陈虹君
- 作品数：6 被引量：10H指数：2
- 供职机构：浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金浙江省公益性技术应用研究计划项目国家级大学生创新创业训练计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 倭竹族中14-3-3基因家族的克隆和序列分析
- 14-3-3蛋白是高度保守性的基因家族.本实验采用同源克隆的方法分别从白纹阴阳竹、摆竹、毛竹、鸡毛竹和唐竹5个竹种中克隆得到了GF14b、GF14c、GF14e、GF14f的基因全长.对5个竹种中的4个14-3-3基因序...
- 许在恩俞瑜李兵娟陈虹君郭小勤
- 关键词：基因序列生物信息学
- 文献传递
- 毛竹IDD基因家族启动子分析
- D基因家族编码一种混合型的转录因子,多数参与植物的生长发育.真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要,但是目前对PhIDD基因家族上游顺式元件的详细分析较少.本研究截取毛竹(Phyllos...
- 陈虹君高臻毅郭小勤
- 关键词：毛竹启动子顺式元件
- 毛竹IDD基因家族启动子分析被引量：4
- 2016年
- IDD基因家族编码一种混合型的转录因子,多数参与植物的生长发育.真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要.本研究截取毛竹IDD家族8个基因(Ph IDD1-2,Ph IDD4-8和Ph ID1)起始密码子前2 000 bp序列,顺式作用元件分析显示,这些基因启动子中均存在TATA框和CAAT框,除此之外,上游调控区域还存在光响应元件、激素响应元件、逆境胁迫元件以及其他响应元件,其中有些元件是某个基因所特有的,表现出该基因家族各基因独特的表达模式,也表明该家族基因的功能分化,参与植物发育的各个阶段.
- 陈虹君高臻毅郭小勤
- 关键词：毛竹启动子顺式元件
- 竹类植物Dwarf 14(D14)基因的多态性分析被引量：5
- 2018年
- 独脚金内酯(SL)是一种新型的植物激素,可调控植物分枝。DWARF14(D14)蛋白可作为该激素受体,也可以在该激素信号传导过程中起一定作用。为研究D14基因与竹类植物地下茎类型的相关性,通过基因克隆和生物信息学手段,分析具有不同地下茎类型(散生型、丛生型和混生型)的17种竹种材料中该基因序列变异。结果表明,各竹种中D14基因均含有2个外显子和1个内含子,序列间同源性为92.57%,c DNA序列的同源性为98.97%,氨基酸序列的同源性为98.61%。所编码的蛋白序列均含催化中心的保守氨基酸(Ser147、Asp268和His297)及包裹SL裂解物的氨基酸残基(Phe186、Val194、Trp205、Tyr209、Phe245和Ser270)。DNA序列富含单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP的频率为1SNP/22 bp,多样性指数πCDS为0.01476。其中,7个SNP位点能将丛生竹与其他2个类型的竹区分开来。基于D14基因的基因组序列所构建的系统进化树基本能反映供试材料的地下茎类型,该研究有助于了解竹类植物不同地下茎类型的分子差异,为提高竹笋产量提供了理论依据。
- 龚莺陈虹君许在恩郭小勤
- 关键词：竹类植物DWARF基因多态性
- 倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性被引量：1
- 2016年
- 为研究倭竹族Shibataeeae中14-3-3非ε类基因的结构及其编码区单核苷酸多态性,分别从倭竹族5个不同属的代表种中获得14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e,14-3-3f的基因全长。这些基因均包含5个外显子和4个内含子,编码序列(CDS)大小为771~789 bp。14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e和14-3-3f编码区序列中分别有21,19,26和17个单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP频率分别为1SNP/38 bp,1SNP/41 bp,1SNP/30 bp,1SNP/46 bp,基因核苷酸多样性(π)值分别为0.012 17,0.011 83,0.015 21,0.010 38。同一基因在不同竹种间氨基酸序列一致性均达99%以上,毛竹Phyllostachys edulis Pe14-3-3b,Pe14-3-3c,Pe14-3-3e,Pe14-3-3f蛋白的理化性质非常相似,均为亲水性蛋白,含量较多的是丙氨酸(ala),谷氨酸(glu),亮氨酸(leu),等电点为4.75~4.90,这4个蛋白的二级结构也非常相似,α-螺旋结构含量最高,无规则卷曲其次,β-转角和延伸链很少。上述研究为进一步探索竹类植物14-3-3生物学功能奠定基础。
- 许在恩俞瑜李兵娟陈虹君郭小勤
- 关键词：分子遗传学竹类植物单核苷酸多态性
- 毛竹IDD基因家族启动子分析
- IDD基因家族编码一种混合型的转录因子,多数参与植物的生长发育.真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要,但是目前对毛竹IDD基因家族各成员上游顺式元件的详细分析未见报道.本研究截取毛竹(...
- 赵建文陈虹君郭小勤
- 关键词：毛竹生长发育启动子
