李靖
- 作品数:2 被引量:2H指数:1
- 供职机构:华为技术有限公司更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术更多>>
- 基于功能相似性预测疾病基因
- 2012年
- 如何从连锁定位区域中的众多基因中有效选取疾病候选基因是疾病诊断治疗和预防的基础。基于基因功能注释信息,设计和实现了一种新的基于基因功能相似性的疾病基因预测工具DGP,分析候选基因和已知疾病基因的GO之间的相似性,对候选疾病基因进行打分排序。从OMIM数据库中提取一个包含1 045个已知疾病基因、涉及305种疾病的数据集来测试DGP的性能,其中56.7%的疾病基因在候选基因中排名前5%,68.5%的疾病基因位于前10%,结果显示DGP具有很高的准确率,能够从某个染色体区间中有效地识别出疾病基因。
- 袁芳李靖
- 关键词:候选基因基因本体
- 基于蛋白质相互作用网络预测癌症致病基因被引量:2
- 2012年
- 基于现有的蛋白质相互作用数据,提出利用邻居曲线方法来分析癌症基因产物在蛋白质相互作用网络中的中心度和聚集度,据此获取与癌症高度相关的候选致病基因。癌症基因大规模测试显示,有26%的目标基因在候选基因中排名前5%,90%的目标基因在候选基因中排名前50%,该方法能有效地识别癌症致病基因。
- 袁芳李靖周艳红
- 关键词:疾病基因癌症