.05),各基因型间其他繁殖性状上均无显著差异。合并基因型分析发现:在大白猪中PRLR-FUT1最优分子标记组合为BBAA,其次是ABAA型组合较佳。
- 谢苏孙晓梅孙义姗黄涛
- 关键词：大白母猪PRLR繁殖性状基因多态性
- LTBP-1基因多态性与母猪繁殖性状关联分析被引量：1
- 2019年
- 目的TGF-β信号通路在哺乳动物早期胚胎发育和初级卵泡、次级卵泡的转化过程中发挥着重要作用,而潜在性转化生长因子结合蛋白1(LTBP-1)是TGF-β的上调因子,直接决定了TGF-β的生物活性,进而间接影响哺乳动物的胚胎发育表现出不同的繁殖性状,但LTBP-1基因多态性对猪繁殖性能的影响还未见报道。方法本实验通过采用PCR-SSCP和CRS-PCR-RFLP技术,检测LTBP-1基因的两个SNP位点,对446头大白母猪进行分型并与繁殖性状关联分析。结果LTBP-1基因C113404036G突变造成谷氨酰胺转变为组氨酸,检测到CC、CG、GG3种基因型,各基因型大白母猪总仔数、活仔数、健仔数、死胎数、木乃伊胎数差异不显著,但CC型初生窝重显著高于CG型(P<0.05);大白猪LTBP-1基因A113356472G突变造成半胱氨酸转变为酪氨酸,检测到AA、AG2种基因型,AG型母猪总产仔数显著高于AA型(P<0.05)、木乃伊胎数显著低于AA型(P<0.05)。结论LTBP-1基因C113404036G和A113356475G两个错义突变位点,有望作为猪繁殖性状的分子标记。
- 孙晓梅姜茹斌刘乙黄涛邱梅玉谢苏孙义姗
- 关键词：母猪繁殖性状多态性分析
- 影响杜长大商品猪胴体评级的性状分析被引量：7
- 2020年
- 为研究影响杜长大商品猪胴体评级的相关性状,选择206头活重在90~150 kg的商品猪进行称重、活体背膘P2点测定、屠宰性能测定,测定指标包括:活体重、背膘厚、胴体重、肩膘、6-7肋间膘、最后肋膘、肉色、肋骨数以及胴体等级等主要性能指标,分析性状间的相关性,对不同等级的各胴体性状进行显著性检验,并建立胴体等级与其他性状指标间的回归方程。结果:宰前活重在109.43~116.70 kg、活体背膘厚度11.47~13.44 mm时,胴体评级最优(1~2级);随着宰前活重的增加,肩膘厚、6-7肋间膘厚、最后肋膘厚随之增加,肉色值也有增加的趋势;胴体等级与活体背膘、肩膘厚、6-7肋间膘厚、最后肋膘厚、肉色、性别等性状具有显著的相关性。本研究为指导商品猪饲养管理、商品猪评级、改善养猪经济效益提供了参考依据。
- 和军飞黄涛孙艳洋朱生巍孙晓梅高若男孙义姗谢苏
- 关键词：商品猪胴体性状体重
- 基于SNP芯片的猪基因组选择效果分析被引量：4
- 2023年
- 为探究单步基因组最佳线性无偏预测(SSGBLUP)法应用于生猪育种的选择效果,选取杜洛克、长白、大白种猪共1996头,利用SNP芯片获得个体基因型数据,结合表型数据和系谱数据,利用HIBLUP软件的SSGBLUP模型和基于系谱的最佳线性无偏预测(PBLUP)模型分别计算估计育种值,参考全国种猪遗传评估中心的标准计算综合选择指数,利用理论准确性和后裔测定成绩评估选择效果。结果表明:通过SSGBLUP法计算达100 kg日龄、达100 kg背膘厚及总产仔数的基因组估计育种值(GEBV)与PBLUP法计算的估计育种值(EBV)的相关系数均大于0.8;达100 kg日龄、达100 kg背膘厚及总产仔数GEBV准确性相对于EBV准确性均有所提高;SSGBLUP法与PBLUP法选留的长白和大白种猪,其后代的生长速度显著优于场内选择法选留种猪的后代。本试验中,SSGBLUP法与PBLUP法均能有效提高选留种猪后代的生长速度且二者分别计算的GEBV和EBV相关性高,但SSGBLUP法选种的准确性更高,后期可利用全基因组选择对场内现有种猪进行选种指导。
- 陈鑫孙晓梅鲁慧文黄涛
- 关键词：背膘厚总产仔数
- 猪circ0001651的鉴定及其在卵泡中的表达研究被引量：6
- 2019年
- 本实验旨在探究circRNA在猪卵泡发育过程中的作用,通过生物信息学分析预测其可能的调控机制,为进一步探索circRNA对卵泡发育的调控机制奠定基础。采用RNA-Seq技术对卵泡中差异性表达的circRNA进行筛选,用Real-time PCR进行组织表达谱分析,并分析其在梅山猪和杜洛克猪卵泡中的表达情况。结果表明:circ0001651在肌肉、脂肪、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、输卵管、子宫、子宫角、垂体、下丘脑中均有不同程度表达,其中在下丘脑、垂体、输卵管、卵巢表达量相对较高;circ0001651在梅山猪M2卵泡(M2卵泡直径:5.1～7.0 mm)中的表达量极显著高于杜洛克猪(P <0.01),在杜洛克猪M1卵泡(M1卵泡直径:3.1～5.0 mm)中的表达量极显著高于梅山猪(P<0.01);其潜在靶基因CCR2、EGFL7、TNFRSF12A、CFL1、EGR1、GADD45G、SLIT2等与猪的卵泡发育相关。生物信息学分析显示,circ0001651部分靶标基因参与细胞周期、细胞增殖凋亡及卵巢发育等相关信号通路,提示其可能通过对靶基因的调控作用间接参与卵泡发育过程。
- 谢苏李梦寻孙义姗孙晓梅黄涛
- 关键词：母猪组织表达谱RNA-SEQ
- 猪circ0015292的鉴定及其在卵泡中的表达研究被引量：4
- 2019年
- 试验旨在通过高通量测序及生物信息学分析circRNA在猪卵泡发育过程中的作用及其可能的机制,为进一步探索circRNA对猪卵泡发育的调控机理奠定生物学基础。采集梅山和杜洛克猪不同级别的卵泡及各组织样本,提取总RNA,采用RNA-Seq技术对卵泡中差异表达的circRNA进行筛选,同时验证并分析其在梅山猪和杜洛克猪卵泡中的表达情况,并用实时荧光定量PCR进行组织表达谱分析。结果显示:试验证实了circ0015292的存在,且其在肌肉、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、输卵管、子宫、垂体及下丘脑中均有不同程度的表达,在心脏、脾脏、肺脏、卵巢中的表达量相对较高;circ0015292在梅山猪S卵泡中的表达量极显著高于杜洛克猪(P<0.01),在杜洛克猪M1、M2、L卵泡中的表达量均显著高于梅山猪(P<0.05);其潜在靶基因GADD45G、CCR2、IL20RB、CFL1、LAMB3与猪的卵泡发育相关。综合试验结果,circ0015292在不同组织、不同时期卵泡中均有不同水平的表达;部分靶标基因参与细胞周期及卵巢发育相关信号通路,提示其可能通过对靶基因的调控作用间接参与卵泡发育过程,这为猪繁殖机理的研究提供了新思路。
- 谢苏李梦寻邱梅玉公红斌孙义姗孙晓梅孙晓梅
- 关键词：组织表达谱RNA-SEQ
