房振峰
- 作品数:4 被引量:12H指数:2
- 供职机构:广西大学更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目国家高技术研究发展计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 江蓠总DNA提取及其PCR扩增方法的建立被引量:2
- 2010年
- 通过对CTAB法、SDS法和植物基因组提取试剂盒3种方法提取江蓠Gracilaria总DNA的得率比较,并将得到的总DNA用于限制性酶切和PCR扩增反应进行纯度检测,选择出适合江蓠属总DNA的提取方法,建立了江蓠RAPD、ISSR和ITS等遗传多样性和系统学研究的分子生物学方法。实验结果表明,SDS法和植物基因组提取试剂盒均适用于江蓠总DNA的提取;其中SDS法适用于新鲜和冰冻材料的总DNA提取,不仅得率和纯度高,且方法稳定性好,提取时间较短,在本实验中是江蓠总DNA提取的最佳方法。植物基因组提取试剂盒的得率低,但质量好,操作快速简便,适用于大量新鲜样本总DNA的提取。CTAB法由于相对耗时长且产物稳定性差,不推荐在江蓠中使用。
- 李文红房振峰
- 关键词:总DNA提取PCR扩增
- 低温处理凡纳滨对虾仔虾全长cDNA文库及troponin I基因三种拷贝的比较分析被引量:3
- 2013年
- 运用SMART技术成功构建了低温处理凡纳滨对虾仔虾的全长cDNA文库,文库的滴度为1.05×106pfu/mL,重组率94%,插入片段平均长度为1.0kb。随机选取116个克隆进行测序鉴定,获得111条有效序列,其unigene比例79.2%,涵盖了蛋白质合成、细胞骨架、核糖体结构、信号传导、代谢、细胞周期、能量产生与转换、转录、抗逆及防御、生物发育等10多种功能类别,其中与发育(10.34%)及抗逆及防御(10.34%)相关基因占20.68%。对测序获得的肌肉发育相关trioponinⅠ基因的3个不同拷贝进行了序列和进化比较分析。研究为发育和耐寒相关分子调控机制的探索创造了基础条件。
- 彭金霞房振峰韦嫔媛李咏梅蒋伟明陈秀荔赵永贞李文红陈晓汉
- 关键词:耐寒发育
- 低温胁迫凡纳滨对虾仔虾cDNA文库及2个功能基因的分析
- 本研究运用 SMART(Switching Mechanism At 5' end of RNA Transcript)技术成功构建了低温处理凡纳滨对虾仔虾的全长cDNA文库,文库的滴度为1.05×106 pfu/mL,...
- 房振峰
- 关键词:凡纳滨对虾CDNA文库剪接体金属硫蛋白
- 文献传递
- 凡纳滨对虾MT基因序列及其在卵巢发育和低温胁迫中的表达分析被引量:8
- 2013年
- 在低温处理仔虾全长cDNA文库的筛选测序中,获得凡纳滨对虾(Litopenaeus vannmei)金属硫蛋白基因全长cDNA序列,该序列含有425个碱基,包含177 bp开放阅读框,上游98 bp的非编码区及下游150 bp的非编码区,编码58个氨基酸,其中半胱氨酸含量丰富,富含金属硫蛋白典型的Cys-X(1-3)-Cys结构。多序列比对表明,凡纳滨对虾MT蛋白序列与美洲螯龙虾(Homarus americanus)MT蛋白序列具最高同源性72.4%。Real-time PCR结果表明,凡纳滨对虾MT基因在卵巢组织中呈优势表达,在不同发育期的卵巢中的表达量都很高,在低温处理凡纳滨对虾肝胰腺组织中上调表达。实验所得结果为研究凡纳滨对虾金属硫蛋白基因在生殖发育和低温应激中的功能提供了参考。
- 彭金霞房振峰韦嫔媛胡睿宇李咏梅蒋伟明陈秀荔赵永贞李文红陈晓汉
- 关键词:凡纳滨对虾金属硫蛋白