梅娟 作品数:11 被引量:49 H指数:4 供职机构: 江南大学通信与控制工程学院电气自动化研究所 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家自然科学基金 江苏省博士后科研资助计划项目 更多>> 相关领域: 自动化与计算机技术 生物学 电气工程 更多>>
复杂生物网络自动画图算法分析 被引量:1 2010年 介绍适应分子网络建模和信息系统需求的自动画图算法的研究成果。在分析代谢途径自动布局、力导向布局和基于网格的布局等3类具有代表性的自动画图算法的基础上,探究其各自的原理、内在联系、存在的优缺点以及亟待解决的问题,为应用网络可视化手段分析和解决具体生物问题提供参考和线索。 何胜 梅娟 王正祥 李炜疆利用PSO对上证指数ARCH模型的实证研究 2006年 针对ARCH模型传统估计方法的不足,提出了利用微粒群算法及其改进的算法快速精确的估计ARCH模型的参数,最后利用微粒群算法实证建立了上证指数收益的ARCH模型,并且对以后的情况进行了预测。 梅娟 孙俊 须文波关键词:ARCH模型 PSO算法 异方差 一种结合云模型和QPSO优化的RBFNN及其应用 被引量:1 2013年 提出一种基于云变异操作的量子行为粒子群优化算法(QPSO-CM)的径向基函数神经网络(RBFNN)学习方法。首先QPSO算法利用云模型加入云变异操作,增加算法多样性;然后利用减聚类算法确定RBF神经网络径向基层的单元数;最后用QPSO-CM算法对RBF神经网络的参数(中心与宽度)和连接权重进行优化。将此算法用于齿轮的故障诊断,仿真诊断结果表明此方法是有效的,具有较好的分类效果,诊断精度高、收敛速度快。 赵吉 梅娟 傅毅关键词:云模型 量子行为粒子群算法 径向基函数神经网络 故障诊断 基于粒子群算法的改进DV-Hop定位算法 被引量:9 2012年 针对无线传感器网络(WSNs)节点定位问题中DV-Hop算法的不足,提出利用粒子群优化算法对改进DV-Hop得到的估算位置校正。这种方法将定位问题看成一个多维优化问题,并且不需要任何额外硬件设备,也不会增加通信量。最后将仿真实验结果与改进DV-Hop算法进行比较,表明基于PSO算法优化的改进DV-Hop定位算法在优化性能上有所改进,有效提高了节点定位精度,证明该方法的有效性。 赵吉 傅毅 梅娟关键词:粒子群优化算法 基于QPSO-LMK的自相似性网络流量预测 2007年 现在对高性能、高效性流量测量的研究表明网络流量呈现统计上的自相似性。因此,网络预测在网络管理中占据重要地位。使用QPSO(quantum-behaved particle swarm optimization)对预测自相似性网络流量的最小均值峰度(LMK)方法进行优化,能够获得较小的信噪比SNR-1(signal to noise ratio)。通过对真实网络流量的仿真实验,表明该方法能比LMK(最小均值峰度)算法更精确的预测网络流量。 毛蓝 刘渊 梅娟关键词:自相似性 QPSO算法 信噪比 基于图聚类的蛋白质相互作用网络功能模块探测 被引量:3 2011年 作者采用了基于模块性的图聚类算法来探测蛋白质相互作用网络中的集团,在具有2 617个节点11855个相互作用的酵母蛋白质相互作用网络中探测出177个集团,同时采用慕尼黑信息中心(Munich Information Center,MIPS)的层次功能注释对其进行了注释,并且验证得到的集团的确是内部连接紧密的子图。 梅娟 何胜 李炜疆关键词:蛋白质相互作用网络 模块性 聚类 功能模块 复杂生物网络分析的图聚类方法研究进展 被引量:6 2008年 基因组学和高通量技术提供了大量生命系统组成元件(如蛋白质)之间相互关系的数据,由这些关系数据构成的复杂生物网络蕴含着丰富的生命系统运行机制的知识,挖掘这些隐蔽的知识成为当前系统生物学的主要任务之一。作为知识发现重要手段的图聚类方法,在复杂生物网络分析上受到了普遍关注,在远同源性探测、蛋白质功能预测、代谢途径发现等方面取得了令人瞩目的结果。同时也注意到,由于生命系统的高度复杂性,其他领域中卓有成效的方法往往在复杂生物网络分析中遇到困难。评述了近年来图聚类算法在复杂生物网络分析中的进展,简要分析了复杂生物网络研究的图聚类途径所面临的主要问题。 梅娟 王正祥 石贵阳 李炜疆关键词:蛋白质相互作用网络 代谢网络 代谢网络自动绘制的快速网格布局算法 被引量:4 2008年 描述众多代谢物之间的拓扑关系的代谢网络,是抽象的高维数据。为了帮助人们分析这些复杂的数据,需要开发高效的可视化算法。近年来日益引起关注的网格布局算法在代谢网络自动绘图中显示了很好的特性,其面临的一个主要问题是如何有效降低计算量以满足快速、准实时网络绘图的需求。作者提出了一种快速网格布局算法,采用邻域试探和扰动再优化的全局搜索策略,能够数秒内产生高质量的典型代谢网络布局,适用于更广泛的代谢网络可视化分析应用。 何胜 梅娟 石贵阳 王正祥 李炜疆关键词:代谢网络 可视化 粒子群算法在PID控制器参数整定中的研究与应用 被引量:20 2012年 针对自动化控制系统中PID控制器参数整定困难的问题,提出了基于粒子群算法的PID控制器的设计方法,给出了具体的实验架构。采用系统参数鉴定的方式得到直流伺服发电机的传递函数,并利用粒子群算法搜寻PID参数。实验采用MATLAB仿真证明了该方法的可行性和优越性。所得到模拟结果跟遗传算法搜索PID参数的结果做比较,结果显示用粒子群算法调整PID参数所得到的运算时间比用遗传算法的运算时间要短。 唐玉兰 徐明亮 梅娟 陈建慧关键词:遗传算法 PID控制 参数整定 粒子群算法 基于网络模块性的蛋白质序列聚类 被引量:5 2010年 蛋白质的远同源性探测是结构基因组学和功能基因组学的主要研究任务之一。一些具有一定相似结构和功能、但序列相似性却较低的蛋白质组成蛋白质超家族,则远同源性探测问题等价于对蛋白质超家族的识别问题。作者提出了一种基于模块性的聚类算法ModuleFind,该方法通过最大化蛋白质网络的模块性来寻找具有较强集团结构的划分。在蛋白质结构分类数据库(SCOP)超家族层次上进行的实验表明,该方法得到的聚类结果更接近分类基准,且具有较高的F-测度值。 梅娟 何胜 王正祥 石贵阳 李炜疆关键词:蛋白质网络 模块性 聚类