董然然
- 作品数：13 被引量：15H指数：2
- 供职机构：贵州大学动物科学学院更多>>
- 发文基金：教育部重点实验室开放基金国家自然科学基金贵州省科学技术基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程文化科学更多>>
- 用宏基因组分析南方鲇(Silurus meridionalis)肠道菌群及抗性基因组成
- 2024年
- 为了解人工养殖南方鲇(Silurus meridionalis)肠道菌群结构以及抗性基因的组成,采用宏基因组测序技术和生物信息学方法分析人工养殖南方鲇肠道菌群,分离验证了6株不同的细菌。结果显示,肠道菌群共注释到47个门、1425个属、4171个种,其中类志贺邻单胞菌(Plesimonas shigelloides)为优势种,3个样本中相对丰度分别为23.3%、23.4%和26.4%。KEGG分析显示,南方鲇肠道菌群的基因主要参与糖类代谢和氨基酸代谢过程。GO分析显示,南方鲇肠道菌群的基因主要参与代谢过程、细胞成分和催化反应。CARD数据库注释,鉴定出5151个抗性基因,注释到31种抗生素类型,其中有7个抗性基因未注释到具体抗生素。成功分离、培养和纯化了类志贺邻单胞菌、嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila,)、维氏气单胞菌(A.veroni)、温和气单胞菌(A.sobria)、地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)和乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)6种细菌。本研究结果为南方鲇肠道菌群结构提供初步分析,并统计了抗性基因携带情况,以期为南方鲇人工养殖病害防治提供参考数据。
- 王蓉蓉钱佳铭刘星雨董然然
- 关键词：南方鲇肠道菌群抗性基因
- 基于转录组测序筛选鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失菌的差异表达基因被引量：5
- 2019年
- 旨在鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株转录组测序中分析适应环境变化及细菌分泌通路,筛选相关基因。通过使用实时荧光定量PCR对鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株转录组测序结果进行验证,从而对鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株的细菌趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路进行深入分析,筛选相关的重要调控基因。结果显示:在细菌趋化性通路中筛选出yiaD、STM 3138、STM 3216和malE等4个共表达基因;在细菌分泌通路中筛选出spaP、invA、prgH、invE、spaS、invG和ssaV等7个共表达基因;在细菌双组分通路中筛选出ybfM、htrA、pagO、STM 3138、STM 3031、ttrB、hilD、pstS、STM 1530、hilA、pgtC、hydH、pocR、STM 3216、ttrR和fljB等16个共表达基因。在鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株的趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路中筛选出差异表达基因,hfq能够对这些基因进行调控,从而影响如运动性、毒力等相关作用,为沙门菌中的sRNA与hfq后续研究及沙门菌的防治奠定一定基础。
- 杨阳杨琦董然然董然然李晨刘丽娟文明周碧君文明
- 关键词：沙门菌
- 敲除小RNA gcvB后沙门菌的转录组分析被引量：2
- 2019年
- 为筛选与沙门菌小RNA gcvB相关的靶基因,采用高通量的转录组测序(RNA-seq)技术对野生型沙门菌和敲除小RNA gcvB沙门菌的mRNA进行对比分析,全面地预测GcvB的靶基因的数量与种类,通过GO和KEGG数据库对筛选基因进行比对注释,进一步分析筛选基因的主要功能及涉及的生物过程。并利用荧光定量PCR对部分差异表达基因进行验证。结果显示:差异表达基因共1 244个,其中基因表达上调678个,基因表达下调566个。GO富集分析显示,差异表达基因主要涉及氧化还原活性、铁离子结合、运动活性等分子功能,细菌鞭毛的细胞成分,细胞呼吸、钴胺素代谢过程和钴胺素生物合成过程等生物过程。KEGG数据库分析显示,差异表达基因主要参与细菌趋化性、卟啉和叶绿素代谢、不同环境中的微生物代谢、双组分系统、甲烷代谢等14个信号通路。对筛选出的10个差异表达基因进行荧光定量PCR验证,结果显示:差异表达基因相对表达量与RNA-seq测序结果基本一致。本研究为进一步探明小RNA gcvB与靶基因相互作用、小RNA的调控机制,以及沙门菌致病机制奠定了基础。
- 刘丽娟董然然董然然程振涛王开功温贵兰程振涛文明温贵兰
- 关键词：沙门菌转录组测序靶基因
- 贵州草海鲫鱼Spo11基因的克隆、生物信息学和表达分析被引量：2
- 2018年
- 【目的】探索环境内分泌干扰物壬基酚(Nonylphenol,NP)对贵州草海鲫鱼(Carassius auratus)Spo11基因表达的影响。【方法】通过PCR方法克隆实验鱼Spo11基因,利用生物信息学方法分析SPO11蛋白的氨基酸序列、理化性质和结构特点;并设置1个对照组和低、中、高共3个不同剂量NP处理组,用NP质量浓度分别为0,25,50和100μg·L^(-1)的水体浸浴实验鱼28d后,检测各组实验鱼Spo11基因的表达情况。【结果】Spo11基因cDNA序列长度为1 471bp(GenBank登录号:MF66470),包括66bp的5′非翻译区、编码383个氨基酸的1 152bp的开放阅读框和253bp的3′非翻译区。预测SPO11蛋白质相对分子质量为43.23kDa,等电点IP为6.89,主要由亮氨酸、丝氨酸和缬氨酸组成。该蛋白是含有信号肽的不稳性亲水蛋白,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。与对照组实验鱼的Spo11基因相对表达量相比,中剂量和高剂量的NP处理组实验鱼Spo11基因相对表达量均有所升高,与前者的差异均具有统计学意义(p<0.05)。【结论】环境内分泌干扰物NP可以影响贵州草海鲫鱼Spo11基因的表达。
- 董然然陈修云王岗屹吕昌乾
- 关键词：基因克隆生物信息学壬基酚
- 活跃渔业专业英语课堂教学气氛的探索与实践
- 2018年
- 《渔业专业英语》是水产专业一门重要的工具课程,可以帮助学生更全面的了解专业知识。由于这门课程对专业知识和英语水平的要求较高,笔者教学过程中发现,在传统的以讲授为主的教学中,学生兴趣不太浓厚、参与的积极性不高,课堂气氛沉闷。因此,笔者便对如何活跃课堂教学气氛进行了探索。实践表明:多样的教学内容、灵活的教学方法和多元的考核方式可以活跃课堂教学气氛,明显提高教学效果。
- 董然然杨琦
- 关键词：教学气氛教学效果
- 贵州水城区2019—2021年羊口蹄疫免疫抗体监测及分析
- 2024年
- 为了解水城区羊口蹄疫的免疫保护水平,该文针对2019—2021年水城区散养农户和规模化场的羊抽样进行口蹄疫疫病免疫抗体检测,3年共检测口蹄疫953份,并比较不同年份、不同养殖方式、不同地区的免疫抗体水平。结果显示,2019—2021年水城区羊口蹄疫免疫抗体总体合格率保持在70%以上,散养户羊群抗体水平普遍低于规模化羊场。结果表明,当地近年羊口蹄疫疫苗免疫效果较好,但仍然存在个别养殖场或散养户的抗体合格率未达标,应当持续加强免疫和监测,确保全区羊群处于较高的免疫保护水平。
- 何菊黄二素罗元宇何延华龚兴秀董然然
- 关键词：口蹄疫抗体监测
- 雷帕霉素对稀有鮈鲫卵子发生的影响被引量：1
- 2021年
- 【目的】为鱼类生殖生理学和繁殖生物学研究提供参考。【方法】以稀有鮈鲫为试验动物,采用mTOR通路抑制剂雷帕霉素处理3月龄雌性个体至4月龄,正常饲养至5月龄,以同时注射等量不含雷帕霉素的稀释剂和二甲基亚砜(DMSO)为对照,测定不同阶段性腺指数(GSI)和卵巢发育情况,Real-time PCR检测卵子发生相关基因的表达情况。【结果】3、4、5月龄对照组和3月龄处理组卵巢具有Ⅳ时相卵母细胞,4月龄处理组只具有Ⅰ、Ⅱ时相卵母细胞,5月龄处理组卵巢中观察到Ⅲ时相卵母细胞;处理组GSI显著低于对照组;处理组中foxl2、fshr、cyp11a1、cyp19a1a和bmp15表达显著低于对照组,figlα在处理组中表达显著高于对照组。【结论】雷帕霉素处理导致稀有鮈鲫卵母细胞发育停滞在Ⅱ时相,推测mTOR通路可能通过调节类固醇发生和TGFβ信号通路促进卵母细胞的发育和成熟。
- 钱佳铭张显波董然然曾圣李建光陈飞雄
- 关键词：雷帕霉素卵子发生抑制剂基因表达
- 壬基酚对异育银鲫(Carassius auratus gibelio)生长及脂质代谢的影响
- 2021年
- 为探究壬基酚(nonylphenol,NP)对异育银鲫(Carassius auratus gibelio)生长及脂质代谢的影响,将体重为(33.43±3.27)g的异育银鲫,分别浸浴在质量浓度为25、50和100μg/L的NP处理56 d后,测定异育银鲫生长性能及脂质代谢指标。结果显示∶(1)处理组异育银鲫末均重和肥满度(condition factor,CF)均显著降低(P<0.05),NP质量浓度为100μg/L时,异育银鲫质量增加率(weight gain rate,WGR)、特定生长率(specific growth rate,SGR)和存活率(survival rate,SR)均显著降低(P<0.05),而50和100μg/L组的肝体指数(hepatosomatic index,HSI)和脏体指数(viscerasomatic index,VSI)显著增大(P<0.05);100μg/L组异育银鲫的肌肉粗脂肪(ether extract,EE)显著降低(P<0.05),而肝脏EE显著升高(P<0.05),其余各组差异不显著。(2)NP质量浓度为100μg/L时,异育银鲫血清甘油三酯(triglyceride,TG)明显降低而肝脏TG显著增高(P<0.05),血清胆固醇(cholesterol,CHOL)显著增高而肝脏CHOL明显降低(P<0.05)。(3)NP质量浓度为50和100μg/L时,脂肪酶(lipase,LPS)、脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)活性显著降低(P<0.05),lpl基因的表达量显著升高(P<0.05),而NP质量浓度为50μg/L时,肝脂酶(hepatic lipase,HL)活性明显增高(P<0.05),hl基因的表达量显著降低(P<0.05)。可见,当水体中NP浓度大于100μg/L时,异育银鲫生长受阻、SR降低,有关脂质代谢酶的活性降低,导致脂质代谢紊乱,从而对其生命活动带来危害。本研究结果可为研究NP对异育银鲫的毒性作用及脂肪肝的分子机制提供基础资料。
- 刘枝华陈修云董然然
- 关键词：壬基酚异育银鲫脂质代谢
- 稀有[鱼句]鲫Foxo3a、Foxo3b基因克隆和表达分析被引量：1
- 2023年
- 利用RACE技术自稀有[鱼句]鲫的卵巢中克隆叉头蛋白O3a(Foxo3a)、叉头蛋白O3b(Foxo3b)基因的全长cDNA序列,采用RT-PCR、qRT-PCR和原位杂交法检测其组织分布、时序表达、细胞定位和雷帕霉素处理后的表达。结果显示,Foxo3a基因全长cDNA序列为2562bp,包括242bp的5′端非编码区、367bp的3′端非编码区、1953bp的开放阅读框,编码650个氨基酸;Foxo3b基因全长cDNA序列为2804bp,包括470bp的5′端非编码区、375bp的3′端非编码区、1959bp的开放阅读框,编码652个氨基酸。Foxo3a基因只在脑和卵巢中表达,在其他组织中不表达;Foxo3b基因在所检测的组织中均有表达,在脑和卵巢中的表达量较高。随着卵巢的发育,Foxo3a基因表达量呈逐渐升高的趋势,Foxo3b基因表达量未出现显著变化。原位杂交结果显示,Foxo3a、Foxo3b基因定位于卵巢Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ时相的生殖细胞和滤泡细胞中。雷帕霉素处理影响了卵巢中Foxo3a基因的表达,对Foxo3b基因的表达无显著影响。试验结果表明,Foxo3a和Foxo3b基因可能在稀有[鱼句]鲫卵子发生中发挥一定的作用。
- 钱佳铭闵倩雯董然然曾圣张显波
- 关键词：基因克隆基因表达
- 贵州大鲵原生境的水质指标测定被引量：3
- 2016年
- 为大鲵的养殖及其水源选择提供参考,对贵州省黔南州斗蓬山大鲵原繁殖生境的水样进行水质测定分析。结果表明:贵州大鲵原生境水样呈弱碱性(pH 7.21),总硬度(以CaCO_3计)为134.38mg/L、总碱量(以CaCO_3计)为104.99mg/L,Ca^(2+)、Mg^(2+)分别为42.96mg/L和6.58mg/L,Cl^-、SO_4^(2-)和H_2PO_4^-含量分别为0.90mg/L、29.43mg/L和0.00mg/L,NH_4^+为0.00mg/L。依据GB 8537-2008饮用天然矿泉水国家标准,贵州大鲵原生境水样的限量指标As、Cd、Pb、溴酸盐(以Br-计)的含量均为0.000mg/L,Hg含量<0.000 01mg/L,硝酸盐(以NO_3^-计)、氟化物(以F-计)、化学耗氧量(以O_2计)分别为3.52mg/L、0.12mg/L和0.00mg/L,均达到国家指标;界限指标Zn^(2+)、H_2SiO_3、溶解性总固体分别为0.002 mg/L、6.61mg/L和212.66mg/L,低于国家指标;污染指标亚硝酸盐(以NO_2^-计)含量为0.017mg/L,色度≤5°、浊度为0.06°、煮沸前后无异臭异味、无肉眼可见异物。贵州省黔南州斗蓬山大鲵原繁殖生境的水样优于饮用天然矿泉水国家标准。
- 吴学祥董然然唐黎聂福顺
- 关键词：水质
