刘云卿
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 供职机构：河南师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：河南省高校青年骨干教师资助项目河南省高校科技创新团队支持计划河南省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于弹性网络的大鼠肝再生关键基因选择被引量：2
- 2013年
- 针对大鼠肝再生基因表达谱芯片数据挖掘问题,通过把肝再生过程划分为8个不同时间的子过程,将其转化为二分类问题,进而利用弹性网络对每1个子过程分别进行分类和相关基因选择.此外,以细胞增殖为主线,分析了所选择基因间的通路关系,验证了所选基因的生物合理性.
- 王小玉陈留院刘云卿杨云李钧涛徐存拴
- 关键词：大鼠肝再生基因选择
- 同类提取法结合序列向前法预测大鼠肝再生的关键基因被引量：1
- 2013年
- 从生物高通量检测数据中挖掘关键基因/蛋白是生物信息学的重要研究内容.用大鼠基因组表达谱芯片Rat Genome 230 2.0检测大鼠肝再生中肝细胞的基因表达丰度和计算它们与对照的比值(ratio值),用F检验发现,Ccne1、Eg f、Met等8419个基因与大鼠肝再生相关.用过滤法从中筛选出3202个差异基因,用同类提取法从差异基因筛选出1000个特征基因.取前100个特征基因作为初选基因,进一步用序列向前法计算发现,Ccnd1、Grin2a、Spsb4等7个基因满足肝再生候选关键基因的条件.再用同类提取法分析发现,上述7个基因中,Ccnd1和Agtr1的关联度≥100,且文献报道与肝再生相关,当属关键基因.用机器学习法检验关键基因的正确性发现,同类提取法结合序列向前法预测的关键基因正确率达97%以上.因此,用该方法预测关键基因切实可行,值得推广应用.
- 刘云卿黄荧周运李钧涛徐存拴
- 关键词：大鼠肝再生关键基因
