目的分析哈尔滨市新确诊男男同性性接触者(men who have sex with men,MSM)HIV-1感染病例的毒株基因型特征。方法收集2012-2015年新确诊且未经过抗病毒治疗的HIV-1感染者抗凝血,分离外周血单核细胞,从中提取基因组DNA,采用巢式PCR法扩增gag和env基因。采用MEGA7.0软件构建gag和env基因系统发育树,分析基因型特点。结果共收集148例MSM HIV-1感染者样本,均获得gag和env基因序列。系统发育树显示,其中CRF01_AE亚型108例,占73.0%;B亚型19例,占12.8%;CRF07_BC 12例,占8.1%;独特重组型9例,占6.1%。在不同年份、不同年龄群体的标本中,CRF01_AE均为优势基因型。在CRF01_AE毒株中,98.1%(106/108)与我国MSM人群参考株成簇,1.9%(2/108)与泰国及我国西南地区异性传播参考株成簇。77.8%(7/9)的独特重组型毒株来自20~40岁群体。2012年开始出现gag和env基因间重组亚型,2014年发现gag基因内重组亚型,2015年出现基因内和基因间均发生重组的复杂亚型,尚未发现env基因内重组毒株。结论哈尔滨市2012年至2015年新确诊男男同性性接触人群HIV-1感染病例中流行毒株基因型较复杂,CRF01_AE亚型毒株一直是本地区的优势毒株,同时,基因间和基因内重组毒株已出现。因此,加强MSM人群新发感染病例的实时监测,并制定有效的预防措施是非常必要的。