- 中缅边境及泰国东南地区恶性疟原虫K13基因侧翼微卫星多态性研究被引量:2
- 2017年
- 目的研究中缅边境拉咱地区和泰国东南Srisaket、Trat和Ranong等3个地区恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)K13基因侧翼微卫星的多态性。方法取前期经基因型研究的恶性疟原虫样品42份,其中中缅边境拉咱地区22份(K13基因R539T突变型和野生型各11份),泰国3个地区20份(K13基因R539T突变型9份和野生型11份),对上述样品K13基因上游31 900、6 360、150 bp和下游1 700、11 000、31 500 bp共6个位点的微卫星片段进行PCR扩增,PCR产物经毛细管电泳仪检测片段长度,并采用Bio Calculator软件进行数据分析,Gen ALEx软件计算等位基因频率和期望杂合度(He)。结果中缅边境拉咱地区和泰国3个地区恶性疟原虫虫株K13基因两侧的6个微卫星位点共检测到46个等位基因,在上游6 360 bp位点的等位基因长度分别集中在286和278 bp,等位基因频率为73%和67%。上游31 900 bp位点等位基因长度分别集中在211和205 bp,等位基因频率为55%和44%。上游150 bp及下游1 700 bp位点等位基因长度主要集中在195和209 bp,其他两个位点未出现集中分布的情况。中缅边境拉咱地区虫株的单倍体型为H1至H4型,泰国3个地区虫株除了2株H2单体型外,其余均为H5和H6型。42份样品的6个微卫星位点的平均He分别为0.49±0.23、0.42±0.33和0.72±0.12、0.67±0.11。R539T突变的虫株在毗邻K13基因的微卫星位点处He明显降低,在上游150 bp处分别为0.17和0,在下游1 700 bp处分别为0.3和0。结论中缅边境拉咱地区及泰国3个地区K13基因为R539T突变型的恶性疟原虫虫株均受到青蒿素选择压力,等位基因型在上游6 360和31 900 bp两个位点上具有明显的差异。
- 陈学迪叶润潘卫庆
- 关键词:恶性疟原虫微卫星
- 疟原虫溯源技术研究进展被引量:2
- 2017年
- 自我国印发消除疟疾行动计划以来,对疟原虫溯源技术的需求日益迫切,该技术同样可以应用于药物抗性虫株起源的追溯及传播路径的监测,因此,选择简单、特异性的分子标记物用于疟原虫的溯源显得尤为重要。本文从疟原虫染色体的单核苷酸多态性、疟原虫微卫星片段长度多态性、疟原虫线粒体及顶质体的单核苷酸多态性等三方面对近年来应用于疟原虫溯源的方法及选择的分子标记进行综述。
- 陈学迪叶润潘卫庆
- 关键词:疟疾抗药性