孙浩
- 作品数：13 被引量：45H指数：4
- 供职机构：上海交通大学农业与生物学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市科技兴农重点攻关项目上海市科技兴农推广项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 浦东白猪遗传多样性及繁殖性能的变化分析被引量：3
- 2017年
- 试验旨在研究浦东白猪现存群体的遗传多样性及其繁殖性能变化的原因。利用全基因组范围内的遗传标记(SNPs),对比6个太湖流域地方品种及3个西方引进品种,对浦东白猪的遗传多样性进行了分析。同时利用落入繁殖候选基因内的SNPs,分析了群体的多样性及结构。结果显示,相较于本研究中所选择的太湖流域地方品种及西方引进品种,浦东白猪的遗传多样性较太湖流域地方品种低;除枫泾猪外,浦东白猪繁殖相关SNPs的多态性标记的比例、期望杂合度最低,等位基因丰度仅高于杜洛克猪;主成分分析(PCA)结果揭示浦东白猪繁殖相关SNPs位点仍具有其群体独特性。研究结果揭示了浦东白猪现存群体遗传多样性较低,繁殖性能的退化可能是由于一些有利等位基因的灭绝、繁殖相关基因多态性及个体杂合性的降低所致。但是浦东白猪仍然携带一定数量的有利等位基因且依旧具有其群体独特性,暗示浦东白猪仍具有较高的保种价值。本研究为浦东白猪后期的选育、保种和开发利用提供了一定的参考。
- 肖倩张哲孙浩张向喆沈大德储野根王起山潘玉春
- 关键词：繁殖性能
- 金华猪与杜洛克、长白猪、大白猪杂交的杂种优势预测被引量：5
- 2019年
- 本研究旨在探讨杜洛克(D)、大白(Y)和长白(L)3个知名西方品种与金华猪(J)的杂交利用情况。应用"基于基因组简化与测序的基因型判型(GGRS)"技术平台,检测单核苷酸多态性(SNPs)并判定基因型。利用全基因组性状特异的SNP分子标记估算不同群体间的遗传距离,从胴体与肉品质、繁殖、健康和生长4个性状对金华猪不同杂交模式下的杂种优势进行预测。结果表明:共找到繁殖、生长、胴体与肉品质和健康性状潜在相关基因的SNP分别为1 835、2 174、196 057、17 200个;在二元杂交组合中,♂杜×♀金(D×J)为较优组合;在三元杂交组合中,♂金×♀长大(J×LY)为较优组合;在四元杂交组合中,♂杜金×♀长大(DJ×LY)为较优组合。本研究应用生物信息学技术对金华猪不同杂交模式的杂交优势进行预测,可大大减少后续的配合力实验,结果可为金华猪的保种和杂交利用提供一定参考。
- 徐忠张哲孙浩张向喆徐宁迎陈究成华坚青钟土木王起山潘玉春
- 关键词：金华猪杂种优势预测
- 利用全基因组数据探讨两种不同环境下杜洛克猪遗传背景的变化
- 引言环境在猪育种中起着重要的作用。环境的改变往往能够导致猪遗传背景发生变化，而这种变化常常给育种实践带来一些难以预料的后果，比如在一种环境育种值下排序较为靠前的猪，到了另一种环境下，表现反而较差。为了探讨两种不同清洁程度...
- 张哲肖倩马裴孙浩王起山潘玉春
- 关键词：杜洛克猪
- 浦东白猪杂交试验报告--繁殖性能与育肥性能
- 浦东白猪原产于上海市浦东新区,是中国优良的地方品种之一,也是中国唯一毛色全白的地方品种.其最大特点是产仔数多、母性好,堪与二花脸、梅山猪等太湖流域地方品种媲美.此外,该品种也具有肉质鲜嫩、色泽红润、失水率低等特点.20世...
- 肖倩张哲孙浩王振赵静廖荣荣张向喆沈大德储野根王起山潘玉春
- 关键词：杂交组合繁殖性能育肥性能
- 绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因预测分析
- 2016年
- 本研究旨在分析绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因,将已鉴定的microRNA与预测microRNA组成全基因组的microRNA,并通过与GGRS得到的两种鸡群体SNP位点进行映射,挖掘含SNP的microRNA。利用生物信息学的方法,对含SNP的microRNA进行靶基因预测,并对直接含有SNP的maturemicroRNA进行聚焦。将这些靶基因进行富集,一共得到22个GO分类和10条KEGG信号通路与3个主要IPA调控网络,发现其在与生长相关的mTOR信号通路、Wnt信号通路、生长激素受体网络、胰岛素样生长因子Ⅰ受体网络得到了富集,与产蛋性状相关的卵母细胞减数分裂信号通路、黄体酮卵母细胞成熟信号通路得到了富集。此研究方法和结果可以给后期研究提供参考。
- 管毓渝廖荣荣王振赵静陈振亮张哲肖倩孙浩王起山张向喆杨长锁潘玉春
- 关键词：绿壳蛋鸡MICRORNASNP
- 浦东白猪杂交试验报告——繁殖性能与育肥性能被引量：1
- 2016年
- 为了加强浦东白猪的开发和利用,结合杂种优势预测,我们选择♂杜×♀长浦(♂D×♀LP,DLP)、♂大×♀长浦(♂Y×♀LP,YLP)、♂浦×♀长大(♂P×♀LY,PLY)三元杂交模式以及浦东白猪纯繁(♂P×♀P,PP)和二元杂交模式的♂长×♀大(♂L×♀Y,LY)作为试验杂交组合,分别测定了各组合的繁殖性能和育肥性能。结果显示:♂D×♀LP、♂Y×♀LP、♂P×♀LY之间母本的总产仔数无显著差异(P>0.05),但均显著高于♂P×♀P(P<0.05);♂Y×♀LP的母本产活仔数最高,♂P×♀LY的次之,且均显著高于♂P×♀P(P<0.05);PLY初生个体重显著高于DLP(P<0.05);同时PLY商品猪达40 kg、60 kg、95 kg时的日龄最短,与DLP、PP显著差异(P<0.05);PLY在日增重上与DLP、YLP并无显著差异(P>0.05),但PLY料重比最高。综合来看,♂D×♀LP、♂Y×♀LP、♂P×♀LY均可作为配套杂交组合,但♂P×♀LY可能更加值得推崇。研究结果为浦东白猪的杂交利用提供了一定的参考。
- 肖倩张哲孙浩王振赵静廖荣荣张向喆沈大德储野根王起山潘玉春
- 关键词：杂交繁殖性能育肥性能
- 基于芯片数据和整合分析研究奶牛乳房炎的关键通路被引量：1
- 2016年
- 奶牛乳房炎是奶牛的常见病和多发病之一,给奶牛业带来巨大的经济损失,严重制约着奶牛业的发展。为了进一步了解乳房炎的调控机理,对已发表的5套大肠杆菌感染奶牛乳腺上皮细胞的表达谱芯片数据统一进行预处理,并整合大肠杆菌感染1、6、24h的基因富集分析,以期得到更可靠的影响奶牛乳房炎的关键基因和通路。结果发现,感染1、6和24h数据集的分析结果中共同下调通路分别为9、30和17个,分析结果确定了一些奶牛乳房炎相关的通路及基因,为进一步揭示其调控机理提供参考。
- 赵静陈振亮王振张哲肖倩管毓渝孙浩刘光磊张向喆潘玉春廖荣荣王起山
- 关键词：奶牛乳房炎通路
- 基于基因组测序数据的梅山猪保种现状分析被引量：15
- 2017年
- 梅山猪是我国太湖流域优良地方品种之一,以繁殖力高和肉质鲜美闻名于世。为探究这一珍贵遗传资源的保种现状,本研究利用4家梅山猪保种场的143头梅山猪简化基因组测序数据,对现有群体的遗传多样性及遗传结构进行了分析。结果表明,各保种场群体有效含量均处于严重威胁状态,群体有效含量(Ne)小于65;中梅山群体具较高的多态标记比,小梅山群体具较高的观测杂合度与期望杂合度;小梅山与中梅山2类型间存在较大遗传分化,群体分化指数(Fst)为0.111,遗传距离(D)为0.287;2个小梅山保种场群体间的遗传分化较弱(Fst=0.055,D=0.239),而2个中梅山保种场群体间则达到中等程度遗传分化(Fst=0.127,D=0.273)。本研究利用测序数据首次全面揭示了现有梅山猪保种群体的遗传多样性与遗传结构关系,为更好地保护与利用梅山猪提供了分子依据。
- 孙浩王振张哲肖倩徐忠张向喆杨红杰杨红杰薛明薛明张文俊郑友民郑友民王起山
- 关键词：梅山猪
- 浦东白猪及其杂种猪胴体与肉质性能分析被引量：3
- 2016年
- 为加强对浦东白猪的开发与利用,选择♂杜×♀长浦(DLP)、♂大×♀长浦(YLP)、♂浦×♀长大(PLY)、浦东白猪纯繁(PP)和♂长×♀大二元杂种(LY)作为试验组合,分别测定了各组合的胴体性能和肉质性能;同时对PLY商品猪肌肉中氨基酸、脂肪酸的成分与含量进行了分析。结果显示:DLP的屠宰率、瘦肉率均显著高于PLY(P<0.05),YLP的屠宰率高于PLY但差异不显著(P>0.05),瘦肉率显著高于PLY(P<0.05);YLP嫩度值最优,PLY次之,两者差异不显著(P>0.05);PLY背最长肌中必需氨基酸和鲜味氨基酸分别占总氨基酸含量的42.06%和46.39%,不饱和脂肪酸(USFA)与饱和脂肪酸(SFA)的比值为1.33。结果表明:在考虑胴体与肉质的情况下,3种杂交组合的优劣顺序为DLP>YLP>PLY,但若考虑繁殖性能、育肥性能、整体成本及经营管理,PLY可作为重点进行开发。研究结果为浦东白猪的杂交利用和生产优质猪肉提供了一定的参考。
- 肖倩张哲孙浩王振赵静廖荣荣张向喆沈大德储野根王起山潘玉春
- 关键词：杂交胴体性能肉质性能
- 杂谈猪的遗传改良——正确认识国外遗传评估体系对我国进口种猪的评估被引量：5
- 2017年
- 我国每年都从国外引进大量种猪。引种时供种方所提供的种猪遗传评估信息的真实性与加入国外遗传评估体系(如NSR)的有效性值得探讨。本研究以从美国引种并且又加盟美国NSR的某国家级核心育种场为例,针对达目标体重日龄、活体背膘厚、活体眼肌面积、估计瘦肉率等4个性状,进行了系统化的相关分析。结果表明:引种时NSR提供的遗传评估信息真实但用途不大。在达目标体重日龄上,NSR估计的育种值与自行估计值呈极显著负相关,意味着根据NSR的结果进行选择,结果可能背道而驰;其他性状均为极显著正相关。但是,因为选择指数由这些性状的育种值共同加权组合而成,1个性状的估计育种值存在问题,将导致整个指数不可靠,这意味着不能盲目进行跨国评估。造成这一结果的原因是遗传与环境的互作,但对此有必要做进一步分析。
- 张哲马裴裴肖倩孙浩张锁宇张向吉吉王起山潘玉春
- 关键词：引种杜洛克猪
