吕奕
- 作品数:4 被引量:16H指数:3
- 供职机构:台州学院生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家级大学生创新创业训练计划浙江省公益性技术应用研究计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学农业科学更多>>
- 虾脊兰属11种药用植物rDNA ITS的克隆与序列分析被引量:6
- 2018年
- 目的通过比对11种虾脊兰属药用植物的rDNA ITS序列,为该属植物的分子鉴定奠定基础。方法以叶片基因组DNA为材料,利用PCR法克隆虾脊兰属植物的ITS序列,利用Clustal、Gen Doc和Mega等软件进行生物信息学分析。结果 11种虾脊兰属植物的ITS全长为652~661 bp,其中ITS1为228~230 bp,ITS2为256~264 bp,5.8 S的长度则完全一致,均为167 bp;ITS1和ITS2分别有44与46个变异位点,其中信息位点数为22和24个,而5.8 S中没有检测到变异位点和信息位点;系统发育分析结果表明,11种虾脊兰属植物之间的遗传距离为0.002~0.081,在发育树上可分为3组,I~Ⅲ组的物种数量分别为5、4和2。结论 11种虾脊兰属植物的ITS序列具有丰富的信息位点,可用于这些药用植物的分子鉴定。
- 蒋明吴棣飞鲍洪华贺蔡明朱欣吕奕蒋晓颖
- 关键词:RDNAITS克隆
- 斑叶兰属7种药用植物rDNA ITS序列的克隆与分析被引量:5
- 2016年
- 目的 克隆和分析7种斑叶兰属药用植物的ITS序列,为该属植物的分子鉴定提供依据。方法 利用PCR法克隆ITS序列,在测序的基础上,借助生物信息学软件进行序列分析和系统发育分析。结果 7种斑叶兰属植物的ITS全长为700~702 bp,ITS1的长度为239~240 bp,ITS2为298~300 bp,而5.8 S的长度十分保守,均为162 bp;序列中检测到可变位点107个,其中信息位点34个。7种斑叶兰属植物的遗传距离为0.006~0.110,大花斑叶兰与高斑叶兰的遗传距离最大,亲缘关系最远,而斑叶兰和小斑叶兰的遗传距离最小,关系最近。结论 克隆到7种斑叶兰属药用植物的ITS序列,它们信息位点丰富,这些位点可将7种植物完全区分。
- 蒋明郭志平章燕如许鑫朱欣蒋晓颖吕奕
- 关键词:ITS分子克隆分子鉴定
- 基于SRAP分子标记技术研究浙江产细叶石仙桃的遗传多样性被引量:3
- 2018年
- 目的以药用植物细叶石仙桃为材料,利用SRAP分子标记技术进行遗传多样性研究,为进一步开展该物种的保护奠定基础。方法从81对SRAP引物组合中,共筛选出7对用于SRAP-PCR,对浙江省境内5个自然居群的68份细叶石仙桃进行了遗传多样性分析。结果共获得197个电泳谱带,其中多态性条带为190条,每对引物平均提供27.29个标记信息,平均有效等位基因数目(N_e)为1.238 1。在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为96.45%,N_ei’s基因多样性指数(H)为0.188 2,Shannon’s信息指数(I)为0.312 5;在居群水平上,PPB为30.46%~46.19%,平均为40%,H为0.089 1~0.155 9,平均0.120 8,I为0.138 7~0.234 9,平均0.186 4;5个居群的基因分化系数(G_(st))为35.81%,基因流(N_m)为0.896 3。UPGMA聚类结果表明,68份样品可分成5组,同一居群的细叶石仙桃聚于同一分支。结论细叶石仙桃具有较高的遗传多样性水平,居群间也存在一定的遗传分化和基因交流,但大部分遗传变异存在于居群内。
- 朱欣蒋晓颖金魏佳吕奕何佳范灵希高松蒋明
- 关键词:珍稀植物SRAP药用植物
- 青花菜BoBURP1基因的克隆与表达分析被引量:2
- 2016年
- BURP是一类存在于植物中的特有蛋白,在生长发育和逆境响应等方面起重要作用。试验从青花菜中克隆到一个BURP基因,命名为Bo BURP1,在生物信息学分析的基础上,用RT-PCR研究了它在不同器官中的表达模式。研究结果表明,Bo BURP1的基因组DNA全长2 030 bp,具2个内含子;编码区全长为1 872bp,编码623个氨基酸;推导的蛋白质分子量为70.795 6 ku,等电点为8.65。系统发育分析结果表明,Bo BURP1与12种不同植物的同源蛋白可分为3组,Bo BURP1与十字花科植物同源序列的相似性最高,在进化树上聚为一组。RT-PCR结果表明,Bo BURP1在根、茎、叶、花蕾、花和角果中均有表达,叶、花蕾和花的表达量最高,而根和茎中的表达量最低。
- 章燕如俞可可龚秀周秀倩祝琦许鑫朱欣吕奕蒋晓颖蒋明
- 关键词:青花菜克隆