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郑俊峰

作品数：1 被引量：0H指数：0
供职机构：大连海洋大学更多>>
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相关领域：医药卫生更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇动力学
  • 1篇抑制剂
  • 1篇制剂
  • 1篇结合肽
  • 1篇分子
  • 1篇分子动力学
  • 1篇GB
  • 1篇MM-PBS...

机构

  • 1篇大连海洋大学

作者

  • 1篇张峰
  • 1篇郑俊峰
  • 1篇马志
  • 1篇杨威

传媒

  • 1篇大连海洋大学...

年份

  • 1篇2013
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
补体蛋白C3c与抑制剂Compstatin的结合自由能计算
2013年
采用分子动力学模拟取样,运用MM-PBSA方法计算了人类C3c-Compstatin复合物的结合自由能。通过能量分解方法探究了人类补体蛋白C3c上抑制剂结合域MG4～MG5(巨球蛋白区域)上的主要残基与配体Compstatin纤维蛋白之间的相互作用和识别。结果表明:C3c与补体抑制剂Compstatin的理论结合自由能(-8.06 kcal/mol)与试验值(-6.72 kcal/mol)吻合较好,分子内能总和(-177.24 kcal/mol)对补体抵制剂的结合贡献最大,其次为真空静电作用能(-108.74 kcal/mol)和范德华作用能(-68.51kcal/mol)。作为对结晶试验的补充,进行了C3c蛋白和小分子抑制剂之间结合的动态过程以及在两者结合的影响下蛋白形态变化的分子动力学模拟,结果发现C3c上的残基ARG459、ASP491、MET457和Compsta-tin上的残基TRP7、TRP4、HIS10为结合自由能作出了主要贡献。该结果对进一步研究C3补体抑制剂的机制提供了结构方面的信息。
杨威张峰马志郑俊峰
关键词：分子动力学MM-PBSA结合肽
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