冷文川
- 作品数:4 被引量:0H指数:0
- 供职机构:北京蛋白质组研究中心更多>>
- 发文基金:国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- sRP技术在微量蛋白质组学分析中的应用
- 2016年
- 目的:发展一种适用于微量临床样本的简单而高效的预分离方法,实现深度覆盖蛋白质组学分析的目的。方法:以H1975细胞系和胃黏膜活检组织等复杂样本为研究对象,比较基于高p H反相色谱微柱(s RP)技术在不同浓度梯度洗脱时的蛋白鉴定数目、蛋白定性与定量研究的重复性及不同组分间的肽段预分离效果,并将s RP技术初步运用到微量胃黏膜活检组织的蛋白质组学分析中,进一步注释鉴定的胃黏膜蛋白的生物学功能。结果:单个复杂样本蛋白鉴定的覆盖深度达到7500左右,时间缩短到8 h之内;在生物学重复性研究中,蛋白定性检测的重复率在90%以上,无标定量检测的相关系数R2则达到0.97;各组分之间的肽段预分离效果很好,最大的重复率也只有11.6%;在胃黏膜组学分析中,累积鉴定到9000多个非冗余蛋白,实现了对人类胃黏膜蛋白质组的深度覆盖。结论:s RP技术操作简单且重复性好,联合高通量质谱技术,实现了对微量临床样品的深度覆盖蛋白质组学分析。
- 杨帅刘明伟冷文川秦钧徐建明
- 关键词:质谱蛋白质组学
- 建立健康人尿蛋白质组定量参考范围的方法及健康人尿蛋白质组数据库
- 本发明公开了建立健康人尿蛋白质组定量参考范围的方法和健康人尿蛋白质组数据库,是将统计数量健康人的尿样制成尿蛋白样品,经质谱检测、搜库及定量确定其中的蛋白种类及各蛋白的定量形成一个尿蛋白质组数据,将不同尿蛋白质组数据归集不...
- 秦钧甄蓓冷文川倪晓天路天元王广舜孙长青钟博文
- 文献传递
- 获取肿瘤尿蛋白标志物的方法及得到的肿瘤相关离群尿蛋白库
- 本发明获取肿瘤尿蛋白标志物的方法及得到的肿瘤相关离群尿蛋白库,基于建立的健康人尿蛋白组数据库中人尿蛋白的定量参考范围,从肿瘤患者尿蛋白质组数据集中用超几何分布检验的方法筛选离群蛋白作为肿瘤尿蛋白标志物,并建立肿瘤相关离群...
- 秦钧甄蓓冷文川倪晓天路天元王广舜孙长青钟博文
- 一种尿蛋白制备方法及尿蛋白质组的检测方法
- 本发明公开了一种尿蛋白质组的检测方法,包括尿蛋白的制备、在蛋白或肽水平的分离、质谱鉴定,其特征在于,所述尿蛋白制备方法包括下面步骤(1)将尿液样品在常温下超速离心一段时间,弃去上清液,保留沉淀;(2)向步骤(1)所述的沉...
- 秦钧冷文川倪晓天路天元甄蓓王广舜孙长青钟博文
- 文献传递