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高红
作品数:
2
被引量:10
H指数:1
供职机构:
浙江大学动物科学学院
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发文基金:
转基因生物新品种培育专项
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
生物学
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合作作者
王颖
浙江大学动物科学学院
彭静
浙江大学动物科学学院
沈一飞
浙江大学动物科学学院
徐宁迎
浙江大学动物科学学院
陈哲
浙江大学动物科学学院
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扬州大学学报...
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2014
1篇
2012
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不同物种FABP3基因编码区及蛋白生物信息学分析
被引量:10
2014年
利用生物信息学和比较基因组学方法对猪、小家鼠、褐家鼠、人、黑猩猩、牛、羊、原鸡、热带爪蟾、非洲爪蟾、斑马鱼、粗尾婴猴、东非狒狒、家猫、狗、野马、普通狨等21个物种的FABP3基因编码区及蛋白质进行分析,探究该基因在种内及种间的遗传分化关系,并全面了解不同物种FABP3蛋白的理化性质、结构、功能位点等。结果表明:21个物种47条编码区共检测到210个多态位点、28种单倍型,不同物种间的核苷酸歧义度、净遗传距离和遗传分化指数的变化范围很大,FABP3基因编码区在种内及种间均存在遗传变异。FABP3蛋白为酸性蛋白,具疏水性,较稳定,是一种定位于细胞质或细胞器(除内质网和线粒体)基质中的非分泌蛋白,其二级结构主要为伊折叠、α-螺旋和自由卷曲。野猪FABP3蛋白的主要结构为10条反平行伊折叠,且有一个重复的+1拓扑结构包绕着一个配基结合位点,属于Calycin结构超家族。其功能保守区为第7~24位氨基酸,推测其主要功能为结合脂肪酸等疏水性分子或有机阴离子。
高红
彭静
沈一飞
王颖
徐宁迎
关键词:
编码区
蛋白质
生物信息学分析
不同物种SIM1基因编码区生物信息学分析
本文应用生物信息学方法比较分析了人、猪、小家鼠、黑猩猩、非洲象等17个物种的SIM1基因编码区和蛋白质序列,并通过聚类分析了解该基因的进化情况。研究发现所选取的17个物种中,不存在物种内CDS和蛋白质序列长度差异。同时发...
高红
陈哲
王颖
徐宁迎
关键词:
蛋白质序列
系统发育树
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